Job Description P00722 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:50 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 542 % Identity 24% Template c1bhgB_ PDB info PDB header:glycosidase Chain: B: PDB Molecule:beta-glucuronidase; PDBTitle: human beta-glucuronidase at 2.6 a resolution Resolution 2.53 Å

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		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.				.	.	70	.	.	.	.	.	.	.				.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.											.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.											.	.	.
Query Sequence		P	S	Q	Q	L	R	S	L	N	G	E	W	R	F	A	W	F	P	A	P	.	.	.	E	A	V	P	E	S	W	L	E	C	.	.	.	D	L	P	E	A	D	T	V	V	V	P	S	N	W	Q	M	H	G	Y	D	A	P	I	Y	T	N	V	T	Y	P	I	T	V	N	P	P	F	V	P	T	E	N	P	T
Query Conservation																						.	.	.											.	.	.
Alig confidence																						.	.	.											.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	R	E	C	K	E	L	D	G	L	W	S	F	R	A	D	F	S	D	N	R	R	R	G	F	E	E	Q	W	Y	R	R	P	L	W	E	S	G	P	T	V	D	M	P	V	P	S	S	F	N	D	I	S	Q	D	W	R	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	F	V	G	W
Template Known Secondary structure		S	S			B					S									S	S	S	S		T	G	G	G	G	T	T	T	S	S						S							S	S	B		G	G	G	T	S	S		S	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.																.	.	.	.	.
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.			.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.					.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.																																															.	.	.	.
Query SS confidence																.	.																																															.	.	.	.
Query Sequence		G	C	Y	S	L	T	F	N	V	D	E	S	W	L	.	.	Q	E	G	Q	T	R	I	I	F	D	G	V	N	S	A	F	H	L	W	C	N	G	R	W	V	G	Y	G	Q	D	S	R	L	P	S	E	F	D	L	S	A	F	L	R	A	G	.	.	.	.	E	N	R	L	A	V	M	V	L	R	W	S	D	G
Query Conservation																.	.																																															.	.	.	.
Alig confidence																.	.																																															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	W	Y	E	R	E	V	I	L	P	E	R	W	T	Q	D	L	R	T	R	V	V	L	R	I	G	S	A	H	S	Y	A	I	V	W	V	N	G	V	D	T	L	E	H	E	G	G	Y	L	P	F	E	A	D	I	S	N	L	V	Q	V	G	P	L	P	S	R	L	R	I	T	I	A	I	N	N	T	L	T	P
Template Known Secondary structure												G	G	G	S	S	S	T	T	S	B					B	S			S	S							T	T									S	S			B				S	S		T	T		S	S		T	T															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		196	.	.	.	200	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	L	E	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	W	R	M	S	G	I	F	R	D	V	S	L	L	H	K	P	T	T	Q	I	S	D	F	H	V	A	T	R	F	N	D	D	F	S	R	A	V	L	E	A	E	V	Q	M	C	G	E	L	R	D
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.
Template Sequence		T	T	L	P	P	G	T	I	Q	Y	L	T	D	T	S	K	Y	P	K	G	Y	F	V	Q	N	T	Y	F	D	F	F	N	Y	A	G	L	Q	R	S	V	L	L	Y	T	T	P	T	T	Y	I	D	D	I	T	V	T	T	S	V	E	Q	D	.	.	.	.	S	G	L	V	N	Y	Q	I	S	V	K	G	S	N
Template Known Secondary structure		T	S	S	S										S	S	S	S		T	T								S	S	S					S	B		S		B		B			B		S	S				B					B			S	S	S	.	.	.	.	S	B		B					B				S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240					.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320			.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.
Query SS confidence																																																																					.	.
