Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 73 Aligned Residues 379 % Identity 24% Template c1hvxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-amylase; PDBTitle: bacillus stearothermophilus alpha-amylase Resolution 2.00 Å

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		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.										.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	L	W	T	K	V	A	N	E	A	N	N	L	S	S	L	G	I	T	A	L	W	L	P	P	A	Y	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	R	S	D	V	G	Y	G	V	Y	D	L	Y	D	L	G	E	F	N	Q	K	G	A	V	R	T	K	Y	G	T	K	A	Q	Y	L	Q
Template Known Secondary structure		S																T	T										S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T			S	S	S				T	T		S	S		S		B	T	T	B	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.														50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.			.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	.	.	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	Q	A	A	H	A	A	G	M	Q	V	Y	A	D	V	V	F	D	H	K	G	G	A	D	G	T	E	W	V	D	A	V	E	V	N	P	S	D	R	N	Q	E	I	S	G	T	Y	Q	I	Q	A	W	T	K	F	D	F	P	G	R	G	N	T	Y	S	S	F	K	W	R	W	Y	H	F	D	G	V	D	W
Template Known Secondary structure									T	T										S						S												T	T							S											B			T	T	T	T	T	S	S					B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.					.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.
Query Sequence		D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	.	.	.	.	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V
Query Conservation																.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	S	R	K	L	S	R	I	Y	K	F	R	G	I	G	K	A	W	D	W	E	V	D	T	E	N	G	N	Y	D	Y	L	M	Y	A	D	L	D	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	E	V	V	T	E	L	K	S	W	G	K	W	Y	V
Template Known Secondary structure			T	T	T	T									S	T	T					S	S				T	T	S						S	S					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.				.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.
Query Sequence		R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	.	.	.	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D
Query Conservation																																																																				.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	T	N	I	D	G	F	R	L	D	A	V	K	H	I	K	F	S	F	F	P	D	W	L	S	Y	V	R	S	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	P	L	F	T	V	G	E	Y	W	S	Y	D	I	N	K	L	H	N	Y	I	M	K	T	N	G	T	M	S	L	F	D	A	P
Template Known Secondary structure												T	T	G	G	G	S		T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S												T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.														.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		527	.	.	530	.	.	.	.	.			.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.										.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S
Query Conservation											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	H	N	K	F	Y	T	A	S	K	S	G	G	T	F	D	M	R	T	L	M	T	N	T	L	M	K	D	Q	P	T	L	A	V	T	F	V	D	N	H	D	T	E	P	G	Q	A	L	Q	S	W	V	D	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	F	I	L	T	R	Q	E	G	Y	P	C	V	F	Y	G	D	Y	Y
Template Known Secondary structure												T	T	T		S		G	G	G	T	T	T	T							G	G	G					S			T	T	T	S	T	T	S	T	T						T	T	T											S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.		.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Predicted Secondary structure																																																										.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K	Q	T	T	L	.	L	L	K	Q	G	Y	G	F	V	R	E	H	G	D	D	K	.	.	.	.	.	V	L
Query Conservation																																																										.																	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.											.																	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Sequence		G	I	P	Q	Y	N	I	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	S	K	I	D	P	L	L	I	A	R	R	.	.	.	D	Y	A	Y	G	T	Q	H	D	Y	L	D	H	S	D	I	I	G	W	T	R	E	G	V	T	E	K	P	G	S	G	L	A	A
Template Known Secondary structure			B	G	G	G	T	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.		T			S								S	S	S									B	T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.																						380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.				.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
		670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	W	A	G	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	I	T	D	G	P	G
Template Known Secondary structure					S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		427	.	.	430	.	.	.