Job Description P00722 Confidence 98.17% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 107 Aligned Residues 247 % Identity 13% Template d1ug6a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 0.99

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		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.						.	.	.	.													.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.		.	430	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Query Sequence		Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	S	H	.	.	.	.	.	Y	P	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	.	D	D	P	R
Query Conservation																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	Y	E	E	D	I	A	L	M	Q	S	L	G	V	R	A	Y	R	F	S	V	A	W	P	R	I	L	P	E	G	R	G	R	I	N	P	K	G	L	A	F	Y	D	R	L	V	D	R	L	L	A	S	G	I	T	P	F	L	T	L	Y	H	W	D	L	P	L	A	L	E	E	R	G	G	W	R	S	R	E
Template Known Secondary structure															T														S	T	T	S	S	S																				T	T									S	S			B					T	T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	H	G	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.
Template Sequence		T	A	F	A	F	A	E	Y	A	E	A	V	A	R	A	L	A	D	R	.	.	V	P	F	F	A	T	L	N	E	P	W	C	S	A	F	L	G	H	W	T	G	E	H	A	P	G	L	R	N	L	E	A	A	L	R	A	A	H	H	L	L	L	G	H	G	L	A	V	E	A	L	R	A	A	G	A	R	R	V
Template Known Secondary structure																		T	T	T	.	.																			T	S		S	S	T	T																													T	T		S
Template Predicted Secondary structure																					.	.
Template SS confidence
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Q	Y	E	G	G	G	A	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	T	D	I	I	C	P	M	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	V	L	N	F	A	P	A	Y	G	E	D	P	E	A	V	D	V	A	D	R	Y	H	N	R	F	F	L	D	P	I	L	G	K	G	Y	P	E	S	P	F	R	D	P	P	P	V	P	I	L	S	R	D	L	E	L	V	A	R	P	L	D	F	L	G	V	N	Y	Y	A	P	V	R	V	A	P	G	T	G
Template Known Secondary structure													S													T								T	T	S		S		S			S	S	S								T	T						T				S							S										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		516	.	.																						.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.				.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Query Sequence		V	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	.	.	.	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	P	V	R	Y	L	P	P	E	G	P	A	T	A	M	G	W	E	V	Y	P	E	G	L	Y	H	L	L	K	R	L	G	R	E	V	P	W	P	L	Y	V	T	E	N	G	A	A	Y	P	D	L	W	T	G	E	A	V	V	E	D	P	E	R	V	A	Y	L	E	A	H	V	E	.	.	.	.	.	.	A
Template Known Secondary structure		S	S								S	S		B		T	T			B																		S	S																S	S		S	S	B															.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.							.
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.						.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.
Query Sequence		V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	.	.	.	.	.	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q
Query Conservation																																										.	.	.	.	.
Alig confidence																																.										.	.	.	.	.
Template Conservation																																.
Template Sequence		A	L	R	A	R	E	E	G	V	D	L	R	G	Y	F	V	W	S	L	M	D	N	F	E	W	A	F	G	Y	T	.	R	R	F	G	L	Y	Y	V	D	F	P	S	Q	R	R	I	P	K	R	S	A	L	W	Y	R	E	R	I	A
Template Known Secondary structure									T											S	B					G	G	G	G	G	G	.	S				S					T	T	T	T					B
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.		.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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