Job Description P0AES0 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:24:04 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 561 % Identity 33% Template c2vpmB_ PDB info PDB header:ligase Chain: B: PDB Molecule:trypanothione synthetase; PDBTitle: trypanothione synthetase Resolution 2.8 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	P	F	G	T	L	L	G	Y	A	P	G	G	V	A	I	Y	S	S	D	Y	S	S	L	D	P	Q	E	Y	E	D	D	A	V	F	R	S	Y	I	D	D	E	Y	M	G	H	K	W	Q	C	V	E	F	A	R	R	F	L	F	L	N	Y	G	V	V	F	T	D	V	G	M	A	W	E	I	F	S	L	R
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	I	P	F	G	A	V	Q	G	Y	A	P	G	G	V	P	A	Y	S	N	K	H	D	H	Y	F	S	G	E	.	.	.	.	.	.	.	R	N	I	E	D	N	I	F	F	G	F	K	Y	Q	C	V	E	F	A	R	R	W	L	L	V	R	K	G	L	L	L	P	D	V	N	W	A	C	H	I	F	Q	L	K
Template Known Secondary structure					T	T							T	T	T							S	S	T	T						.	.	.	.	.	.	.					T	T						T	T															S							S	S	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.								.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	L	R	E	V	V	N	D	N	I	L	P	L	Q	A	F	P	N	G	S	P	R	A	P	V	A	G	A	L	L	I	W	D	K	G	G	E	F	K	D	T	G	H	V	A	I	I	T	Q	L	H	G	N	K	V	R	I	A	E	Q	N	V	I	H	S	P	L	P	Q	G	Q	Q	W	T	R	E	L	E	M	V
Query Conservation
Alig confidence																																							.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		E	V	R	D	A	A	T	T	E	S	F	A	V	L	Q	V	R	N	G	T	T	T	K	P	E	A	D	A	L	L	V	Y	P	S	T	D	A	.	N	P	V	G	H	V	G	T	I	T	E	V	G	D	D	Y	V	C	V	A	D	Q	N	Y	R	F	H	K	W	E	S	S	C	A	Y	K	L	K	L	D	H	R
Template Known Secondary structure						T	T	T											S	S	B	S					S	S								B	T	T	.	B	T	T											S	S							S	S	S			S			S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.		.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.				.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.											.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	N	G	C	Y	T	L	K	D	T	F	D	D	T	T	I	.	.	.	L	G	W	M	I	Q	T	E	D	T	E	Y	S	L	P	Q	P	E	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	L	L	K	I	S	G	A	R	L	E	N	K	G	Q	F	D	G	K	W	L	D	E	K	D	P	L	Q	N
Query Conservation																			.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation		.	.																																																																	.	.
Template Sequence		.	.	D	G	I	W	T	I	I	D	D	I	D	A	D	E	I	E	I	P	L	G	W	L	T	F	P	G	R	A	N	R	P	E	G	A	P	P	V	A	L	H	P	S	L	H	F	K	E	P	P	K	P	Y	L	L	R	R	N	F	L	P	T	E	S	K	.	.	A	N	W	L	D	M	N	N	P	A	E	R
Template Known Secondary structure		.	.	T	T						B		S	S	T	T	S		B									T	T						T	T								G	G	G	S																	S	S			.	.	S	S		S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																																	.	.
Template SS confidence
				168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.			.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Y	V	Q	A	N	G	Q	V	I	N	Q	D	P	Y	H	Y	Y	T	I	T	E	S	A	E	Q	E	L	I	K	A	T	N	E	L	H	L	M	Y	L	H	A	T	D	K	V	L	K	D	D	N	L	L	A	L	F	D	I	P	K	I	L	W	P	R	L	R	L	S	W	Q	R	R	R	H	H	M	I	T	G
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																																																															.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.																																																															.
