Job Description P00722 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 608 % Identity 24% Template c3gm8A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycoside hydrolase family 2, candidate beta-glycosidase; PDBTitle: crystal structure of a beta-glycosidase from bacteroides vulgatus Resolution 2.40 Å

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		51	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	R	S	L	N	G	E	W	R	F	A	W	F	P	A	P	E	A	V	P	E	S	W	L	E	C	D	L	P	E	A	D	T	V	V	V	P	S	N	W	Q	M	H	G	Y	D	A	P	I	Y	T	N	V	T	Y	P	I	T	V	N	P	P	F	V	P	T	E	N	P	T	G	C	Y	S	L	T	F	N	V
Query Conservation
Alig confidence																									.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	I	N	F	C	K	G	W	K	F	H	L	G	D	A	G	K	G	A	S	S	S	.	.	S	Y	N	D	S	Q	W	R	I	L	N	I	P	H	D	W	S	I	E	G	T	Y	K	Q	.	.	.	.	.	.	F	E	N	G	T	D	W	Q	S	G	F	L	P	A	G	I	S	W	Y	R	K	T	F	T	I
Template Known Secondary structure								S	S						S				G	G	G	G	S	S	.	.	S				T	T	S					S	S			G	G	G	G	S				S	.	.	.	.	.	.	S	T	T	S			T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.			.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.							.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	S	W	L	Q	E	G	Q	T	R	I	I	F	D	G	V	N	S	A	F	H	L	W	C	N	G	R	W	V	G	Y	G	Q	D	S	R	L	P	S	E	F	D	L	S	A	F	L	R	A	G	E	N	R	L	A	V	M	V	L	R	W	S	D	G	S	Y	L	E	D	Q	D	M	W	R	M	S	G	I	F
Query Conservation
Alig confidence						.																																																							.	.	.	.
Template Conservation						.																																																							.	.	.	.
Template Sequence		P	S	K	W	.	K	N	K	K	V	Q	I	L	F	E	G	V	Y	L	N	S	E	V	W	I	N	G	H	W	L	G	K	R	P	N	G	Y	I	S	F	V	Y	D	L	T	P	Y	L	Q	E	G	K	N	Q	I	A	V	K	V	.	.	.	.	D	H	S	K	A	L	T	G	R	W	Y	T	G	S	G	I	Y
Template Known Secondary structure			S	G	G	.	G	S								S			B	S							T	T									S	S								G	G	G			S	S									.	.	.	.				S					S	S					B
Template Predicted Secondary structure						.																																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.		.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150					.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.			.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.
Query SS confidence																	.	.
Query Sequence		R	D	V	S	L	L	H	K	P	T	T	Q	I	S	D	.	.	F	H	V	A	T	R	F	N	D	D	F	S	R	A	V	L	E	A	E	V	Q	M	C	G	E	L	R	D	Y	L	R	V	T	V	S	L	W	Q	G	E	T	Q	V	A	S	G	T	A	P	F	G	G	E	I	I	D	E	R	G	G	Y	A	D
Query Conservation																	.	.
Alig confidence																	.	.											.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	P	V	Y	L	L	V	S	N	P	T	H	I	P	Y	S	G	I	H	F	R	S	K	L	Q	N	K	.	Q	S	A	T	Y	T	L	S	I	E	I	E	T	Q	E	K	K	P	I	K	V	K	T	Y	L	Q	A	P	N	G	S	I	A	D	T	S	E	K	I	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S									S	S	B			T	T										T	T	.	T											B		S			S											T	T	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																																					.
Query SS confidence																																																					.
Query Sequence		R	V	T	L	R	L	N	V	E	N	P	K	L	W	S	A	E	I	P	N	L	Y	R	A	V	V	E	L	H	T	A	D	G	T	L	I	E	A	E	A	C	D	V	G	F	R	E	V	R	I	E	.	N	G	L	L	L	L	N	G	K	P	L	L	I	R	G	V	N	R	H	E	H	H	P	L	H	G	Q	V
Query Conservation																																																					.
Alig confidence																															.																						.
Template Conservation																															.
Template Sequence		L	C	F	L	S	G	S	I	R	K	P	L	L	W	S	P	D	S	P	N	V	Y	T	L	I	C	Q	L	T	.	R	D	N	K	I	L	D	E	C	R	L	P	V	G	F	R	Q	L	E	F	N	P	V	S	G	F	L	L	N	G	K	S	L	K	I	K	G	V	C	D	H	H	T	V	G	A	V	G	A	A
Template Known Secondary structure											S			B	B		S	S	S	B											.		T	T												B							T	T	T					T	T												S			G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																															.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	S	H	Y	P	N	H	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.
