Job Description P00722 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 655 % Identity 20% Template c2je8B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:beta-mannosidase; PDBTitle: structure of a beta-mannosidase from bacteroides2 thetaiotaomicron Resolution 1.7 Å

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		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	P	S	Q	Q	L	R	S	L	N	G	E	W	R	F	A	W	F	P	A	P	E	A	V	P	E	S	W	L	E	C	D	L	P	E	A	D	T	V	V	V	P	S	N	W	Q	M	H	G	Y	D	A	P	I	Y	T	N	V	T	Y	P	I	T	V	N	P	P	F	V	P	T	E	N	P	T	G	C	Y	S
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.
Template Sequence		G	N	D	T	S	E	V	M	L	L	D	T	G	W	E	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	G	T	E	K	W	M	P	A	T	V	P	G	T	V	H	Q	D	L	I	S	H	E	L	L	P	N	P	F	Y	G	M	N	E	K	K	I	.	Q	W	V	E	N	E	D	W	E	Y	R
Template Known Secondary structure				S	S								S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S								S	S										T	T	S	S			T	T	S	T	T	T	T	G	G	G	.	G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.														.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	F	N	V	D	E	S	W	L	Q	E	G	Q	T	R	I	I	F	D	G	V	N	S	A	F	H	L	W	C	N	G	R	W	V	G	Y	G	Q	D	S	R	L	P	S	E	F	D	L	S	A	F	L	R	A	G	E	N	R	L	A	V	M	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	F	I	V	S	E	E	Q	L	N	R	D	G	I	Q	L	I	F	E	G	L	D	T	Y	A	D	V	Y	L	N	G	S	L	L	L	K	A	D	N	M	F	V	G	Y	T	L	P	V	K	S	V	L	R	K	G	E	N	H	L	Y	I	Y	F	H	S	P	I	R	Q	T	L	P	Q	Y	A	S	N	G	F
Template Known Secondary structure												T	S	S							S				S							T	T								B	T	T								G	G	G			S																								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.		.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query Sequence		R	W	S	D	G	S	Y	L	E	D	Q	D	M	W	R	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	I	F	R	D	V	S	L	L	H	K	P	T	T	Q	I	S	D	F	H	V	A	T	R	.	F	N	D	D	F	S	R	A	V	L	E	A	E	V	Q	M	C	G	E	L
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation
Template Sequence		N	Y	P	A	D	N	D	H	H	E	K	H	L	S	V	F	S	R	K	A	P	Y	S	Y	G	W	D	W	G	I	R	M	V	T	S	G	V	W	R	P	V	T	L	R	F	Y	D	I	A	T	I	S	D	Y	Y	V	R	Q	L	S	L	T	D	E	N	A	R	L	S	N	E	L	I	V	N	Q	I	V	P	Q
Template Known Secondary structure						T	T	S		S	S	S		G	G	G	G	S	B	S		G	G	G	G		B	T	T	B										S								S	S															S	S														S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.				.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.
Query Sequence		R	D	Y	L	R	V	T	V	S	L	W	Q	G	E	T	Q	V	A	S	G	T	A	P	F	G	G	E	I	I	D	E	R	G	G	Y	A	D	R	V	T	L	R	L	N	V	E	N	P	K	L	W	S	A	E	I	.	.	.	P	N	L	Y	R	A	V	V	E	L	H	T	A	D	G	T	L	I	E	A	E	A
Query Conservation																																																									.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.																											.	.	.												.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.																																									.
Template Sequence		K	I	P	A	E	V	R	V	N	V	S	L	N	G	T	T	V	T	E	V	K	Q	Q	.	.	.	.	.	.	V	T	L	Q	P	G	I	N	H	I	T	L	P	A	E	V	T	N	P	V	R	W	M	P	N	G	W	G	T	P	T	L	Y	D	F	S	A	Q	I	A	.	C	G	D	R	I	V	A	E	Q	S
Template Known Secondary structure														T	T										.	.	.	.	.	.					S													S				B			T	T	S	S		B											.		T	T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.																																									.
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.							.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.									.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390			.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query Sequence		C	D	V	G	F	R	E	V	R	I	E	N	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	L	N	G	K	P	L	L	I	R	G	V	N	R	H	E	H	H	P	L	H	G	Q	V	M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	.	.	S	H	Y	P	N	H	P	L
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.																									.																								.	.
Template Conservation																																																.