Query Sequence		Y	L	R	V	T	V	S	L	W	Q	G	E	T	Q	V	A	S	G	T	A	P	F	G	G	E	I	I	D	E	R	G	G	Y	A	D	R	V	T	L	R	L	N	V	E	N	P	K	L	W	S	A	E	I	P	N	L	Y	R	A	V	V	E	L	H	T	A	D	.	.	G	T	L	I	E	A	E	A	C	D	V
Query Conservation																																																																					.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	K	L	E	V	R	L	L	D	A	E	N	K	V	V	A	N	G	T	G	T	Q	G	Q	L	K	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	S	L	W	W	P	Y	L	M	H	E	R	P	A	Y	L	Y	S	L	E	V	Q	L	T	A	Q	T	S	L	G	P	V	S	D	F	Y	T	L	P	V
Template Known Secondary structure										B		S	S	S		B				B		S	S	S					B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S							T	T	S	S	S	S		S														S	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.											.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	R	E	V	R	I	E	N	G	L	L	L	L	N	G	K	P	L	L	I	R	G	V	N	R	H	E	H	H	P	L	H	G	Q	V	M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	S	H	Y	P	N	H	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	I	R	T	V	A	V	T	K	S	Q	F	L	I	N	G	K	P	F	Y	F	H	G	V	N	K	H	E	D	A	D	I	R	G	K	G	F	D	W	P	L	L	V	K	D	F	N	L	L	R	W	L	G	A	N	A	F	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	V	M	Q	M	C	D	R	Y	G	I	V	V	I
Template Known Secondary structure										S	S					T	T															T	T	T	T	T																		T							T	T	S			S	T							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.						.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	P	M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	.	.	.	.	.	S	G	H	G	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																																								.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.
Template Sequence		D	E	C	P	G	V	G	L	.	.	.	.	A	L	P	Q	F	F	N	N	V	S	L	H	H	H	M	Q	V	M	E	E	V	V	R	R	D	K	N	H	P	A	V	V	M	W	S	V	A	N	E	P	A	S	H	L	E	S	A	G	Y	Y	L	K	M	V	I	A	H	T	K	S	L	D	P	S	R	P	V	T
Template Known Secondary structure					S					.	.	.	.		S	G	G	G	G	S																			T	T		T	T									S			T	T	S	T	T													T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.					.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.						.	.	.	500	.	.	.						.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.								.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.								.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	G	G	G	A	D	T	T	A	.	.	.	.	.	T	D	I	I	C	P	M	.	.	.	.	.	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	H	A	M	G	N	S	L	G	G	F	A	K	Y	W	Q	A
Query Conservation												.	.	.	.	.								.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.								.	.	.	.	.																											.	.										.	.	.
Template Conservation																																																							.	.										.	.	.
Template Sequence		F	V	S	N	S	N	Y	A	A	D	K	G	A	P	Y	V	D	V	I	C	L	N	S	Y	Y	S	W	Y	H	D	Y	G	H	L	E	L	I	Q	L	Q	L	A	T	Q	F	E	N	W	Y	K	K	Y	Q	.	.	K	P	I	I	Q	S	E	Y	G	.	.	.	A	E	T	I	A	G	F	H	Q	D	P	P	L
Template Known Secondary structure						S		T	T	T		S	S	T	T	T		S	S							B	T	T	T	B	S	T	T																						.	.	S									.	.	.					T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.										.	.	.
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.			.	.	.	.	.	.	540	.	.				.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.
		557	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.		.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.			.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.																														.	.
Query SS confidence																						.																														.	.
Query Sequence		F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	.	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	R	Q	F	C	M	N	.	.	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F	F
Query Conservation																						.																														.	.
Alig confidence							.															.																														.	.
Template Conservation							.
Template Sequence		M	F	T	E	E	.	Y	Q	K	S	L	L	E	Q	Y	H	L	G	L	D	Q	K	R	R	K	Y	V	V	G	E	L	I	W	N	F	A	D	F	M	T	E	Q	S	P	T	R	V	L	G	N	K	K	G	I	F	T	R	Q	R	Q	P	K	S	A	A	F	L	L	R	E	R	Y	W	K	I
Template Known Secondary structure		T	T				.																	T	T	T	T									S	B		B					B	T	T	B	S	S	S	B				S	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		556	.	.	.	560		.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.