Job Description P00722 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 602 % Identity 21% Template c3fn9B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative beta-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of putative beta-galactosidase from bacteroides2 fragilis Resolution 2.70 Å

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		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Q	Q	L	R	S	L	N	G	E	W	R	F	A	W	F	P	A	P	E	A	V	P	E	S	W	L	E	C	D	L	P	E	A	D	T	V	V	V	P	S	N	W	Q	M	H	G	Y	D	A	P	I	Y	T	N	V	T	Y	P	I	T	V	N	P	P	F	V	P	T	E	N	P	T	G	C	Y	S	L	T	F
Query Conservation
Alig confidence																												.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	Q	V	T	A	F	N	T	G	W	Q	F	K	K	G	P	F	A	T	D	P	M	R	A	A	.	S	Q	W	D	G	K	W	E	T	V	E	I	P	H	T	W	N	A	M	D	M	Q	V	Q	S	G	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	G	A	G	Y	Y	R	K	T	Q
Template Known Secondary structure			S							S	S										S	S						.				T	S							S	S			S		T	T	T	T	T	S	S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure																												.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.															.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.		.	.	.	.	.	.	.	.	190	.			.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.											.	.
Query SS confidence																																																							.											.	.
Query Sequence		N	V	D	E	S	W	L	Q	E	G	Q	T	R	I	I	F	D	G	V	N	S	A	F	H	L	W	C	N	G	R	W	V	G	Y	G	Q	D	S	R	L	P	S	E	F	D	L	S	A	F	L	R	A	G	.	E	N	R	L	A	V	M	V	L	R	.	.	W	S	D	G	S	Y	L	E	D	Q	D	M	W	R
Query Conservation																																																							.											.	.
Alig confidence								.																																															.											.	.
Template Conservation								.
Template Sequence		F	F	P	H	D	L	.	E	G	K	R	V	F	L	R	F	E	G	V	G	A	C	A	E	V	Y	V	N	G	K	L	A	G	T	H	K	G	G	Y	S	A	F	A	C	E	I	G	T	A	L	K	L	G	A	E	N	E	I	I	V	K	A	D	N	K	A	R	P	D	V	I	P	V	N	Q	N	L	F	G	V
Template Known Secondary structure					G	G	G	.	T	T								S			B	S							S	S	S								T	T	S							G	G	G			T	T														B	T	T	B	S	S		S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure								.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.								.	.	.	.	230	.		.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.							.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.							.
Query Sequence		M	S	G	I	F	R	D	V	S	L	L	H	K	P	T	T	Q	I	S	D	.	.	.	.	.	.	.	F	H	V	A	T	R	.	F	N	D	D	F	S	R	A	V	L	E	A	E	V	Q	M	C	G	E	L	R	D	Y	L	R	V	T	V	S	L	W	Q	G	E	T	Q	V	A	S	G	T	A	P	F	G	G
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.							.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.							.																																										.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	G	I	Y	R	P	V	W	L	I	V	T	E	Q	N	N	I	T	V	T	D	C	A	S	P	G	V	Y	I	T	Q	K	D	V	S	K	K	S	A	D	I	T	V	K	V	K	L	D	N	A	G	L	Q	P	A	A	V	T	L	E	N	T	I	Y	T	Q	E	G	Q	K	V	G	T	H	.	.	.	.	S
Template Known Secondary structure				B			S									S					S		S	T	T			S							S		S	S	S														S	S	S													T	T	S							.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.					.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.		.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.																																				.
Query SS confidence																													.																																				.
Query Sequence		E	I	I	D	E	R	G	G	Y	A	D	R	V	T	L	R	L	N	V	E	N	P	K	L	W	S	A	.	E	I	P	N	L	Y	R	A	V	V	E	L	H	T	A	D	G	T	L	I	E	A	E	A	C	D	V	G	F	R	E	V	R	I	E	.	N	G	L	L	L	L	N	G	K	P	L	L	I	R	G	V
Query Conservation																													.																																				.
Alig confidence																													.														.																						.
Template Conservation																																											.
