Job Description P33195 Confidence 99.44% Date Thu Jan 5 11:51:15 GMT 2012 Rank 150 Aligned Residues 333 % Identity 17% Template d1ohwa_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases GABA-aminotransferase-like Resolution 2.30

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		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560			.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.
Query SS confidence																																																																.	.
Query Sequence		D	L	A	L	N	Q	A	M	I	P	L	G	S	C	T	M	K	L	N	A	A	A	E	M	I	P	I	T	W	P	E	F	A	E	L	H	P	F	C	P	P	E	Q	A	E	G	Y	Q	Q	M	I	A	Q	L	A	D	W	L	V	K	L	T	.	.	G	Y	D	A	V	C	M	Q	P	N	S	G	A	Q	G	E
Query Conservation																																																																.	.
Alig confidence																.	.	.	.																							.																						.	.
Template Conservation																.	.	.	.																							.
Template Sequence		D	L	Y	S	Q	I	S	S	I	P	I	G	Y	S	.	.	.	.	H	P	A	L	V	K	L	V	Q	Q	P	Q	N	V	S	T	F	I	N	R	P	A	.	L	G	I	L	P	P	E	N	F	V	E	K	L	R	E	S	L	L	S	V	A	P	K	G	M	S	Q	L	I	T	M	A	C	G	S	C	S	N	E
Template Known Secondary structure			S	S					T		S	S		B	T	.	.	.	.											G	G	G										.	T	T	T	S			T	T								T	G	G	G	G			T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80					.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.		.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	G	L	L	A	I	R	H	Y	H	E	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	G	H	R	D	I	C	L	I	P	A	S	A	H	G	T	N	P	A	S	A	H	M	A	G	M	Q	V	V	V	V	A	C	D	K	N	G	N	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	N	A	F	K	T	I	F	M	W	Y	R	S	K	E	R	G	Q	S	A	F	S	K	E	E	L	E	T	C	M	I	N	Q	A	P	G	C	P	D	Y	S	I	L	S	F	M	G	A	F	H	G	R	T	M	G	C	L	A	T	T	H	S	K	A	I	H	K	I	D	I	P	S	F	D	W	P	I	A	P	F
Template Known Secondary structure		.																T	T													T	T		T	T	T	S									T	T					S	S						T			S						T	T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
																								630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.		.	.	.	.	.	.	660				.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.								.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.								.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	L	T	D	L	R	A	K	A	E	Q	A	G	D	N	L	S	C	I	M	V	T	Y	.	P	S	T	H	G	V	Y	.	.	.	E	E	T	I	R	E	V	C	E	V	V	H	Q	F	G	G	Q	V	Y	L	D	G	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.								.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	R	L	K	Y	P	L	E	E	F	V	K	E	N	Q	Q	E	E	A	R	C	L	E	E	V	E	D	L	I	V	K	Y	R	K	K	K	K	T	V	A	G	I	I	V	E	P	I	Q	S	E	G	G	D	N	H	A	S	D	D	F	F	R	K	L	R	D	I	S	R	K	H	G	C	A	F	L	V	D	E	V
Template Known Secondary structure						S	S	G	G	G																										T	T										S	S	B		T	T	T		B																	T	T								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		684	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.											.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	M	N	A	Q	V	G	I	T	S	P	G	F	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	V	S	H	L	N	L	H	K	T	F	C	I	P	H	G	G	G	G	P	G	M	G	P	I	G	V	K	A	H	L	A	P	F	V	P	G	H	S	V	V	Q	I	E	G	M	L	T	R	Q	G	A	V	S
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	Q	T	G	G	G	S	T	G	K	F	W	A	H	E	H	W	G	L	D	D	P	A	D	V	M	.	.	.	.	.	.	T	F	S	K	K	M	M	T	G	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	H	K	E	E	F	R	P	N	A	P	Y	R	I	F	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	T	T		S	S	T	T	S	S	S	S	G	G	G	G	G			S	S			S			.	.	.	.	.	.				G	G	G	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G	S		S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.							.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		754	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.						800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	P	F	G	S	A	S	I	L	P	I	S	W	M	Y	I	R	M	M	G	A	E	G	L	K	K	A	S	Q	V	A	I	L	N	A	N	Y	I	A	S	R	L	Q	D	A	.	.	.	.	.	F	P	V	L	Y	T	G	R	D	G	R	V	A	H	E	C	I	L	D	I	R	P	L	K	E	E	T	G	I
Query Conservation																																																.	.	.	.	.
Alig confidence				.																								.	.	.																		.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																								.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	W	.	L	G	D	P	S	K	N	L	L	L	A	E	V	I	N	I	I	K	R	E	D	L	L	.	.	.	S	N	A	A	H	A	G	K	V	L	L	T	G	L	L	D	L	Q	A	R	Y	P	Q	F	I	S	R	V	R	G	R	G	T	F	C	S	F	D	T	P	D	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S		.	S	S																		T	T			.	.	.																						T	T	T								T	T							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.																								.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		353	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.				.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		829	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.		.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.
Predicted Secondary structure																									.
Query SS confidence																									.
Query Sequence		S	E	L	D	I	A	K	R	L	I	D	Y	G	F	H	A	P	T	M	S	F	P	V	.	A	G	T	L	M	V	E	P	T	E	S	E	S	K	V	E	L	D	R	F	I	D	A	M	L	A	I	R	A	E
Query Conservation																									.
Alig confidence																			.	.	.	.			.
Template Conservation																			.	.	.	.
Template Sequence		I	R	N	K	L	I	S	I	A	R	N	K	G	V	M	L	G	.	.	.	.	G	C	G	D	K	S	I	R	F	R	P	T	L	V	F	R	D	H	H	A	H	L	F	L	N	I	F	S	D	I	L	A	D
Template Known Secondary structure													T	T					.	.	.	.			T	T	T								T	T																			T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.					.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470