Template Conservation																																																								.	.
Template Sequence		V	P	D	D	L	L	H	Y	R	L	K	L	L	K	D	M	G	C	N	A	I	R	T	S	H	N	P	F	S	P	A	F	Y	N	L	C	D	T	M	G	I	M	V	L	N	E	G	L	D	G	W	N	Q	P	.	.	K	A	A	D	D	Y	G	N	Y	F	D	E	W	W	Q	K	D	M	T	D	F	I	K	R
Template Known Secondary structure																	T	T							T	T	S														T									S	S	S	S	S		.	.	S	S	T	T	S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.			.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.			.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.
Query SS confidence																							.	.
Query Sequence		D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	H	G	A	N	.	.	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q	Y	E	G	G	G	A	D	T	T	A	T	D	I	I	C	P	M	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L
Query Conservation																							.	.
Alig confidence																							.	.																											.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	N	H	P	S	I	I	M	W	S	I	G	N	E	V	T	G	A	T	P	E	I	Q	H	N	L	V	S	L	F	H	Q	L	D	P	D	R	P	V	T	Q	G	G	T	D	P	N	Y	.	.	L	D	I	I	G	F	N	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	E	I	G	E	L	E	H	F
Template Known Secondary structure			T	T		T	T									S		S	S																		T	T	S						T						.	.		S						G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.			.	.	.	450	.	.	.	.	.											.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	G	N	S	L	G	G	F	A
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	K	N	Y	P	T	L	C	A	I	A	T	E	V	P	H	T	Y	Q	T	R	G	V	Y	R	S	Q	T	Q	W	R	R	R	D	F	P	A	P	W	E	F	K	H	R	V	F	P	I	P	D	L	T	E	K	E	C	F	P	E	E	S	D	Y	P	Y	Y	Q	S	S	Y	D	N	A	S	V	R	I	S	A	R
Template Known Secondary structure						T	T	S					S	S			B	B				T	T				S	S								S			T	T			G	G	G	S						S	S	S	S		S		G	G	G	G	G		T	T				S	S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.
Query Sequence		K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	.	.	.	F
Query Conservation																																																																														.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.							.	.																									.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.							.	.
Template Sequence		K	S	W	Q	R	T	C	S	F	P	W	L	M	G	E	F	R	W	G	S	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	G	E	A	E	.	W	P	Q	R	C	G	.	.	N	F	G	I	I	D	I	A	A	I	P	K	D	A	Y	F	L	Y	Q	S	L	W	T	D	K	P	M	V
Template Known Secondary structure											T	T							B		S	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B	B	S	S		.	T	T		S	B		.	.	S			S	B		T	T	S		B														S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.							.	.
Template SS confidence
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.																.	.	590	.	.	.		.	.	.	.	.	.			600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
		629	630	.	.								.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	R	L	.	.	.	.	.	.	.	S	G	Q	T	I	E	V	T	S	E	Y	L	F	R	H	S	D	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	H	W	M	V	A	L	D	G	K	P	L	A	S	G	E	V	P	L	D	V
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.										.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.
Template Sequence		H	L	L	P	H	W	T	H	P	G	K	E	G	K	T	I	P	V	V	I	.	.	.	Y	T	N	C	D	A	V	E	L	F	I	N	N	V	S	L	G	S	K	P	Y	T	G	E	Q	L	I	W	L	V	P	Y	S	P	G	K	I	E	A	R	G	I	K	K	G	K	I	V	A	T	D	C	Y	Q	S	A	E
Template Known Secondary structure					S		S			T	T		B	T	S							.	.	.			S	S	S							T	T									S	S	S								B		S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.
Template SS confidence
		628	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.				.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.
		674	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	P	Q	G	K	Q	L	I	E	L	P	E	L	P	Q	P	E	S	A	G	Q	L	W	L	T	V	R	V	V	Q	P	N	A	T	A	W	S	E	A	G	H	I	S	A	W	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	P	H	S	V	A	L	A	S	N	K	Y	S	V	K	A	G	S	D	E	V	I	R	I	E	I	D	I	T	D	K	N	G	I	P	C	P	Y	A	S	N	E	L	S	F	H
Template Known Secondary structure		S									S		S	B			T	T	S													T	T	S		B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		705	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750