Job Description P54746 Confidence 99.29% Date Thu Jan 5 12:06:04 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 244 % Identity 16% Template d2b5dx2 SCOP info 7-stranded beta/alpha barrel Glycoside hydrolase/deacetylase AmyC N-terminal domain-like Resolution 2.20

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.													.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	H	I	T	P	H	M	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	D	R	E	W	Y	F	T	T	E	E	S	R	I	L	L	V	N	N	M	E	E	I	L	C	R	L	E	Q	D	N	E	Y	K	Y	Y	V	L	D	G	Q	T	A	I	L	E	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.																								.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		K	I	L	I	F	L	H	A	H	L	P	Y	V	H	H	P	E	Y	D	H	F	L	E	E	R	W	L	.	.	.	.	.	.	F	E	A	I	T	E	T	Y	I	P	L	L	M	M	F	D	E	I	E	D	F	R	L	.	T	M	S	I	T	P	P	L	M	E	M	L	S	S	R	D	L	Q	E	K	Y	E	R
Template Known Secondary structure																	T	T		S	S		T	T					.	.	.	.	.	.							T											S	S					.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30							.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.		.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
																																											63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.		.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.			.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	V	K	P	E	N	K	D	R	V	K	K	Q	V	E	A	G	K	L	I	I	.	G	P	W	Y	T	Q	T	D	T	T	I	V	S	.	.	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	M	E	K	L	I	E	L	A	N	K	E	V	E	R	T	K	K	E	H	P	L	K	H	K	M	A	K	F	Y	R	E	H	F	E	K	I	L	N	V	F	R	S	Y	D	G	N	I	L	E	G	F	K	K	Y	Q	E	T	G	K	L	E	I	V	T	C	N	A	T	H	A	F	L	P	L	Y	Q	M	Y	P
Template Known Secondary structure																	T	T	T	S																									T	T	T		T											T	S								T	T				G	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.		.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150			.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.		.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.																																					.	.															.
Query SS confidence																		.																																					.	.															.
Query Sequence		E	S	I	V	R	N	L	M	Y	G	M	R	D	C	L	A	.	F	G	E	P	M	K	I	G	Y	L	P	D	S	F	G	M	S	G	Q	L	P	H	I	Y	N	G	F	G	I	T	R	T	M	F	W	R	.	.	G	C	S	E	R	H	G	T	D	K	T	E	F	L	.	W	Q	S	S	D	G	S	E	V	T
Query Conservation																		.																																					.	.															.
Alig confidence																		.														.																							.	.															.
Template Conservation																																.
Template Sequence		E	V	V	N	A	Q	I	T	V	G	V	K	N	Y	E	K	H	M	K	K	H	P	R	G	I	W	L	A	E	C	.	G	Y	Y	Q	G	L	D	L	Y	L	A	Q	N	N	V	E	Y	F	F	V	D	S	H	A	F	W	F	A	D	E	Q	P	R	Y	G	V	Y	R	P	I	M	T	P	S	G	V	F	A	F
Template Known Secondary structure																				S	S			S					G	G	G	.		B		T	T								T	T								T					T	S	S	S			T	T	G	G	G	S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.		.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		175																																							.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	L	P	L	G	Y	A	I	G	K	Y	L	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	D	P	E	S	S	E	Q	V	W	S	A	A	V	G	Y	P	G	D	P	R	Y	R	E	F	Y	R	D	I	G	F	D	R	E	M	E	Y	I	K	D	Y	I	D	P	S	G	V	R	I	N	T	G	I	K	Y	H	R	I	T	S	K	S	L	D	A	S	Q	K	E	Y	Y	D	I	D	L	A	M	E	A
Template Known Secondary structure					G	G	G		G	G	G	G		T	T	T	S	G	G	G		T	T	S	B		T	T							S						G	G	G	S		T	T	S						S				B	B			S	S		S		G	G	G			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
						191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																														.																						.
Query SS confidence		.	.	.	.																														.																						.
Query Sequence		.	.	.	.	D	E	N	G	L	R	K	R	L	D	S	Y	F	D	V	L	E	K	A	S	V	T	K	E	I	L	L	P	N	.	G	H	D	Q	M	P	L	Q	Q	N	I	F	E	V	M	D	K	L	R	E	I	.	Y	P	Q	R	K	F	V	M	S	R	F	E	E	V	F	E	K
Query Conservation		.	.	.	.																														.																						.
Alig confidence		.	.	.	.																														.																						.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	E	H	A	R	D	F	L	H	K	K	E	S	Q	A	R	R	L	M	D	I	M	G	V	E	P	V	I	V	A	P	F	D	A	E	L	F	G	H	W	W	F	E	G	V	F	F	L	K	R	F	F	E	L	V	N	E	S	K	D	L	K	L	V	T	A	S	E	V	I	D	T
Template Known Secondary structure																									S	S										G	G	G	B	T	T	T	B	T	T																S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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