Job Description P76092 Confidence 99.39% Date Thu Jan 5 12:18:46 GMT 2012 Rank 438 Aligned Residues 254 % Identity 17% Template d1ivya_ SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Serine carboxypeptidase-like Resolution 2.20

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.		70
Predicted Secondary structure																				.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query SS confidence																				.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Query Sequence		F	F	T	T	S	D	N	T	A	L	F	Y	R	H	W	P	A	L	.	Q	P	G	A	K	K	V	I	V	L	F	H	R	G	H	E	H	S	G	R	L	Q	H	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	L	A	M	P	D	T	A	F	Y	A	W	D	A	R	.	G
Query Conservation																				.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Alig confidence																				.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.										.
Template Conservation																																																																						.
Template Sequence		Y	L	K	S	S	G	S	K	H	L	H	Y	W	F	V	E	S	Q	K	D	P	E	N	S	P	V	V	L	W	L	N	G	G	P	G	C	S	S	L	D	G	L	L	T	E	H	G	P	F	L	V	Q	P	D	G	V	T	L	E	Y	N	P	Y	S	W	N	L	I	.	A	N	V	L	Y	L	E	S	P	A	G
Template Known Secondary structure						S	T	T											S	S		G	G	G	S									T	T	T	B		T						T	T	T	S	S					T	T	S	S						T	T		G	G	G	S	.	S								S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.		.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
		71	.	.	.	.	.		.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.					120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.																											.																		.	.	.	.
Query SS confidence								.																											.																		.	.	.	.
Query Sequence		H	G	K	S	S	G	.	P	R	G	Y	S	P	S	L	A	R	S	V	R	D	V	D	E	F	V	R	F	A	A	S	D	S	.	Q	V	G	L	E	E	V	V	V	I	A	Q	S	V	G	A	V	.	.	.	.	L	V	A	T	W	I	H	D	Y	A	P	A	I	R	G	L	V	L	A	S	P	A	F	K	V
Query Conservation								.																											.																		.	.	.	.
Alig confidence								.																											.																		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	G	F	S	Y	S	D	D	K	F	Y	A	T	N	D	T	E	V	A	Q	S	N	F	E	A	L	Q	D	F	F	R	L	F	P	E	Y	K	N	N	K	L	F	L	T	G	E	S	Y	A	G	I	Y	I	P	T	L	A	V	L	V	M	Q	D	P	S	M	N	L	Q	G	L	A	V	G	N	G	L	S	S	Y
Template Known Secondary structure		S	T	T				S	S						B																			S	G	G	G	T	T	S								T	T													T	T		T	T	S									S			S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	L	Y	V	P	L	A	R	P	A	L	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	Q	N	D	N	S	L	V	Y	F	A	Y	Y	H	G	L	L	G	N	R	L	W	S	S	L	Q	T	H	C	C	S	Q	N	K	C	N	F	Y	D	N	K	D	L	E	C	V	T	N	L	Q	E	V	A	R	I	V	G	N	S	G	L	N	I	Y	N	L	Y	A	P	C	A	G	G	V	P	S	H	F	R	Y
Template Known Secondary structure															T	T	S	S															T	T					S	S																			S	S	S			T	T		T	T	S			T	T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
																																															158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.						.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	H	R	L	R	G	L	F	F	I	N	S	Y	V	K	G	.	.	.	.	.	R	Y	L	T	H	D	R	Q	R	G	A	S	F	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	D	T	V	V	V	Q	D	L	G	N	I	F	T	R	L	P	L	K	R	M	W	H	Q	A	L	L	R	S	G	D	K	V	R	M	D	P	P	C	T	N	T	T	A	A	S	T	Y	L	N	N	P	Y	V	R	K	A	L	N	I	P	E	Q	L	P	Q	W	D	M	C	N	F	L	V	N	L	Q	Y	R
Template Known Secondary structure			T	T								S		S	S	T	T	S							G	G	G					T								T	T											T	S							T	T			T	T	S					S	B									B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	D	P	L	I	T	R	A	I	A	V	N	I	L	L	D	L	Y	K	T	S	E	R	I	I	R	D	A	A	A	I	T	L	P	T	Q	L	L	I	S	G	D	D	Y	V	V	H	R	Q	P	Q	I	D	F	Y	Q	R	L	R	S	P	L	K	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	Y	R	S	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	Q	Y	L	K	L	L	S	S	Q	K	Y	Q	I	L	L	Y	N	G	D	V	D	M	A	C	N	F	M	G	D	E	W	F	V	D	S	L	N	Q	K	M	E	V	Q	R	R	P	W	L	V	K	Y	G	D	S	G	E	Q	I
Template Known Secondary structure					S	B	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T										T	T		S	S	S												T																T	T	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.															350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
														253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	L	P	G	F	Y	H	D	T	L	G	E	E	N	R	A	L	A	F	E	K	M	Q	S	F	I	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																												.
Template Sequence		A	G	F	V	K	E	F	S	H	I	A	F	L	T	I	K	G	A	G	H	M	V	P	T	D	K	.	P	L	A	A	F	T	M	F	S	R	F	L	N
Template Known Secondary structure									S	S							T	T			S	S						.													T
Template Predicted Secondary structure																												.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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