Job Description P36938 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:54:03 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 428 % Identity 20% Template c2dkdA_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:phosphoacetylglucosamine mutase; PDBTitle: crystal structure of n-acetylglucosamine-phosphate mutase,2 a member of the alpha-d-phosphohexomutase superfamily, in3 the product complex Resolution 2.10 Å

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		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.				.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure																										.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.
Query Sequence		I	A	Q	A	I	A	E	E	R	A	K	N	G	I	T	G	P	C	Y	V	G	K	D	T	.	.	.	H	A	L	S	E	P	A	F	I	S	V	L	E	V	L	A	A	N	G	V	D	V	I	V	Q	E	N	N	G	F	T	P	T	P	A	V	S	N	A	I	L	V	H	N	K	K	G	G	P	L	A	D	G
Query Conservation																										.	.	.
Alig confidence																										.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	Q	T	L	S	Q	Y	L	P	S	H	P	K	P	Q	G	V	T	F	T	Y	G	T	A	G	F	R	M	K	A	D	K	L	D	Y	V	T	F	T	V	G	I	I	A	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	K	Y	L	Q	G	K	T	V	.	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure								T	T	G	G	G					T	T						B	T	T	B					G	G	G															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T				.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.						60
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.							.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	I	T	P	S	H	N	P	P	E	D	G	G	I	K	Y	N	P	P	N	G	G	P	A	D	T	N	V	T	K	V	V	E	D	R	A	N	A	L	L	A	D	G	.	.	.	.	.	.	L	K	G	V	K	R	I	S	L	D	E	A	M	A	S	G	H	V	K	E	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	M	I	T	A	S	H	N	P	P	E	D	N	G	V	K	V	V	D	P	L	G	S	M	L	E	S	S	W	E	K	Y	A	T	D	L	A	N	A	S	P	S	P	N	S	L	V	E	V	I	K	N	L	V	S	D	L	K	I	D	L	S	I	P	A	N	V	V	I	A	R	D	S	R	E	S	S	P	A	L
Template Known Secondary structure							T	T	S		T	T									T	T	S	S	B														T	S	B	S				B													T			T	T	S										S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
																																																207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	Q	P	F	V	E	G	L	A	D	I	V	D	M	A	A	I	Q	K	A	G	L	T	L	G	V	D	P	L	G	G	S	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	M	A	T	I	D	G	F	Q	S	V	P	N	T	K	Y	Q	D	F	G	L	F	T	T	P	E	L	H	Y	V	T	R	T	L	N	D	P	D	F	G	K	P	T	E	D	G	Y	Y	S	K	L	A	K	S	F	Q	E	I	Y	T	I	C	E	S	N	N	E	K	I	D	I	T	I	D	A	A	N	G	V	G
Template Known Secondary structure											T	S	S	S																								G	G	G			S	S																			S				S										T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.					.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.
Query Sequence		I	E	Y	W	K	R	I	G	E	Y	Y	N	L	N	L	T	I	V	N	D	Q	V	D	Q	T	F	R	F	M	H	L	D	K	D	G	A	I	R	M	D	C	S	S	E	C	A	M	A	G	L	L	A	L	R	D	K	F	D	L	A	F	A	N	D	P	D	Y	D	R	H	G	I	V	.	.	.	.	T	P	A
Query Conservation																																																																											.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.
Template Sequence		A	P	K	I	Q	E	L	L	E	K	Y	L	H	K	E	I	S	F	T	V	V	N	G	D	Y	K	Q	P	N	L	L	N	F	D	C	G	.	.	A	D	Y	V	K	T	N	Q	K	L	P	K	N	V	K	P	V	N	N	K	L	Y	A	S	F	D	G	D	A	D	R	L	I	C	Y	Y	Q	N	N	D	N	K
Template Known Secondary structure													S	T	T	T							S			T	T		G	G	G	T	T	T	T		S	.	.									S			T	T					T	T								T	T	S										T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.			.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		317		.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.							.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	.	L	M	N	P	N	H	Y	L	A	V	A	I	N	Y	L	F	Q	H	R	P	Q	W	G	K	D	V	.	.	.	.	.	.	A	V	G	K	T	L	V	S	S	A	M	I	D	R	V	V	N	D	L	G	R	K	L	V	E	V	P	V	G	F	K	W	F	V	D	G	L	F	D	G	S	F	G	F	G	G
Query Conservation			.																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	K	L	L	D	G	D	K	L	S	T	L	F	A	L	F	L	Q	Q	L	F	K	Q	I	D	P	T	K	I	S	L	N	I	G	V	V	Q	T	A	Y	A	N	G	S	S	T	K	Y	V	E	D	V	L	K	I	P	V	R	C	T	P	T	G	V	K	H	L	H	H	E	A	E	N	F	D	I	G	V	Y	F
Template Known Secondary structure																							T	T	S		T	T	T											T	T	S											T	T									S	S									T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	E	S	A	G	A	S	F	L	R	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	P	W	S	T	D	K	D	G	I	I	M	C	L	L	A	A	E	I	T	A	V	T	G	K	N	P	Q	E	H	Y	N	E	L	A
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	N	G	H	G	T	V	I	F	N	P	E	A	E	K	K	I	F	D	Y	K	P	N	N	D	N	E	A	K	A	I	K	V	L	Q	N	F	S	Q	L	I	N	Q	T	V	G	.	.	.	.	.	D	A	I	S	D	L	L	A	V	L	I	V	V	H	Y	L	K	L	S	P	S	D	W	D	N	E	Y	T
Template Known Secondary structure			T	T	S																				S	S																	S		S	S	S		.	.	.	.	.																T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.						.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	R	F	G	A	P	S	Y	N	R	L	Q	A	A	A	T	S	A	Q	K	A	A	L	S	K	L	S	P	E	M	V	S	A	S	T	L	A	G	D	P	I	T	A	R	L	T	A	A	P	G	N	G	A	S	I	G	G	L	K	V	M	T	D	N	G	W	F	A	A	R	P	S	G	T	E	D	A	Y	K	I
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	.	.	.	.	L	P	N	K	L	V	K	V	I	V	P	D	R	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	T	T	N	A	E	R	T	L	V	E	P	K	G	M	Q	D	E	I	D	K	L	V	A	Q	Y	P	N	G	R	S	F	V	R	A	S	G	T	E	D	A	V	R	V
Template Known Secondary structure			.	.	.	.											S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T	T					S	T	T										T	T	S	T	T									S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		462					.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.																.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	C	E	S	F	L	G	E	E	H	R	K	Q	I	E	K	E	A	V	E	I	V	S
Query Conservation
Alig confidence												.
Template Conservation												.
Template Sequence		Y	A	E	A	D	T	Q	N	N	V	.	E	E	L	S	K	A	V	S	E	L	V	K
Template Known Secondary structure						S	S					.
Template Predicted Secondary structure												.
Template SS confidence
		523	.	.	.	.	.	.	530	.	.		.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.