Job Description P0CE45 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:30:13 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 408 % Identity 13% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Q	L	S	W	R	T	I	V	G	Y	S	L	G	D	V	A	N	N	F	A	F	A	M	G	A	L	F	L	L	S	Y	Y	T	D	V	A	G	V	G	A	A	A	A	G	T	M	L	L	L	V	R	V	F	D	A	F	A	D	V	F	A	G	R	V	V	D	S	V	N	T	R	W	G	K	F	R	P	F	L
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	.	.	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	D	R	S	N	.	.	.	.	.	P	R	V	F	L
Template Known Secondary structure																								T	S								T	.	.	T	S	S	T	T		S	S																											S		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.						.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	G	T	A	P	L	M	I	F	S	V	L	V	F	W	V	P	T	D	W	S	H	G	S	K	V	V	Y	A	Y	L	T	Y	M	G	L	G	L	C	Y	S	L	V	N	I	P	Y	G	S	L	A	T	A	M	T	Q	Q	P	Q	S	R	A	R	L	G	A	A	R	G	I	A	A	S	L	T	F	V	C	L
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.
Template Conservation																								.	.	.
Template Sequence		P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	.	.	.	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V	G	G	G	I	P	P
Template Known Secondary structure																							S	.	.	.	S	S	S																T										T	T		T	T	T																		T	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.				.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.		.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		A	F	L	I	G	P	S	I	K	N	S	S	P	E	E	M	V	S	V	Y	H	F	W	T	I	V	L	A	I	A	G	M	V	L	Y	F	I	C	F	K	S	T	R	.	E	N	V	V	R	I	V	A	Q	P	S	L	N	I	S	L	Q	T	L	K	R	N	R	P	L	F	M	L	C	I	G	A	L	C	V	L
Query Conservation																																													.
Alig confidence																																													.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y
Template Known Secondary structure											T			S	T	T		T																					S	S	T	T	T				S		T	T	T						T							T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.				.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.
Query Sequence		I	S	T	F	A	V	S	A	S	S	L	F	Y	V	R	Y	V	L	N	D	T	G	L	F	T	V	L	V	L	V	Q	N	L	V	G	T	V	A	S	A	P	L	V	P	G	M	V	A	R	I	G	K	K	N	T	F	L	I	G	A	L	L	G	T	C	.	.	.	G	Y	L	L	F	F	W	V	S	V	W	S
Query Conservation																																																																			.	.	.
Alig confidence																																																																			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N
Template Known Secondary structure															B	T	T	B	S																																T	S	T	T																				T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.		.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.
Query SS confidence																																																									.
Query Sequence		L	P	V	A	L	V	A	L	A	I	A	S	I	G	Q	G	V	T	M	T	V	M	W	A	L	E	A	D	T	V	E	Y	G	E	Y	L	T	G	V	R	I	E	G	L	T	Y	S	L	F	S	F	T	R	K	C	.	G	Q	A	I	G	G	S	I	P	A	F	I	L	G	L	S	G	Y	I	A	N	Q	V	Q
Query Conservation																																																									.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.																			.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	.	.	.	.	.	.	.	P	K	K	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	W	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																	T													T	S	.	.	.	.	.	.	.		T	T																															S	S		S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.								.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	E	V	I	M	G	I	R	T	S	I	A	L	V	P	C	G	F	M	L	L	A	F	V	I	I	W	F	Y	P	L	T	D	K	K	F	K	E	I	V	V	E	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																															G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.