Template Sequence		L	F	V	E	E	F	G	.	.	.	.	.	.	V	V	S	Y	Y	E	S	N	H	E	F	H	L	R	C	V	A	Y	G	T	Q	L	H	A	I	F	M	E	A	T	A	Q	V	I	E	S	D	E	K	L	R	L	F	A	I	P	E	E	F	W	P	R	I	R	H	S	W	K	Y	Q	Q	T	.	Y	I	S	G
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.																																			T								T	T			G	G	G														.		S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																																																															.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250							.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.		.	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.			.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.			.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure												.	.																																.	.
Query SS confidence												.	.																																.	.
Query Sequence		R	M	D	F	C	M	D	E	R	G	.	.	L	K	V	Y	E	Y	N	A	D	S	A	S	C	H	T	E	A	G	L	I	L	E	R	W	A	E	Q	G	Y	K	G	.	.	N	G	F	N	P	A	E	G	L	I	N	E	L	A	G	A	W	K	H	S	R	A	R	P	F	V	H	I	M	Q	D	K	D	I	E
Query Conservation												.	.																																.	.
Alig confidence												.	.																																.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	F	D	F	A	F	N	N	E	T	G	E	V	K	C	F	E	Y	N	A	D	S	A	S	T	L	L	E	C	G	L	I	Q	Q	K	W	A	E	S	V	G	L	D	K	Q	D	T	R	G	S	G	F	A	V	E	R	N	L	K	M	A	W	A	N	S	G	A	T	G	R	V	H	F	C	V	D	E	E	R	E
Template Known Secondary structure									T	T	T										T	T			T	T						T										T				T	T				G	G	G	G												S				S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	Y	H	A	Q	F	M	E	Q	A	L	H	Q	A	G	F	E	T	R	I	L	R	G	L	D	E	L	G	W	D	A	A	G	Q	L	I	D	G	E	G	R	L	V	N	C	V	W	K	T	W	A	W	E	T	A	F	D	Q	I	R	E	V	S	D	R	E	F	A	A	V	P	I	R	T	G	H	P	Q	N
Query Conservation
Alig confidence																																																																								.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		E	Q	Y	T	A	L	Y	C	M	Q	A	A	E	A	V	G	L	E	G	K	L	C	I	L	F	D	E	F	R	F	D	D	N	G	H	V	V	D	S	D	G	V	R	V	R	N	V	W	K	T	W	M	W	E	S	A	I	T	D	Y	Y	A	A	R	E	E	R	G	E	N	.	W	K	P	S	P	K	D	K	V
Template Known Secondary structure															T	T	T								T	T	T	T					T	T	S					T	T			B							S	S																		T	T	.					T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.		.	.	480	.	.	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	R	L	I	D	V	L	L	R	P	E	V	L	V	F	E	P	L	W	T	V	I	P	G	N	K	A	I	L	P	I	L	W	S	L	F	P	H	H	R	Y	L	L	D	T	D	F	T	V	N	D	E	L	V	K	T	G	Y	A	V	K	P	I	A	G	R	C	G	S	N	I	D	L	V	S	H	H	E	E
Query Conservation
Alig confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	C	D	L	L	L	G	D	D	W	E	I	L	Y	F	E	P	M	W	K	V	I	P	S	N	K	A	I	L	P	M	I	Y	H	N	H	P	E	H	P	A	I	L	K	A	E	Y	E	L	T	D	E	L	R	K	H	G	Y	A	K	K	P	I	V	N	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	S	S		T	T	S				S		G	G	G	G	T	T	T	S	G	G	G									T	T		T	T						S	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	D	K	T	S	G	K	F	A	E	Q	K	N	I	Y	Q	Q	L	W	C	L	P	K	V	D	G	K	Y	I	Q	V	C	T	F	T	V	G	G	N	Y	G	G	T	C	L	R	G	D	E	S	L	V	I	K	K	E	S	D	I	E	P	L	I	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Y	Q	Q	L	F	E	L	K	K	Q	D	D	Y	Y	A	I	I	G	G	W	M	I	G	D	A	F	S	G	T	G	I	R	E	D	K	S	V	I	T	G	V	D	S	P	F	A	A	V	R	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											B	T	T	B										T	T											S	S				G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.