Job Description P0A855 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:06:56 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 261 % Identity 21% Template c1k32E_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: E: PDB Molecule:tricorn protease; PDBTitle: crystal structure of the tricorn protease Resolution 2.00 Å

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		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.				.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.
Query Sequence		L	T	G	I	K	G	A	F	R	T	R	I	A	Y	V	V	Q	T	N	G	G	Q	F	P	Y	E	L	R	V	S	D	Y	D	G	Y	N	Q	F	V	V	H	R	S	P	Q	P	L	M	S	P	A	W	S	P	D	G	S	K	L	A	Y	V	T	F	E	S	G	.	.	.	R	S	A	L	V	I	Q	T	L	A
Query Conservation																																																																					.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	L	N	P	D	I	H	G	D	R	I	I	F	V	C	C	D	.	.	.	.	.	.	.	D	L	W	E	H	D	L	K	S	G	S	T	R	K	I	V	S	N	L	G	V	I	N	N	A	R	F	F	P	D	G	R	K	I	A	I	R	V	M	R	G	S	S	L	N	T	A	D	L	Y	F	Y	N	G	E
Template Known Secondary structure										T	T							T	T	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T									S	S	S									T	T	S	S									S	T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.								60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.								.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	G	A	V	R	Q	V	A	S	F	P	R	H	N	.	.	.	.	.	.	.	G	A	P	A	F	S	P	D	G	S	K	L	A	F	A	L	S	K	.	.	.	T	G	S	L	N	L	Y	V	M	D	L	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	E	I	K	R	I	T	Y	F	S	G	K	S	T	G	R	R	M	F	T	D	V	A	G	F	D	P	D	G	N	L	I	I	S	T	D	A	M	Q	P	F	S	S	M	T	C	L	Y	R	V	E	N	D	G	I	N	F	V	P	L	N	L	G	P	A	T	H	I	L	F	A	D	G	R	R	V	I	G	R
Template Known Secondary structure		T	T													B	T	T	B			S							T	T	S								T	T	S	S	S	T	T									G	G	G	T									S		S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
																											278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	I	R	Q	V	T	D	G	R	S	N	N	T	E	P	T	W	F	P	D	S	Q	N	L	A	F	T	S	D	Q	A	G	R	P	Q	V	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.
Template Sequence		N	T	F	E	L	P	H	W	K	G	Y	R	G	G	T	R	G	K	I	W	I	E	V	N	S	G	A	F	K	K	I	V	D	M	S	T	H	V	S	S	P	V	I	V	G	H	R	.	.	I	Y	F	I	T	D	I	D	G	F	G	Q	I	Y	S	T	D	L	D	G	K	D	L	R	K	H	T	S	F	T	D
Template Known Secondary structure		S		S			T	T	S	T	T			S	T	T	S									T	T									S	S									T	T		.	.							T	T	S	S								T	T	S		S									S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.
Template SS confidence
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.			.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Y	P	R	H	L	N	T	D	G	R	R	I	L	F	S	K	G	G	S	I	Y	I	F	N	P	D	T	E	K	I	E	K	I	E	I	G	D	L	E	S	P	E	D	R	I	I	S	I	P	S	K	F	A	E	D	F	S	P	L	D	G	D	L	I	A	F	V	S	R	G	Q	A	F	I	Q	D	V	S	G
Template Known Secondary structure		S								S	S	S							T	T							T	T	T	T															S						G	G	G	G								G	G	G							T	T							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
																																							317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	I	N	G	G	A	P	Q	R	I	T	W	E	G	S	Q	N	Q	D	A	D	V	S	S	D	G	K	F	M	V	M	V	S	S	N	G	G	Q	Q	H	I	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.
Template Sequence		T	Y	V	L	K	V	P	E	P	L	R	I	R	Y	V	R	R	G	G	D	T	K	V	A	F	I	H	G	T	R	E	G	D	F	L	G	I	Y	D	Y	R	T	G	K	A	E	K	F	E	E	N	L	G	N	V	F	A	M	G	V	D	R	N	G	K	F	A	V	V	A	N	D	R	F	.	.	.	E	I	M
Template Known Secondary structure		S	S								S									S	S	S									S	S									T	T	T												S								T	T	S	S							T	T	S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.				.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.								.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	D	L	A	T	G	G	V	Q	V	L	S	S	T	.	.	F	L	D	E	T	P	S	L	A	P	N	G	T	M	V	I	Y	S	S	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	G	M	G	S	V	L	N	L	V	S	T	D	G	R	F	K	A	R	L	P	A	T	D	G	Q	V	K	F	P	A	W	S	P
Query Conservation																	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	D	L	E	T	G	K	P	T	V	I	E	R	S	R	E	A	M	I	T	D	F	T	I	S	D	N	S	R	F	I	A	Y	G	F	P	L	K	H	G	E	T	D	G	Y	V	M	Q	A	I	H	V	Y	D	M	E	G	R	K	I	F	A	A	T	T	E	N	S	H	D	Y	A	P	A	F	D	A
Template Known Secondary structure					T	T	T										S	S	S									T	T	S											S	S	T	T		S	S										T	T	T	T						S		S	S	S	B								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.