Job Description P21889 Confidence 99.03% Date Thu Jan 5 11:38:40 GMT 2012 Rank 60 Aligned Residues 276 % Identity 21% Template d12asa_ SCOP info Class II aaRS and biotin synthetases Class II aaRS and biotin synthetases Class II aminoacyl-tRNA synthetase (aaRS)-like, catalytic domain Resolution 2.20

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		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.						.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.								.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Query Sequence		L	K	T	R	A	K	I	T	S	L	V	R	R	F	M	D	D	H	.	.	.	.	.	G	F	L	D	I	E	T	P	M	L	T	K	A	T	P	E	G	A	.	.	.	.	.	.	.	R	D	Y	L	V	P	S	R	V	H	K	G	K	F	Y	A	L	P	Q	S	P	Q	L	F	K	Q	L	L	M	M	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	I	A	K	Q	R	Q	I	S	F	V	K	S	H	F	S	R	Q	L	E	E	R	L	G	L	I	E	V	Q	A	P	I	L	S	R	V	G	D	G	T	Q	D	N	L	S	G	A	E	K	A	V	Q	V	K	V	K	A	L	P	D	A	Q	F	E	V	V	H	S	L	A	K	W	K	R	Q	T	L	G	Q	H
Template Known Secondary structure																																	S				T	T	S	S		S			T	T	T	T									S	S	S	T	T							S			T	T									T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
				204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.		.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																.			.
Query SS confidence		.	.																.			.
Query Sequence		.	.	S	G	F	D	R	Y	Y	Q	I	V	K	C	F	R	D	.	E	D	.	L	R	A	D	R	Q	P	E	F	T	Q	I	D	V	E	T	S	F	M	T	A	P	Q	V	R	E	V	M	E	A	L	V	R	H	L	W	L	E	V	K	G	V	D	L	G	D	F	P	V	M	T	F	A	E	A	E	R	R	Y
Query Conservation		.	.																.			.
Alig confidence		.	.																.			.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	F	S	A	G	E	G	L	Y	T	H	M	K	A	L	R	P	D	E	D	R	L	S	P	L	H	S	V	Y	V	D	Q	W	D	W	E	R	V	M	G	D	G	E	R	Q	F	S	T	L	K	S	T	V	E	A	I	W	A	G	I	K	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T			T	T												T	T		S				S	S			S													T	T			S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	S	D	K	P	D	L	R	N	P	M	E	L	T	D	V	A	D	L	L	K	S	V	E	F	A	V	F	A	G	P	A	N	D	P	K	G	R	V	A	A	L	R	V	P	G	G	A	S	L	T	R	K	Q	I	D	E	Y	G	N	F	V	K	I	Y	G	A	K	G	L	A	Y	I	K	V	N	E	R	A	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	A	V	S	E	E	F	G	L	A	P	F	L	P	D	Q	I	H	F	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S						S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																													148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Query SS confidence																																																																											.	.
Query Sequence		G	L	E	G	I	N	S	P	V	A	K	F	L	N	A	E	I	I	E	D	I	L	D	R	T	A	A	Q	D	G	D	M	I	F	F	G	A	D	N	K	K	I	V	A	D	A	M	G	A	L	R	L	K	V	G	K	D	L	G	L	T	D	E	S	K	W	A	P	L	W	V	I	D	.	.	F	P	M	F	E
Query Conservation																																																																											.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.				.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Sequence		H	S	Q	E	L	L	S	R	Y	P	D	L	D	A	K	G	R	E	R	A	I	A	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	A	V	F	L	V	G	I	G	G	K	L	.	.
Template Known Secondary structure										S	S	S	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S								S	S			.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.										.	.	.	.	.	.	.	.							480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	G	E	G	G	L	T	A	M	H	H	P	F	T	S	P	K	D	M	T	A	A	E	L	K	A	A	P	E	N	A	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	Y	D	M	V	I	N	.	.	.	.	.	.	G	Y	E	V	G	G	G	S	V	R	I	H	N	G	D	M	Q	Q	T	V	F	G	I
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	G	H	R	H	D	V	R	A	P	D	Y	D	D	W	S	T	P	S	E	L	G	H	A	G	L	N	G	D	I	L	V	W	N	P	V	L	E	D	A	F	E	L	S	S	M	G	I	R	V	D	A	.	D	T	L	K	H	Q	L	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S			S	S				T	T	T	B			S	S	B		T	T	S	S	B		S									T	T	T	T											B				.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.
Template SS confidence
																			206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.		.	260	.	.	.	.	.	.	.
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	I	N	E	E	E	Q	R	E	K	F	G	F	L	L	D	A	L	K	Y	G	T	P	P	H	A	G	L	A	F	G	L	D	R	L	T	M	L	L	T	G	T	D	N	I	R	D	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.
Template Conservation								.	.	.
Template Sequence		T	G	D	E	D	R	.	.	.	L	E	L	E	W	H	Q	A	L	L	R	G	E	M	P	Q	T	I	G	G	G	I	G	Q	S	R	L	T	M	L	L	L	Q	L	P	H	I	G	Q	V	Q	A
Template Known Secondary structure			T		T	T	G	.	.	.	G	G	S								T	T		S																			T		S		G	G	G	T	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.
Template SS confidence
		268	.	270	.	.	.				.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.