Job Description P21189 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:01 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 721 % Identity 20% Template c2dtuA_ PDB info PDB header:transferase/dna Chain: A: PDB Molecule:dna polymerase; PDBTitle: crystal structure of the beta hairpin loop deletion variant2 of rb69 gp43 in complex with dna containing an abasic site3 analog Resolution 2.37 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	R	D	T	P	Q	G	T	E	V	S	F	W	L	A	T	D	N	G	P	L	Q	V	T	L	A	P	Q	E	S	V	A	F	I	P	A	D	Q	V	P	R	A	Q	H	I	L	Q	G	E	Q	G	F	R	L	T	P	L	A	L	K	D	F	H	R	Q	P	V	Y	G	L	Y	C	R	A	H	R	Q	L	M	N
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	V	E	Q	I	G	D	S	I	F	E	R	Y	I	D	S	N	G	R	E	R	T	R	E	V	E	Y	K	P	S	L	F	A	H	C	P	E	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	K	Y	F	D	I	Y	G	K	P	C	T	R	K	L	F	A	N	M	R	D	A	S	Q
Template Known Secondary structure								T	T									T	T	S																			T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S				T	T	S									S	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.																.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	E	K	R	L	R	E	G	G	V	T	V	Y	E	A	D	V	R	P	P	E	R	Y	L	M	E	R	F	I	T	S	P	V	W	V	E	G	D	M	H	N	G	T	I	V	N	A	R	L	K	P	H	P	D	Y	R	P	P	L	K	W	V	S	I	D	I	E	T	T	R	H	G	E	L	Y	C	I	G	L	E
Query Conservation
Alig confidence																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Sequence		W	I	K	R	M	E	D	I	G	L	E	A	L	G	M	D	.	D	F	K	L	A	Y	L	S	D	T	Y	N	Y	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Y	D	H	T	K	I	R	V	A	N	F	D	I	E	V	T	S	P	D	G	.	.	.	F	P	E	P
Template Known Secondary structure										T				B	S			.											T		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	G	S												S	S	S	.	.	.	S			T
Template Predicted Secondary structure																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.		.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.				.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	C	G	Q	R	I	V	Y	M	L	G	P	E	N	G	D	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	D	F	E	L	E	Y	V	A	S	R	P	Q	L	L	E	K	L	N	A	W	F	A
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	A	K	H	P	I	D	A	I	T	H	Y	D	S	I	D	D	R	F	Y	V	F	D	L	L	N	S	P	Y	G	N	V	E	E	W	S	I	E	I	A	A	K	L	Q	E	Q	G	G	D	E	V	P	S	E	I	I	D	K	I	I	Y	M	P	F	D	N	E	K	E	L	L	M	E	Y	L	N	F	W	Q
Template Known Secondary structure		T	T			S										T	T	T	T											T	T													S		G	G	G	T						T	T	T	G	G	G							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.
Query SS confidence																																																																								.
Query Sequence		N	Y	D	P	D	V	I	I	G	W	N	V	V	Q	F	D	L	R	M	L	Q	K	H	A	E	R	Y	R	L	P	L	R	L	G	R	D	N	S	E	L	E	W	R	E	H	G	F	K	N	G	V	F	F	A	Q	A	K	G	R	L	I	I	D	G	I	E	A	L	K	S	.	A	F	W	N	F	S	S	F	S
Query Conservation																																																																								.
Alig confidence																																																	.	.	.	.																				.
Template Conservation																																																	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	T	P	V	I	L	T	G	W	N	V	E	S	F	A	I	P	Y	V	Y	N	R	I	K	N	I	F	G	E	S	T	A	K	R	L	S	P	H	R	K	T	R	V	K	V	G	.	.	.	.	E	I	I	T	L	F	G	I	S	V	L	D	Y	I	D	L	Y	K	K	F	S	F	T	N	Q	P	S	Y	S
Template Known Secondary structure			T			S					S	S	T	T	T	T													S						G	G	G	S	T	T	S						S	S	.	.	.	.	S					T	T														S					S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.					.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	T	V	A	Q	E	L	L	G	E	G	K	S	I	D	N	P	W	D	R	M	D	E	I	D	R	R	F	A	E	D	K	P	A	L	A	T	Y	N	L	K	D	C	E	L	V	T	Q	I	F	H	K	T	E	I	M	P	F	L	L	E	R	A	T	V	N	G	L	P	V	D	R	H	G	G	S	V	A	A
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	Y	I	S	E	F	E	L	N	V	G	K	L	K	Y	D	.	.	.	.	.	G	P	I	S	K	L	R	E	S	N	H	Q	R	Y	I	S	Y	N	I	I	A	V	Y	R	V	L	Q	I	D	A	K	R	Q	F	I	N	L	S	L	D	M	G	Y	Y	A	K	I	Q	I	Q	S	V	F	S	P	I	K	T
Template Known Secondary structure											S			S				S	.	.	.	.	.	S		G	G	G																																									T			G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.						.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	G	H	L	Y	F	P	R	M	H	R	A	G	Y	V	A	P	N	L	G	E	V	P	P	H	A	S	P	G	G	Y	V	M	D	S	R	P	G	L	Y	D	S	V	L	V	L	D	Y	K	S	L	Y	P	S	I	I	R	T	F	L	I	D	P	V	G	L	V	E	G	M	A	Q	P	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	D	A	I	I	F	N	S	L	K	E	Q	N	K	V	I	P	Q	G	R	S	H	P	V	Q	P	Y	P	G	A	F	V	K	E	P	I	P	N	R	Y	K	Y	V	M	S	F	D	L	T	S	L	Y	P	S	I	I	R	Q	V	N	I	S	P	E	T	I	A	G	T	F	K	V	A	P	L	H	D	Y	I	N
Template Known Secondary structure													T	T																			B									S	S							S	S										T			G	G	G															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
							446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.		.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																			.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																			.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	D	P	E	H	S	T	E	G	F	L	D	A	W	F	S	R	E	K	.	H	C	L	P	E	I	V	T	N	I	W	H	G	R	D	E	A	K	R	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.																			.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																			.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	V	A	E	R	P	S	D	V	Y	S	C	S	P	N	G	M	M	Y	Y	K	D	R	D	G	V	V	P	T	E	I	T	K	V	F	N	Q	R	K	E	H	K	G	Y	M	L	A	A	Q	R	N	G	E	I	I	K	E	A	L	H	N	P	N	L	S	V	D	E	P	L	D	V	D	Y	R	F	D	F	S	D
Template Known Secondary structure		T		S			S		S	S	S				T	T	T					S	S	S																																		G	G	G	T	S													T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
																													485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	K	P	L	S	Q	A	L	K	I	I	M	N	A	F	Y	G	V	L	G	T	T	A	C	R	F	F	D	P	R	L	A	S	S	I	T	M	R	G	H	Q	I	M	R	Q	T	K	A	L	I	E	A	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	K	E	K	I	K	K	L	S	A	K	S	L	N	E	M	L	F	R	A	Q	R	T	E	V	A	G	M	T	A	Q	I	N	R	K	L	L	I	N	S	L	Y	G	A	L	G	N	V	W	F	R	Y	Y	D	L	R	N	A	T	A	I	T	T	F	G	Q	M	A	L	Q	W	I	E	R	K	V	N	E	Y
Template Known Secondary structure								T	T																																									T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
											538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.															.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.		.	.	.	.	.	590	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	D	V	I	Y	G	D	T	D	S	T	F	V	W	L	K	G	A	H	S	E	E	E	A	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	R	A	L	V	Q	H	V	N	A	W	W	A	E	T	L	Q	K	Q	.	R	L	T	S	A	L	E	L	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	E	V	C	G	T	E	G	E	A	F	V	L	Y	G	D	T	D	S	I	Y	V	S	A	D	K	I	I	D	K	V	G	E	S	K	F	R	D	T	N	H	W	V	D	F	L	D	K	F	A	R	E	R	M	E	P	A	I	D	R	G	F	R	E	M	C	E	Y	M	N	N	K	Q	H	L	M	F	M	D
Template Known Secondary structure					T	T			S	S									T	T												T	T		G	G	G		S	S															T																T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		605	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.
		594	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.						.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.			660	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.																																			.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.																																			.	.
Query Sequence		Y	E	T	H	F	C	R	F	L	M	P	T	I	R	G	A	D	T	G	S	K	K	R	Y	A	G	L	I	Q	E	G	D	.	.	.	.	.	K	Q	R	M	V	F	K	G	L	E	T	V	R	T	D	W	T	P	L	A	Q	Q	F	Q	Q	E	L	Y	L	R	I	F	R	N	.	.	E	P	Y	Q	E	Y	V
Query Conservation																																		.	.	.	.	.																																			.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	A	I	A	G	P	P	L	G	S	K	G	I	G	G	F	W	T	G	K	K	R	Y	A	L	N	V	W	D	M	E	G	T	R	Y	A	E	P	K	L	K	I	M	G	L	E	T	Q	K	S	S	T	P	K	A	V	Q	K	A	L	K	E	C	I	R	R	M	L	Q	E	G	E	E	S	L	Q	E	Y	F
Template Known Secondary structure										T	T	S	S			S						T	T										T	T												S	S	G	G	G		T	T	S																		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		685	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.
		667	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.							.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Query Sequence		R	E	T	I	D	K	L	M	A	G	E	L	D	A	R	L	V	Y	R	K	R	L	R	R	P	L	S	E	Y	.	.	.	.	.	.	Q	R	N	V	P	P	H	V	R	A	A	R	L	A	D	E	E	N	Q	K	R	G	R	P	L	Q	Y	Q	N	R	G	T	I	K	Y	V	W	T	T	N	G	.	.	.	.
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Alig confidence																.	.														.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Template Conservation																.	.
Template Sequence		K	E	F	E	K	E	F	R	Q	L	N	Y	I	S	.	.	I	A	S	V	S	S	A	N	N	I	A	K	Y	D	V	G	G	F	P	G	P	K	C	P	F	H	I	R	G	I	L	T	Y	N	R	A	I	K	G	N	I	D	A	P	Q	V	V	E	G	E	K	V	Y	V	L	P	L	R	E	G	N	P	F	G
Template Known Secondary structure								G	G	G	S		T	T	T	.	.	T								S	T	T	T	S			T	T				T	T																T	T		S	S	S					T	T	S							B		S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.
Template SS confidence
		765	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.			.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.
											737	.	.	740	.	.	.	.	.	.					.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	P	L	D	Y	Q	R	S	P	.	.	.	.	L	D	Y	E	H	Y	L	T	R	Q	L	Q	P	V	A	E	G	I	L	P	F	I	E	D	N	F	A	T	L	M	T	G	Q	L	G	L	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.																										.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		D	K	C	I	A	W	P	S	G	T	E	I	T	D	L	I	K	D	D	V	L	H	W	M	D	Y	T	V	L	L	E	K	T	F	I	K	P	L	E	G	F	T	S	A	A	K	L	D	.	Y	E	K	K	A	S	L	F	D	M	F
Template Known Secondary structure		S	S						T	T	S				T	T	T								B										T												T			.	S	S	S	S			G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		843	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890		.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.