Job Description P00722 Confidence 96.23% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 137 Aligned Residues 349 % Identity 14% Template c1qw9B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-l-arabinofuranosidase; PDBTitle: crystal structure of a family 51 alpha-l-2 arabinofuranosidase in complex with 4-nitrophenyl-ara Resolution 1.20 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390																													.	.	.	.	.	.						.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H	Y	P	N	H	.	.	.	.	.	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	L	V	K	E	L	Q	V	P	I	I	R	Y	P	G	G	N	F	V	S	G	Y	N	W	E	D	G	V	G	P	K	E	Q	R	P	R	R	L	D	L	A	W	K	S	V	E	T	N	E	I	G	L	N	E	F	M	D	W	A	K	M	V	G	A	E	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	A
Template Known Secondary structure									T							S		S	G	G	G	G	G			G	G	G	G	S	S		G	G	G							T	T	T	T						S	S													T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.											.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.								.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.				.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.													.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	.	.	.	.	.	.	.	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	.	.	.	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	L	G	T	R	G	I	D	A	A	R	N	L	V	E	Y	C	N	H	P	S	G	S	Y	Y	S	D	L	R	I	A	H	G	Y	K	E	P	H	K	I	K	T	W	C	L	G	N	A	M	D	G	P	W	Q	I	G	H	K	T	A	V	E	Y	G	R	I	A	C	E	A	A	K	V	M	K	W	V	D	P
Template Known Secondary structure					S	S																	S	S	S									T	T			S										S					S	T	T	S	T	T																							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.														.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	P	V	Q	Y	E	G	G	G	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	A	T	D	I	I	C	P	M	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	R
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	I	E	L	V	V	C	G	S	S	N	R	N	M	P	T	F	A	E	W	E	A	T	V	L	D	H	T	Y	D	H	V	D	Y	I	S	L	H	Q	Y	Y	G	N	R	D	N	D	T	A	N	Y	L	A	L	S	L	E	M	D	D	F	I	R	S	V	V	A	I	A	D	Y	V	K	A	K	K	R	S	K	K
Template Known Secondary structure		T									S		T	T	S	T	T	T	T											G	G	G		S											T	T								T	T																							T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
				533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.									.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F
Query Conservation		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.									.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.
Template Sequence		T	I	H	L	S	F	D	E	W	N	.	.	.	.	V	W	Y	H	S	N	E	A	D	K	L	I	E	P	W	T	V	A	P	P	L	L	E	D	I	Y	N	F	E	D	A	L	L	V	G	C	M	L	I	T	L	M	K	H	A	D	R	V	K	I	A	C	L	A	Q	L	V	N	V	I	A	P	I	M	T	E
Template Known Secondary structure												.	.	.	.				T	T					T	T			T	T		S	S			T	T					B																	T	T	T	T									S	B	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.					.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.			.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680
Predicted Secondary structure																																						.	.
Query SS confidence																																						.	.
Query Sequence		C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	F	Q	F	R	L	S	G	Q	T	I	E	.	.	V	T	S	E	Y	L	F	R	H	S	D	N	E	L	L	H	W	M	V	A	L	D	G	K	P	L	A	S	G	E	V	P	L	D	V	A	P	Q	G	K	Q	L
Query Conservation																																						.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.																											.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	G	P	A	.	.	.	.	.	W	K	Q	T	I	Y	Y	P	F	M	H	A	S	V	Y	G	R	G	V	A	L	H	P	V	I	S	S	P	K	Y	D	S	K	D	F	T	D	V	P	Y	L	E	S	I	A	V	Y	N	E	E	K	E	E	V	T	I	F	A	V	N	R	D	M	E	D	A	L	L	L	E
Template Known Secondary structure		T	T	S			.	.	.	.	.				T	T													S															S	S		S	S			S									T	T	T	T											S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		363	.	.	.	.						.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		681	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	L	P	E	L	P	Q	P	E	S	A	G	Q	L	W	L	T	V	R	V	V	Q	P	N	A	T	A	W	S	E	A	G	H	I	S	A	W	Q	Q	W	R	L	A	E	N	L	S	V	T	L	P	A	A	S	H	A	I	P	H	L	T	T	S	E	M	D	F	C	I	E	L	G	N	K	R	W	Q	F	N
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	D	V	R	S	F	E	D	Y	R	V	I	E	H	I	V	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	N	V	K	Q	T	N	S	A	Q	S	S	P	V	V	P	H	R	N	G	D	A	Q	L	S	D	R	K	V	S	A	T	L	P
Template Known Secondary structure					T	T	S	T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		T	T		B			S	S							B	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
		761	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Q	S	G	F	L	S	Q	M	W	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	L	S	W	N	V	I	R	L	G	K
Template Known Secondary structure		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.