Job Description P00722 Confidence 97.99% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 111 Aligned Residues 353 % Identity 14% Template c2vrqB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-l-arabinofuranosidase; PDBTitle: structure of an inactive mutant of arabinofuranosidase from2 thermobacillus xylanilyticus in complex with a3 pentasaccharide Resolution 2.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390																														.	.	.	.	.	.						.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H	Y	P	N	H	.	.	.	.	.	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	V	L	E	A	L	K	Q	M	K	I	P	V	L	R	W	P	G	G	C	F	A	D	E	Y	H	W	K	D	G	V	G	P	R	E	K	R	K	R	M	V	N	T	H	W	G	G	V	I	E	N	N	H	F	G	T	H	E	F	M	M	L	C	E	L	L	G	C	E	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T							S		S	G	G	G	G	T			G	G	G	G	S	S	S	G	G	G							T	T	T	T	T							S													T					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.								.	.	.	.	.	.	450	.	.				.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.											.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.										.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.										.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	M	V	P	M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	.	.	.	.	.	.	.	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	.	.	.	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.										.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																							.	.	.	.	.	.	.										.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	I	S	G	N	V	G	S	G	T	V	Q	E	M	S	E	W	V	E	Y	I	T	F	D	G	E	S	P	M	A	N	W	R	R	E	N	G	R	E	K	P	W	R	I	K	Y	W	G	V	G	N	Q	N	W	G	C	G	G	N	M	R	A	E	Y	Y	A	D	L	Y	R	Q	F	Q	T	Y	L	R	N	Y
Template Known Secondary structure		.	.						S	S																	S											T	T			S											S		T	T	T	T	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
			480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.													.	.	.	.	.	.	500	.	.	.		.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	P	S	R	P	V	Q	Y	E	G	G	G	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	A	T	D	I	I	C	P	M	.	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	N	K	L	H	K	I	A	C	G	A	N	T	A	D	Y	H	W	T	E	V	L	M	K	Q	A	A	P	F	M	H	G	L	S	L	H	Y	Y	T	V	P	G	P	W	E	K	K	G	P	A	T	G	F	T	T	D	E	W	W	V	T	L	K	K	A	L	F	M	D	R	L	V	T	K	H	S	A	I	M
Template Known Secondary structure		T	T												T	T													G	G	G		S										S	S		T	T	S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
					527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.
Template Sequence		D	V	Y	D	P	D	K	R	I	D	L	I	V	D	E	W	G	T	W	Y	D	V	E	P	G	T	.	.	.	.	N	P	G	F	L	Y	Q	Q	N	S	I	R	D	A	L	V	A	G	A	T	L	H	I	F	H	R	H	C	D	R	V	R	M	A	N	I	A	Q	L	V	N	V	L	Q	S	V	I	L	T	E
Template Known Secondary structure						T	T			S														S	T	T	S	.	.	.	.		G	G	G						B																	T	T	T	T									S	B	S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.					310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	F	Q	F	R	L	S	G	Q	T	I	E	V	T	S	E	Y	L	F	R	H	S	D	N	E	L	L	H	W	M	V	A	L	D	G	K	P	L	A	S	G	E	V	P	L	D	V	A	P	Q	G	K	Q	L	I	E	L
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Template Sequence		G	E	R	M	.	.	.	.	.	L	L	T	P	T	Y	H	V	F	N	M	F	K	V	H	Q	D	A	E	L	L	D	T	W	E	S	V	E	R	T	G	P	E	G	E	L	P	K	V	S	V	S	A	S	R	A	A	D	G	K	I	H	I	.	.	.	S	L	C	N	L	D	F	E	T	G	A	S	V	D	I
Template Known Secondary structure		T	T			.	.	.	.	.												G	G	G	G	T	T														S	G	G	G				S									T	T	S					.	.	.							S	S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.	.						.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.				.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		684	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	L	P	Q	P	E	S	A	G	Q	L	W	L	T	V	R	V	V	Q	P	N	A	T	A	W	S	E	A	G	H	I	S	A	W	Q	Q	W	R	L	A	E	N	L	S	V	T	L	P	A	A	S	H	A	I	P	H	L	T	T	S	E	M	D	F	C	I	E	L	G	N	K	R	W	Q	F	N	R	Q	S
Query Conservation
Alig confidence		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	E	L	R	G	L	N	G	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	T	G	T	T	L	T	S	G	R	I	D	G	H	N	T	F	D	E	P	E	R	V	K	P	A	P	F	R	D	F	K	L	E	G	G	H	L	N	A	S	L	P	P	M	S
Template Known Secondary structure		.				S		S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	S	T	T		B			S	S	S	T	T	S	S												T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			432	.	.	.	.	.	.	.	440																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
		764	.	.	.	.	.	770	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	L	S	Q	M	W	I	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	T	V	L	E	L	T	A	G
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		488	.	490	.	.	.	.	.	.