Job Description P00722 Confidence 99.61% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 55 Aligned Residues 441 % Identity 14% Template c1xc6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: native structure of beta-galactosidase from penicillium sp. in complex2 with galactose Resolution 2.10 Å

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		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390						.	.	.	.	.	.												.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	R	I	E	N	G	L	L	L	L	N	G	K	P	L	L	I	R	G	V	N	R	H	E	H	H	P	L	H	G	Q	V	M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	.	.	.	.	.	S	H	Y	P	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	W
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	W	D	E	H	S	I	F	V	N	G	E	R	L	M	I	F	S	G	E	V	H	P	Y	.	.	.	.	.	R	L	P	V	A	S	L	Y	I	D	I	F	E	K	V	K	A	L	G	F	N	C	V	S	F	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	N	P	G	H	Y	S	A	E	G	I	F	D	L	Q	P	F
Template Known Secondary structure						S	S					T	T												G	G	.	.	.	.	.	G	S			G	G	G										T	T	T															S	B	T	T	B					G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70						.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.													.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.						.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	.	.	.	.	.	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	A	A	K	E	A	G	I	Y	L	L	A	R	P	G	P	Y	I	N	A	E	V	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q	R	V	D	G	I	L	R	T	S	D	E	A	Y	L	K	A	T	D	N	Y	A	S	N	I	A	A	T	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	I	I	L	Y	Q	P	E	N	E
Template Known Secondary structure									T									S				T	T	B	G	G	G	G			G	G	G	G	G		S	S		T	T	S	S																						T	B	G	G	G	T	S	S							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		463	.	.											.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.														.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q	Y	E	G	G	G	A	D	T	T	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	I	C	P	M	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	G	A	C	C	G	Y	N	G	F	P	D	G	S	Y	M	Q	Y	I	E	D	H	A	R	D	A	G	I	V	V	P	F	I	S	N	D	A	W	A	A	G	H	N	A	P	G	T	G	A	G	A	V	D	I	Y	G	H	D	S	Y	P	L	G	F	D	C	A	N	P	S	T	W	P	S	G	N	L	P	T
Template Known Secondary structure					B		T	T					S															T	T			S		B	B			B	S	S	S	S		T	T		T	T	S		T	T			S	B							T	T		S			S	S	T	T				T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.		.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.
Query SS confidence																																																																										.
Query Sequence		S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	.	D	F	G	D	T	P	N
Query Conservation																																																																										.
Alig confidence																																.	.	.	.																																							.
Template Conservation																																.	.	.	.
Template Sequence		Y	F	H	T	S	H	E	Q	Q	S	P	S	T	P	Y	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	W	G	G	.	.	.	.	V	G	F	A	K	C	A	A	L	L	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	D	F	S	F	G	V	A	F	L	N	L	Y	M	I	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G	H
Template Known Secondary structure												T	T	S									S						T	T		.	.	.	.										T	S													T	T	T		S											B			T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310					.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		599	600				.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.		.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	.	.	.	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	.	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	F	Q	F	R	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	T	I	E	V	T	S	E	Y
Query Conservation				.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	G	Y	T	S	Y	D	Y	G	S	A	I	S	E	S	R	N	I	T	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	L	G	N	F	A	K	V	S	P	G	Y	L	V	A	N	P	G	D	L	S	T	S	T	Y	T	N	T	A	D	L	T	V	T	P	L	L	G	S	N	S	S	A	S	S	F	F	V	I	R	H	S
Template Known Secondary structure		T	T	S		S	B			T	T		S	B		T	T	S				S															T		G	G	G	T	T	S						B	S	S	S	S	B	S		T	T									S	S	T	T	S									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		644	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.			.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.					.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.																				.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.																				.	.	.	.
Query Sequence		L	F	R	H	S	D	N	E	L	L	H	W	M	V	A	L	D	G	K	.	.	P	L	A	S	G	E	V	P	L	D	V	A	P	Q	G	K	Q	L	I	.	.	.	.	E	L	P	E	L	P	Q	P	E	S	A	G	Q	L	W	L	T	V	R	V	V	Q	P	N	A	T	A	W	S	E	A	G	H	I	S	A
Query Conservation																					.	.																				.	.	.	.
Alig confidence																					.	.																				.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																																														.	.
Template Sequence		D	Y	S	S	Q	A	S	V	E	Y	K	L	T	V	P	T	S	A	G	N	L	T	I	P	Q	L	G	G	S	L	T	L	S	G	R	D	S	K	I	H	V	T	D	Y	D	V	A	G	T	N	I	L	Y	S	T	A	E	V	F	T	.	.	W	K	K	F	N	N	E	K	V	L	V	L	Y	G	G	P	G	E
Template Known Secondary structure		S	T	T														T	T							T	T	S							T	T												T	T							S	S					.	.					T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.			.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
		718	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Q	Q	W	R	L	A	E	N	L	S	V	T	L	P	A	A	S	H	A	I	P	H	L	T	T	S	E	M	D	F	C	I	E	L	G	N	K	R	W	Q	F	N	R	Q	S	G	F	L	S	Q	M	W	I	G	D	K	K	Q	L	L	T	P	L	R	D	Q	F	T	R	A	P	L	D	N	D
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	H	E	F	A	V	S	G	A	S	S	S	S	V	V	E	G	S	S	S	G	I	S	S	K	K	V	G	K	A	L	V	V	A	W	D	V	S	T	A	R	R	I	V	Q	V	G	S	L	K	.	.	.	.	.	.	V	F	L	L	D	R	N	S	A	Y	N	Y	W	V	P	Q	V	P	T	K
Template Known Secondary structure									T									S			T	T							T	T										S	S							T	T			.	.	.	.	.	.										T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.							.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.