Job Description P0A9P4 Confidence 99.77% Date Thu Jan 5 11:10:53 GMT 2012 Rank 105 Aligned Residues 303 % Identity 19% Template c3gwdA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:cyclohexanone monooxygenase; PDBTitle: closed crystal structure of cyclohexanone monooxygenase Resolution 2.30 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	60
Predicted Secondary structure																												.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	T	K	H	S	K	L	L	I	L	G	S	G	P	A	G	Y	T	A	A	V	Y	A	A	R	A	.	N	L	Q	P	V	L	I	T	G	M	E	K	G	G	Q	L	T	T	T	T	E	V	E	N	W	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	N	D	L
Query Conservation																												.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	H	T	V	D	A	V	V	I	G	A	G	F	G	G	I	Y	A	V	H	K	L	H	H	E	L	G	L	T	T	V	G	F	D	K	A	D	G	P	G	G	T	W	Y	W	N	R	Y	P	G	A	L	S	D	T	E	S	H	L	Y	R	F	S	F	D	R	D	L	L	Q	E	S	T	W	K	T	T	Y	I
Template Known Secondary structure														S													T	S									S	S	S	S	S		T								T	T							T	T	T	S	S			S											S	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.							.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.			.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.																																					.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.																																					.	.
Query Sequence		T	G	P	L	L	M	E	R	M	H	E	H	A	T	K	F	E	T	.	.	.	.	.	.	E	I	I	F	D	H	I	N	K	V	D	L	Q	N	R	P	F	R	L	N	G	D	N	G	E	Y	T	C	D	A	L	I	I	A	T	G	.	.	A	S	A	R	Y	L	G	L	P	S	E	E	A	F	K	G	R	G
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.																																					.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	Q	P	E	I	L	E	Y	L	E	D	V	V	D	R	F	D	L	R	R	H	F	K	F	G	T	E	V	T	S	A	L	Y	L	D	D	E	N	L	W	E	V	T	T	D	H	G	E	V	Y	R	A	K	Y	V	V	N	A	V	G	L	L	S	A	I	N	F	P	N	L	P	G	L	D	T	F	E	G	E	T
Template Known Secondary structure																	T	T		G	G	G			T	T										T	T	T	T							T	T	S														S	S		S	B						T	T	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	S	A	C	A	T	C	D	G	F	F	Y	R	N	Q	K	V	A	V	I	G	G	G	N	T	A	V	E	E	A	L	Y	L	S	N	I	A	S	E	V	H	L	I	H	R	R	D	G	F	R	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	H	T	A	A	W	P	E	G	K	S	L	A	G	R	R	V	G	V	I	G	T	G	S	T	G	Q	Q	V	I	T	S	L	A	P	E	V	E	H	L	T	V	F	V	R	T	P	Q	Y	S	V	P	V	G	N	R	P	V	N	P	E	Q	I	A	E	I	K	A	D	Y	D	R	I	W	E	R	A	K	N	S
Template Known Secondary structure				G	G	G			T	T				T	T	S								S														S	S							S	S											B												T										T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	V	A	F	G	F	E	E	S	T	L	P	A	M	S	V	S	E	E	E	R	N	R	I	F	Q	E	A	W	D	H	G	G	G	F	R	F	M	F	G	T	F	G	D	I	A	T	D	E	A	A	N	E	A	A	A	S	F	I	R	A	K	V	A	E	I	I	E	D	P	E	T	A	R	K	L	M	P	K	G
Template Known Secondary structure		S	S		S	S	S							S	T	T	S																								S	S		S		T	T	T																						S											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
							185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.			.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																					.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																					.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	K	I	L	I	K	R	L	M	D	K	V	E	N	G	N	I	I	L	H	T	.	.	N	R	T	L	E	E	V	T	G	D	Q	M	G	V	T	G	V	R	L	R	D	T	Q	N	S	D	N	I	E	S	L	D	V	A	G	L	F	V	A	I	G	H	S	P	N	T	A	I	F	E	G	Q	L
Query Conservation		.	.	.	.	.																					.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																					.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	A	K	R	P	L	C	D	S	G	Y	Y	E	V	Y	N	R	P	N	V	E	A	V	A	I	K	E	N	P	I	R	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	K	G	V	V	T	E	D	G	V	L	H	E	L	D	V	L	V	F	A	T	G	F	D	A	V	D	G	N	Y	R	R	I	E
Template Known Secondary structure			S		S	S					S	S	T	G	G	G	G	G	S	T	T						T	T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T					T	T	S						S								B			S	S					T	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.												.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.							270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	E	N	G	Y	I	K	V	Q	S	G	.	.	.	.	.	.	I	H	G	N	A	T	Q	T	S	I	P	G	V	F	A	A	G	D	V	M	D	H	I	Y	R	Q	A	I	T	S	A	G	T	G	C	M	A	A	L	D	A	E	R	Y	L	D	G
Query Conservation														.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	R	G	R	D	G	L	H	I	N	D	H	W	D	G	Q	P	T	S	Y	L	G	V	S	T	A	N	F	P	N	W	F	M	V	L	G	P	N	G	P	F	T	N	L	P	P	S	I	E	T	Q	V	E	W	I	S	D	T	I	G	Y	A	E	R	N
Template Known Secondary structure					G	G	G		B					T	S	S	S				B	T	T	T	B		T	T		T	T				S	S		S	S				S	S																						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.