Job Description P00722 Confidence 99.63% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 52 Aligned Residues 445 % Identity 14% Template c3ogrA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: complex structure of beta-galactosidase from trichoderma reesei with2 galactose Resolution 1.50 Å

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		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390						.	.	.	.	.	.												.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	V	R	I	E	N	G	L	L	L	L	N	G	K	P	L	L	I	R	G	V	N	R	H	E	H	H	P	L	H	G	Q	V	M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	.	.	.	.	.	S	H	Y	P	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.
Template Sequence		N	I	V	T	W	D	E	H	S	L	F	V	H	G	E	R	V	V	I	F	S	G	E	V	H	P	F	.	.	.	.	.	R	L	P	V	P	S	L	Y	L	D	V	F	H	K	I	K	A	L	G	F	N	T	V	S	F	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	K	P	G	R	F	R	A	D	G	I	F	S	L	E
Template Known Secondary structure		S	S					S	S					T	T												G	G	.	.	.	.	.	G				G	G	G											T	T															S	B	T	T	B					G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70						.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.													.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.						.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Query Sequence		L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	.	.	.	.	.	V	I	I	W	S	L	G
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	F	F	E	A	A	T	K	A	G	I	Y	L	L	A	R	P	G	P	Y	I	N	A	E	V	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q	R	V	K	G	K	L	R	T	D	A	P	D	Y	L	H	A	T	D	N	Y	V	A	H	I	A	S	I	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	V	I	L	Y	Q	P	E
Template Known Secondary structure											T									S				T	T	B	G	G	G	G			G	G	G	G	G			S		T	T	S																							T	B	G	G	G	T	S	S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		461	.	.	.										.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.														.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	E	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	G	G	G	A	D	T	T	A	T	D	I	I	C	P	M	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	E	Y	S	G	A	A	E	G	V	L	F	P	N	K	P	Y	M	Q	Y	V	I	D	Q	A	R	N	A	G	I	I	V	P	L	I	N	N	D	A	F	P	G	G	T	G	A	P	G	T	G	L	G	S	V	D	I	Y	G	H	D	G	Y	P	L	G	F	D	C	A	H	P	S	A	W	P	D	N	G	L	P
Template Known Secondary structure		S					B		T	T	S		S	S															T	T			S		B	B			B	S	S	S			T	T		T	T	S		T	T			S	B							T	T		S			S		T	T				T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	.	D	F	G	D	T	P
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence																																	.	.	.	.																																							.
Template Conservation																																	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	W	R	Q	D	H	L	N	I	S	P	S	T	P	F	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	F	G	G	.	.	.	.	W	G	F	E	Q	C	S	A	L	V	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	N	M	A	A	G	V	T	I	F	N	I	Y	M	T	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G
Template Known Secondary structure													T	T	S									S	S					T	T	S	.	.	.	.										S	S														T	T		S											B			T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.					310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
		598	.	600				.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.		.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	D	R	.	.	.	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	.	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	F	Q	F	R	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	T	I	E	V	T	S	E	Y	L
Query Conservation					.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	P	G	G	Y	T	S	Y	D	Y	G	A	S	I	R	E	D	R	R	I	D	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	Q	G	Q	F	L	K	V	S	P	G	Y	I	T	A	T	P	E	N	A	T	Q	G	V	Y	S	D	S	Q	N	I	V	I	T	P	L	L	A	K	E	S	G	D	F	F	V	V	R	H	A	N
Template Known Secondary structure			T	T	S		S	B			T	T		S	B		T	T					S															T		T					S						B	S	S	S	S	S	S		S	S									S	S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
		645	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.			.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.					.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																										.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.																										.	.	.	.
Query Sequence		F	R	H	S	D	N	E	L	L	H	W	M	V	A	L	D	G	.	.	K	P	L	A	S	G	E	V	P	L	D	V	A	P	Q	G	K	Q	L	I	E	L	P	E	L	.	.	.	.	P	Q	P	E	S	A	G	Q	L	W	L	T	V	R	V	V	Q	P	N	A	T	A	W	S	E	A	G	H	I	S	A	W
Query Conservation																			.	.																										.	.	.	.
Alig confidence																			.	.																										.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																																													.	.
Template Sequence		Y	S	S	T	D	T	A	S	Y	T	V	K	L	P	T	S	A	G	D	L	T	I	P	Q	L	G	G	S	L	T	L	T	G	R	D	S	K	I	H	V	T	D	Y	P	V	G	K	F	T	L	L	Y	S	T	A	E	I	F	T	.	.	W	N	E	F	A	E	K	T	V	L	V	L	Y	G	G	A	Q	E	L
Template Known Secondary structure		T	T			S											T	T							T	T	S							T	T												T	T							S	S					.	.					S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.			.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
		719	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.		.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.			.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.																	.	.
Query SS confidence																																														.																	.	.
Query Sequence		Q	Q	W	R	L	A	E	N	L	S	V	T	L	P	A	A	S	H	A	I	P	H	L	T	T	S	E	M	D	F	C	I	E	L	G	N	K	R	W	Q	F	N	R	Q	.	S	G	F	L	S	Q	M	W	I	G	D	K	K	Q	L	L	.	.	T	P	L	R	D	Q	F	T	R	A	P	L	D	N	D
Query Conservation																																														.																	.	.
Alig confidence									.	.	.	.																																		.																	.	.
Template Conservation									.	.	.	.
Template Sequence		H	E	F	A	V	K	N	.	.	.	.	P	F	G	S	S	K	T	A	K	A	K	K	I	E	G	S	N	V	T	I	H	T	T	S	N	L	T	V	V	L	Q	W	T	A	S	S	A	R	Q	V	V	Q	L	G	S	L	V	I	Y	M	V	D	R	N	S	A	Y	N	Y	W	V	P	T	L	P	G	S
Template Known Secondary structure									.	.	.	.		S	T	T		S	S									S	S							T	T											S	S							T	T												T	T					B				S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Template SS confidence
		513	.	.	.	.	.	.					520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.