Job Description P31552 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:48:13 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 370 % Identity 22% Template c3e53A_ PDB info PDB header:ligase Chain: A: PDB Molecule:fatty-acid-coa ligase fadd28; PDBTitle: crystal structure of n-terminal domain of a fatty acyl amp2 ligase faal28 from mycobacterium tuberculosis Resolution 2.35 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.					.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.
Query Sequence		Q	H	L	R	Q	M	W	D	D	L	A	D	V	Y	G	H	K	T	A	L	I	C	.	.	.	.	E	S	S	G	G	V	V	N	R	Y	S	Y	L	E	L	N	Q	E	I	N	R	T	A	N	L	F	Y	T	L	G	I	R	K	G	D	K	V	A	L	H	L	D	N	C	P	E	F	I	F	C	W	F	G	L
Query Conservation																								.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.																															.
Template Conservation																																																										.
Template Sequence		R	S	L	P	A	A	L	R	A	C	A	R	L	Q	P	H	D	P	A	F	T	F	X	D	Y	E	Q	D	W	D	G	V	A	I	T	L	T	W	S	Q	L	Y	R	R	T	L	N	V	A	Q	E	L	S	R	C	G	.	S	T	G	D	R	V	V	I	S	A	P	Q	G	L	E	Y	V	V	A	F	L	G	A
Template Known Secondary structure															S	T	T	S									S	S		S	S																							T	T	S	S	.		T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	I	G	A	I	M	V	P	I	N	A	R	L	L	C	E	E	S	A	W	I	L	Q	N	S	Q	A	C	L	L	V	T	S	A	Q	F	Y	P	M	Y	Q	Q	I	Q	Q	E	D	A	T	Q	L	R	H	I	C	L	T	D	V	A	L	P	A	D	D	G	V	S	S	F	T	Q	L	K	N	Q	Q	P	A
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Q	A	G	R	I	A	V	P	L	S	V	P	Q	R	.	.	.	S	D	S	V	L	S	D	S	S	P	V	A	I	L	T	T	S	S	A	V	D	D	V	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	V	P
Template Known Secondary structure				T	T												.	.	.	T	T									S						T	T	T						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.				.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.																																			.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.					.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.
Query Sequence		T	L	C	Y	A	P	P	L	S	T	D	D	T	A	E	I	L	F	T	S	G	T	T	S	R	P	K	G	V	V	I	T	H	Y	N	L	R	F	A	G	Y	Y	S	A	W	Q	C	A	L	.	.	.	.	R	D	D	D	V	Y	L	T	V	M	P	A	F	H	I	D	C	Q	C	T	A	A	M	A	A	F	S
Query Conservation																																																			.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	S	I	I	E	V	D	L	L	D	L	D	A	P	E	Y	P	S	T	A	Y	L	Q	Y	T	P	A	G	V	V	X	S	H	Q	N	V	R	V	N	F	E	Q	L	X	S	G	Y	F	A	D	G	I	P	P	P	N	S	A	L	V	S	W	L	P	F	Y	H	D	X	G	L	V	I	G	I	C	A	P	I	L
Template Known Secondary structure							G	G	G	S		T	T						S																																					T	T									T	T	S								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250				.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.						.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure														.	.	.																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	A	T	F	V	L	V	E	K	Y	S	.	.	.	A	R	A	F	W	G	Q	V	Q	K	Y	R	A	T	V	T	E	C	I	P	M	M	I	R	T	L	M	V	Q	P	P	S	A	N	D	.	.	.	.	.	Q	Q	H	R	L	R	E	V	M	F	Y	L	N	L	S	E	Q	E	K	D	A	F	C	E	R
Query Conservation														.	.	.																																				.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	G	Y	P	A	V	L	T	S	P	V	S	F	L	Q	R	P	A	R	W	X	H	L	X	A	S	D	F	H	A	F	S	A	A	P	N	F	A	F	E	L	A	A	R	R	T	T	D	D	D	X	A	G	R	D	L	G	N	I	L	T	I	L	S	G	S	E	R	V	Q	A	A	T	I	K	R	F	A	D	R
Template Known Secondary structure			T															T								S	S	S	S																				T	T	T	T	T	T				T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
								311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	F	G	V	R	L	L	T	S	Y	G	M	T	E	T	I	V	G	I	I	G	D	R	P	G	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	W	P	S	I	G	R	V	G	F	C	Y	E	A	E	I	R	D	D	H	N	R	P	L	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	R	F	N	L	Q	E	R	V	I	R	P	S	Y	G	L	A	E	A	T	V	Y	V	A	T	S	K	P	G	Q	P	P	E	T	V	D	F	D	T	E	S	L	S	A	G	H	A	K	P	C	A	G	A	T	S	L	I	S	Y	X	L	P	R	S	P	I	V	R	I	V	D	S	D	T	C	I	E	C	P
Template Known Secondary structure				T	T	T			G	G	G								G	G	G	S	S							T	T	S														T	T	B																	S	S	S							T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.												.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	E	I	G	E	I	C	I	K	G	I	P	G	K	T	I	F	K	E	Y	F	L	N	P	Q	A	T	A	K	V	L	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	W	L	H	T	G	D	T	G	Y	R	D	E	E	D	F	F	Y	F	V	D
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation														.	.	.																																												.
Template Sequence		D	G	T	V	G	E	I	W	V	H	G	D	.	.	.	N	V	A	N	G	Y	W	Q	K	P	D	E	S	E	R	T	F	G	G	K	I	V	T	P	S	P	G	T	P	E	G	P	W	L	R	T	G	D	S	G	F	V	T	.	D	G	K	X	F	I	I	G
Template Known Secondary structure		T	T	B								S	T	.	.	.	T	S				B	T	T											B			B	S			T	T						B											.	T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																																												.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.				.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.		.	.	.	.	.	.	.	.