Job Description P00722 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 568 % Identity 21% Template c3cmgA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative beta-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of putative beta-galactosidase from bacteroides2 fragilis Resolution 1.90 Å

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		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Q	L	R	S	L	N	G	E	W	R	F	A	W	F	P	A	P	E	A	V	P	E	S	W	L	E	C	D	L	P	E	A	D	T	V	V	V	P	S	N	W	Q	M	H	G	Y	D	A	P	I	Y	T	N	V	T	Y	P	I	T	V	N	P	P	F	V	P	T	E	N	P	T	G	C	Y	S	L	T	F	N
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		R	Q	D	I	L	L	N	N	N	W	N	F	R	F	S	H	Q	V	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	R	R	V	D	L	P	H	T	W	N	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	L	A	G	K	I	D	Y	.	.	.	K	R	G	I	G	N	Y	E	K	A	L	Y
Template Known Secondary structure									S							T	T	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G	T		T	T		.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.												.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.												.	.	.	.	.	.	.	.	80				.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.		.	.	.	.	.	.	.	.	190	.		.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.											.
Query SS confidence																																																						.											.
Query Sequence		V	D	E	S	W	L	Q	E	G	Q	T	R	I	I	F	D	G	V	N	S	A	F	H	L	W	C	N	G	R	W	V	G	Y	G	Q	D	S	R	L	P	S	E	F	D	L	S	A	F	L	R	A	G	.	E	N	R	L	A	V	M	V	L	R	.	W	S	D	G	S	Y	L	E	D	Q	D	M	W	R	M	S
Query Conservation																																																						.											.
Alig confidence							.																																															.											.
Template Conservation							.
Template Sequence		I	R	P	E	W	.	K	G	K	R	L	F	L	R	F	D	G	V	N	S	I	A	D	V	F	I	N	R	K	H	I	G	E	H	R	G	G	Y	G	A	F	I	F	E	I	T	D	L	V	K	Y	G	E	K	N	S	V	L	V	R	A	N	N	G	E	Q	L	D	I	M	P	L	V	G	D	F	N	F	Y	G
Template Known Secondary structure				G	G	G	.	T	T	S							S			B	S							T	T									S	S	S							T	T	T	S		T	T	S														S	S	S	S		S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.		.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.							.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	F	R	D	V	S	L	L	H	K	P	T	T	Q	I	S	D	F	H	V	.	.	.	.	.	.	A	T	R	F	N	D	D	F	S	R	A	V	L	E	A	E	V	Q	M	C	G	E	L	R	D	Y	L	R	V	T	V	S	L	W	Q	G	E	T	Q	V	A	S	G	T	A	P	F	G	G	E	I	I	D
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.																									.																						.	.	.
Template Conservation																																																					.																						.	.	.
Template Sequence		G	I	Y	R	D	V	H	L	L	I	T	D	E	T	C	I	S	P	L	D	Y	A	S	P	G	V	Y	L	V	Q	E	V	V	S	P	Q	E	A	K	V	C	A	K	V	N	L	S	N	R	A	A	.	D	G	T	A	E	L	Q	V	L	V	T	D	G	T	K	V	I	C	K	E	S	.	.	.	R	N	V	S
Template Known Secondary structure		B			S									S					S		S	T	T	S		S										S	S														S	S	.	S												T	T								.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.																						.	.	.
Template SS confidence
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.		.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.				.	.	.	.
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.		.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.		.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.																																						.
Query SS confidence																									.																																						.
Query Sequence		E	R	G	G	Y	A	D	R	V	T	L	R	L	N	V	E	N	P	K	L	W	S	A	.	E	I	P	N	L	Y	R	A	V	V	E	L	H	T	A	D	G	T	L	I	E	A	E	A	C	D	V	G	F	R	E	V	R	I	E	N	G	.	L	L	L	L	N	G	K	P	L	L	I	R	G	V	N	R	H	E
Query Conservation																									.																																						.
Alig confidence																									.																.																						.