Template Sequence		H	R	I	G	L	R	T	I	R	V	V	N	E	K	D	K	D	G	E	S	F	Y	F	E	V	N	G	I	P	M	F	A	K	G	A	N	Y	I	P	Q	D	A	L	L	P	N	.	V	T	T	E	R	Y	Q	T	L	F	R	D	M	K	E	A	N	M	N	M	V	R	I	W	G	G	G	T	Y	E	N	N	L
Template Known Secondary structure																	T	T									T	T													S		S	S	G	G	G	.																T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	H	G	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Y	D	L	A	D	E	N	G	I	L	V	W	Q	D	.	.	.	.	.	.	F	M	F	A	C	T	P	Y	P	S	D	P	T	F	L	K	R	V	E	A	E	A	V	Y	N	I	R	R	L	R	N	H	A	S	L	A	M	W	C	G	N	N	E	I	L	E	A	L	K	Y	W	G	F	E	K	K	F	T	P
Template Known Secondary structure										T							.	.	.	.	.	.		S		B	S	S																								T	T		T	T						S		B	S								S			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.							420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
																469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.					.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q	.	.	.	.	Y	E	G	G	G	A	D	T	T	A	T	D	I	I	C	P	M	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	V	Y	Q	G	L	M	H	G	Y	D	K	L	F	R	E	L	L	P	S	T	V	K	E	F	D	S	D	R	F	Y	V	H	S	S	P	Y	L	A	N	W	G	R	P	E	S	W	G	T	G	D	S	H	N	W	G	V	W	Y	G	K	K	P	F	E	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T
Template Known Secondary structure																T	T											T	T	S				S	S	B	S	S	S			T	T		G	G	G	T	T	B	S						T	T	T	T	T				T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.												.	.
		531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	S	L	G	G	F	A	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	P	R	F	M	S	E	F	G	F	Q	S	F	P	E	M	K	T	I	A	A	F	A	A	P	E	D	Y	Q	I	E	S	E	V	M	N	A	H	Q	K	S	S	I	G	N	S	L	I	R	T	Y	M	E	R	D	Y	I	I	P	E	S	F	E	D	F	V	Y	V	G	L	V	L	Q	G	Q	G	M	R	H
Template Known Secondary structure		S			S	S								B													G	G	G		S	T	T	S						T	B		S	S	S													S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
		571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.					.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.
Query Sequence		W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	F	Q	F	R	L	.	.	.	.	S	G	Q	T	I	E	V	T	S	E	Y	L	F	R
Query Conservation																																																																.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.													.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.																																														.
Template Sequence		G	L	E	A	H	R	R	N	R	P	Y	C	M	G	T	L	Y	W	Q	L	N	D	S	W	P	V	V	.	.	.	.	.	.	S	W	S	S	I	D	Y	Y	G	N	W	K	A	L	H	Y	Q	A	K	R	A	F	A	P	V	L	I	N	P	I	Q	Q	N	D	S	L	S	V	Y	L	I	S	D	R	L	.	D
Template Known Secondary structure									T	T	T	T							S		S			S	S	S		B	.	.	.	.	.	.	B	S		S	B		T	T			B											T		S									T	T											S	.	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.																																														.
Template SS confidence
		628	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.							.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.		700
		647	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.		660	.	.	.	.	.	.	.	.			.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.				.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Predicted Secondary structure															.										.	.															.	.	.
Query SS confidence															.										.	.															.	.	.
Query Sequence		H	S	D	N	E	L	L	H	W	M	V	A	L	.	D	G	K	P	L	A	S	G	E	.	.	V	P	L	D	V	A	P	Q	G	K	Q	L	I	E	.	.	.	L	P	E	L	P	Q	P	E	S	A	G	Q	L	W	L	T	V	R	V	V	Q	P	N	A	T	A	W	S	E	A	G	H	I	S	A	W	Q	Q
Query Conservation															.										.	.															.	.	.
Alig confidence															.										.	.															.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	M	E	Q	M	T	L	E	M	K	V	V	D	F	D	G	K	T	L	G	K	K	I	Q	V	H	S	L	E	V	P	A	N	T	S	K	C	V	Y	R	A	K	L	D	G	W	L	T	P	E	D	C	R	R	S	F	L	K	L	I	L	K	.	.	.	.	.	.	.	D	K	S	G	H	Q	V	A	E	S	V
Template Known Secondary structure															T	T	S																T	T										S	T	T	T	S						T	T									.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		701	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.								.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.
		721	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	R	L	A	E	N	L	S	V	T	L	P	A	A	S	H	A	I	P	H	L	T	T	S	E	M	D	F	C	I	E	L	G	N
Query Conservation
Alig confidence															.
Template Conservation															.
Template Sequence		H	F	F	R	K	T	K	D	L	Q	L	P	P	.	T	S	V	S	Y	Q	M	K	Q	T	D	G	K	C	E	L	T	L	F	S
Template Known Secondary structure				S	S		G	G	G	S					.											T	T
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		774	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.		.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.