Template Sequence		R	S	F	D	L	S	P	Q	G	T	Q	T	Y	L	S	T	F	K	L	K	N	P	H	L	W	Q	G	R	K	D	P	Y	L	Y	K	V	V	C	R	L	M	.	A	D	G	K	V	I	D	E	V	V	Q	P	L	G	V	R	K	Y	E	I	V	A	G	K	G	F	F	L	N	G	E	K	Y	S	M	Y	G	V
Template Known Secondary structure								S	S	S												S						G	G	G													.		T	T																			T	T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	H	E	H	H	P	L	H	G	Q	V	M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	S	H	Y	P	N	H	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	H	Q	D	W	W	G	L	G	S	A	L	K	N	E	H	H	D	F	D	L	A	A	I	M	D	V	G	A	T	T	V	R	F	A	H	Y	Q	Q	S	D	Y	L	Y	S	R	C	D	T	L	G	L	I	I	W	A	E	I	P	C	V	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	G	Y	E	T	E
Template Known Secondary structure					S		B	T	T	T	B	T																		T		S					T	T	S														T										B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.										.	.	.	.	390	.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.						.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.						.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	H	G	.	.	.	.	.	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q	Y	.	.	.	.	.	E	G	G	G	A	D	T	T	A	T	D	I	I	C	P	M	Y	A
Query Conservation																																	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	A	Q	S	Q	L	R	E	L	I	R	Q	S	F	N	H	P	S	I	Y	V	W	G	L	H	N	E	V	Y	Q	P	H	E	Y	T	A	A	L	T	R	S	L	H	D	L	A	K	T	E	D	P	D	R	Y	T	V	S	V	N	G	Y	G	H	M	D	H	P	V	N	L	N	A	D	I	Q	G	M	N	R	Y
Template Known Secondary structure														T	T	T		T	T									S			S	S																				T	T	S							S	S	S		S	S		T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	S	L	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.
Template Sequence		F	G	W	Y	E	K	K	I	Q	D	I	K	P	W	V	E	Q	L	E	K	D	.	.	Y	P	Y	Q	K	L	M	L	T	E	Y	G	A	D	A	N	L	A	H	Q	T	E	Y	L	G	D	A	L	N	W	G	K	P	F	Y	P	E	T	F	Q	T	K	T	H	E	Y	Q	W	S	I	I	K	D	H	P	Y	I
Template Known Secondary structure		B	T	T	T	B	S		G	G	G												.	.		T	T	S												B	T	T				S				S	S			T	T	S	S			B																	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.
Template SS confidence
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.			.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.		.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.				.	.	630	.							.	.
Predicted Secondary structure																																																			.																.	.	.					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.																.	.	.					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	.	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	.	.	.	F	Q	F	R	.	.	.	.	.	.	L	S
Query Conservation																																																			.																.	.	.					.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																.	.	.					.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	S	Y	L	W	N	M	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	V	P	M	W	T	R	G	G	V	P	A	R	N	M	K	G	L	I	T	F	D	R	K	T	K	K	D	S	Y	F	W	Y	K	A	N	W	S	E	E	P	V	L	Y	L	T	Q	R	R	N	A	D	R	E
Template Known Secondary structure							S		S	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T									S	B		T	T	S			B													S	S						S		S	S			B
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560																.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
		634	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Q	T	I	E	V	T	S	E	Y	L	F	R	H	S	D	N	E	L	L	H	W	M	V	A	L	D	G	K	P	L	A	S	G	E	V	P	L	D	V	A	P	Q	G	K	Q	L	I	E	L	P	E	L	P	Q	P	E	S	A	G	Q	L	W	L	T	V	R	V	V	Q	P	N	A	T	A	W	S	E	A	G
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.												.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.												.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	R	T	T	A	V	.	.	.	T	V	Y	S	N	I	G	T	P	K	V	.	.	.	.	Y	L	N	G	Q	E	L	S	G	I	R	N	G	Y	T	D	V	H	Y	V	F	D	N	V	S	L	.	.	.	.	.	.	.	A	D	G	K	N	I	L	K	A	V	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	K	G
Template Known Secondary structure			S					.	.	.					S	S	S					.	.	.	.			T	T										S	S	T	T										.	.	.	.	.	.	.		S											.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.												.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		616	.	.	.	620	.				.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.					.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.								.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670									.	.	.
		714	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	I	S	A	W	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	E	Y	T	D	E
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		674	.	.	.	.	.