Template Conservation																																									.
Template Sequence		L	K	Q	G	A	D	I	L	E	Q	L	P	L	L	I	Q	K	P	R	L	W	N	G	C	E	D	P	F	M	Y	Q	V	S	I	S	L	H	K	D	.	G	K	Q	I	D	S	V	T	Q	P	L	G	L	R	Y	Y	H	T	D	P	D	K	G	F	F	L	N	G	K	H	L	P	L	H	G	V	C	R	H	Q
Template Known Secondary structure				T	T													S				B		G	G	G		B												T	.	T																			T	T	T					T	T												S
Template Predicted Secondary structure																																									.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	H	P	L	H	G	Q	V	M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	S	H	Y	P	N	H	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	R	A	E	V	G	N	A	L	R	P	Q	H	H	E	E	D	V	A	L	M	R	E	M	G	V	N	A	I	R	L	A	H	Y	P	Q	A	T	Y	M	Y	D	L	M	D	K	H	G	I	V	T	W	A	E	I	P	F	V	G	P	G	G	Y	A	D	K	G	F	V	D	Q	A	S	F	R	E	N	G	K	Q
Template Known Secondary structure			B	T	T	T	B	T																	T	T							T	T	S														T										B			T	T	S	S	S		S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.						.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.			.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	H	.	.	.	.	.	G	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q	Y	E	G	G	G	A	D	.	.	T	T	A	T	D	I	I	C	P	M	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P
Query Conservation																												.	.	.	.	.																													.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	I	E	L	I	R	Q	H	Y	N	H	P	S	I	C	F	W	G	L	F	N	E	L	K	E	V	G	D	N	P	V	E	Y	V	K	E	L	N	A	L	A	K	Q	E	D	P	T	R	P	T	T	S	A	S	N	Q	D	G	N	L	N	F	I	T	E	N	I	A	W	N	R	Y	D	G	W	Y	G	S	T
Template Known Secondary structure											T	T		T	T									S			S	S	S	S																		T	T	S										S	G	G	G	G	S	S	S	S							T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	M	G	N	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.
Template Sequence		P	K	T	L	A	T	F	L	D	R	T	H	K	K	H	P	.	.	E	L	R	I	G	I	S	E	Y	G	A	G	A	S	I	Y	H	Q	Q	D	S	L	K	Q	P	S	A	S	G	W	W	H	P	E	N	W	Q	T	Y	Y	H	M	E	N	W	K	I	I	A	E	R	P	F	V	W	G	T	F	V	W	N	M
Template Known Secondary structure		T															T	.	.	T													B	T	T				S	S						T	T	S	S			B																	T		T	T							S		S
Template Predicted Secondary structure																		.	.
Template SS confidence
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.			.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.		.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640				.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.																												.	.	.
Query SS confidence																																												.																												.	.	.
Query Sequence		V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	.	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	F	Q	F	R	L	S	G	Q	T	I	E	V	T	.	.	.	S	E	Y	L	F	R	H
Query Conservation																																												.																												.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.															.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	A	A	H	R	T	E	G	D	R	P	G	I	N	D	K	G	L	V	T	F	D	R	K	V	R	K	D	A	F	Y	F	Y	K	A	N	W	N	K	.	.	.	.	.	Q	E	P	M	I	Y	L	A	E	K	R	C	R	L	R	Y	Q	P
Template Known Secondary structure		B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T				T	T	S	T	T						S	B		T	T	S			B													T	.	.	.	.	.	T	S						T	T	T	T							S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		565	.																.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.						.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
		648	.	650	.	.	.						.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.
Query Sequence		S	D	N	E	L	L	.	.	.	.	.	H	W	M	V	A	L	D	G	K	P	L	A	S	G	E	V	P
Query Conservation								.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	Q	T	F	M	A	F	T	T	A	P	E	A	E	L	F	V	N	G	V	S	C	G	K	Q	K	A	D
Template Known Secondary structure		S								S	S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		625	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.