Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 69 Aligned Residues 368 % Identity 20% Template c1e40A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-amylase; PDBTitle: tris/maltotriose complex of chimaeric amylase from b.2 amyloliquefaciens and b. licheniformis at 2.2a Resolution 2.2 Å

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		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.										.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Q	H	W	K	R	L	Q	N	D	A	E	H	L	S	D	I	G	I	T	A	V	W	I	P	P	A	Y	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Q	S	D	N	G	Y	G	P	Y	D	L	Y	D	L	G	E	F	Q	Q	K	G	T	V	R	T	K	Y	G	T	K	S	E	L	Q	D
Template Known Secondary structure		S																	T										S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T			S	S	S				T	T		S	S		S		B	T	T	B	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.														.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	G	S	L	H	S	R	N	V	Q	V	Y	G	D	V	V	L	N	H	K	A	G	A	D	A	T	E	D	V	T	A	V	E	V	N	P	A	N	R	N	Q	E	T	S	E	E	Y	Q	I	K	A	W	T	D	F	R	F	P	G	R	G	N	T	Y	S	D	F	K	W	H	W	Y	H	F	D	G	A	D	W
Template Known Secondary structure								T	T	T										S						S												T	T							S											B			T	T	T	T	T	S	S					B		G	G	G					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	S	R	K	I	S	R	I	F	K	F	R	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	A	W	D	W	E	V	S	S	E	N	G	N	Y	D	Y	L	M	Y	A	D	V	D	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P
Template Known Secondary structure		B	T	T	T	T	B								S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T					S	S	S			T	T	S						S	S					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.															.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.																								.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	V	A	E	T	K	K	W	G	I	W	Y	A	N	E	L	S	L	D	G	F	R	I	D	A	A	K	H	I	K	F	S	F	L	R	D	W	V	Q	A	V	R	Q	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	E	M	F	T	V	A	E	Y	W	Q	N	N	A	G	K	L	E	N	Y
Template Known Secondary structure																		T	T							T	T	G	G	G	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S											S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.														.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
					516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.			.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.										570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																					.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																					.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L
Query Conservation		.	.	.																					.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																					.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	K	T	S	F	N	Q	S	V	F	D	V	P	L	H	F	N	L	Q	A	A	S	S	Q	G	G	G	Y	D	M	R	K	L	L	N	G	T	V	V	S	K	H	P	L	K	S	V	T	F	V	D	N	H	D	T	Q	P	G	Q	S	L	E	S	T	V	Q	T	W	F	K	P	L	A	Y	A	F	I	L	T
Template Known Secondary structure					T	T	T		S																	S	T	T		S		G	G	G	T	T	T	T							G	G	G					S			T	T	T	S	T	T	S	T	T						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.		.	.	.	.	.	.	.	.	660
Predicted Secondary structure																																																																								.
Query SS confidence																																																																								.
Query Sequence		L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K	Q	T	T	L	.	L	L	K	Q	G	Y	G	F	V
Query Conservation																																																																								.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.							.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Sequence		R	E	S	G	Y	P	Q	V	F	Y	G	D	M	Y	G	T	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	Q	R	E	I	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	H	K	I	E	P	I	L	K	A	R	K	Q	Y	A	Y	.	.	.	G	A	Q	H	D	Y	F	D	H	H	D	I	V	G	W	T
Template Known Secondary structure		S	S	S	S															.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.															T			.	.	.	S								S	S	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.										.	.	.	.	.	.	.	.										380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.				.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
		661	.	.	.	.	.	.						.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	H	G	D	D	K	.	.	.	.	.	V	L	V	V	W	A	G	Q	Q
Query Conservation									.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	G	D	S	S	V	A	N	S	G	L	A	A	L	I	T	D	G	P	G
Template Known Secondary structure						T	T	S	T	T									S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.