Job Description P00722 Confidence 97.73% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 115 Aligned Residues 247 % Identity 17% Template d1e4ia_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.00

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.						.	.	.													.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.		.	430	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query Sequence		Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	S	H	.	.	.	.	.	Y	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	.	D	D	P	R
Query Conservation																								.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Alig confidence																								.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation
Template Sequence		H	R	Y	E	E	D	I	R	L	M	K	E	L	G	I	R	T	Y	R	F	S	V	S	W	P	R	I	F	P	N	G	D	G	E	V	N	Q	K	G	L	D	Y	Y	H	R	V	V	D	L	L	N	D	N	G	I	E	P	F	C	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	A	L	Q	D	A	G	G	W	G	N	R	R
Template Known Secondary structure															T		S												S	T	T	S	S	S																				T	T									S	S			B						T	T	T	T	S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.		.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Query Sequence		W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	H	G	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	.	R
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Alig confidence																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																					.	.
Template Sequence		T	I	Q	A	F	V	Q	F	A	E	T	M	F	R	E	F	H	G	K	.	.	I	Q	H	W	L	T	F	N	E	P	W	C	I	A	F	L	S	N	M	L	G	V	H	A	P	G	L	T	N	L	Q	T	A	I	D	V	G	H	H	L	L	V	A	H	G	L	S	V	R	R	F	R	E	L	G	T	S	G	Q
Template Known Secondary structure																	T	B	T	T	.	.	B																		T	S			S	T	T																														T		S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	Q	Y	E	G	G	G	A	D	T	T	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	I	C	P	M	Y	A
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	I	A	P	N	V	S	W	A	V	P	Y	S	T	S	E	E	D	K	A	A	C	A	R	T	I	S	L	H	S	D	W	F	L	Q	P	I	Y	Q	G	S	Y	P	Q	F	L	V	D	W	F	A	E	Q	G	A	T	V	P	I	Q	D	G	D	M	D	I	I	G	E	P	I	D	M	I	G	I	N	Y	Y
Template Known Secondary structure							B							S	S	S																T										S	S												T	T							T	T						T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.			.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query Sequence		R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	.	.	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	M	S	V	N	R	F	N	P	E	A	G	F	L	Q	S	E	E	I	N	M	G	L	P	V	T	D	I	G	W	P	V	E	S	R	G	L	Y	E	V	L	H	Y	L	Q	K	Y	G	N	I	D	I	Y	I	T	E	N	G	A	C	I	N	D	E	V	V	N	G	K	V	Q	D	D	R	R	I	S	Y	M	Q
Template Known Secondary structure										T	T	S	T	T	T	T										B		T	T	S		B			T										G	G	G	G		S																	B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.						.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C	M	N	G	L	V	.	.	.	.	.	F	A	D	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.																																.							.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.																																.
Template Sequence		Q	H	L	V	.	.	.	.	.	.	Q	V	H	R	T	I	H	D	G	L	H	V	K	G	Y	M	A	W	S	L	L	D	N	F	E	W	A	E	G	Y	N	.	M	R	F	G	M	I	H	V	D	F	R	T	Q	V	R	T	P	K	Q	S	Y	Y	W	Y	R	N	V	V	S
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.								T	T											S	B					G	G	G	G	G	G	.	S				S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.																																.
Template SS confidence
		377	.	.	380							.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.		.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions