Job Description P15977 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:58 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 469 % Identity 26% Template d1tz7a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.15

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		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.		.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																									.
Query SS confidence																									.
Query Sequence		K	L	W	G	A	C	V	Q	L	Y	T	L	R	S	E	K	N	W	G	I	G	D	F	.	G	D	L	K	A	M	L	V	D	V	A	K	R	G	G	S	F	I	G	L	N	P	I	H	A	L	Y	P	A	N	P	E	S	A	S	P	Y	S	P	S	S	R	R	W	L	N	V	I	Y	I	D	V	N	A	V	E
Query Conservation																									.
Alig confidence																.	.								.																										.	.
Template Conservation																.	.																																		.	.
Template Sequence		R	L	A	G	I	L	L	H	V	T	S	L	P	S	.	.	P	Y	G	I	G	D	L	G	K	E	A	Y	R	F	L	D	F	L	K	E	C	G	F	S	L	W	Q	V	L	P	L	N	P	.	.	T	S	L	E	A	G	N	S	P	Y	S	S	N	S	L	F	A	G	N	Y	V	L	I	D	P	E	E	L	L
Template Known Secondary structure										G	G	G	S			.	.	S	S	S	S			S	S														T										S		.	.			G	G	G	T	T		T	T	S		S		S	S	S			G	G	G	S		T
Template Predicted Secondary structure																.	.																																		.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.			.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.			.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	H	L	S	E	E	A	Q	A	W	W	Q	L	P	T	T	Q	Q	T	L	Q	Q	A	R	D	A	D	W	V	D	Y	S	T	V	T	A	L	K	M	T	A	L	R	M	A	W	K	G	F	A	Q	R	D	D	E	Q	M	A	A	F	R	Q	F	V	A	E	Q	G	D	S	L	F	W	Q	A	A	F	D	A
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	D	L	I	K	E	R	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	R	F	P	L	G	E	A	L	Y	E	V	V	Y	E	Y	K	K	E	L	L	E	K	A	F	K	N	F	R	.	.	.	.	.	R	F	E	L	L	E	D	F	L	K	E	H	S	Y	W	L	R	D	Y	A	L	Y	M	A
Template Known Secondary structure			T	T	S	S		G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S		S																				T			.	.	.	.	.												T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.													.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.						.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	H	A	Q	Q	V	K	E	D	E	M	R	W	G	W	P	A	W	P	E	M	Y	Q	N	V	D	S	P	E	V	R	Q	F	C	E	E	H	R	D	D	V	D	F	Y	L	W	L	Q	W	L	A	Y	S	Q	F	A	A	C	W	E	I	S	Q	G	Y	E	M	P	I	G	L	Y	R	D	L	A	V	G	V	A
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.																																																					.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.																																																					.	.
Template Sequence		I	K	E	E	E	G	K	E	.	.	.	.	.	.	W	Y	E	W	D	E	E	L	K	R	R	E	K	E	A	L	K	R	V	L	N	K	L	K	G	R	F	Y	F	H	V	F	V	Q	F	V	F	F	K	Q	W	E	K	L	R	R	Y	A	R	E	R	G	.	.	I	S	I	V	G	D	L	P	M	Y	P	S
Template Known Secondary structure								S		.	.	.	.	.	.	G	G	G	S						T	T												T																												T	T	.	.									S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.																																																					.	.
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.							.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200			.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.							.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	G	A	E	T	W	C	D	R	E	L	Y	C	L	K	A	.	.	.	.	.	.	S	V	G	A	P	P	D	I	L	G	P	L	G	Q	N	W	G	L	P	P	M	D	P	H	I	I	T	A	R	A	Y	E	P	F	I	E	L	L	R	A	N	M	Q	N	C	G	A	L	R	I	D	H	V	M	S	M	L
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	S	A	D	V	W	T	N	P	E	L	F	K	L	D	G	D	L	K	P	L	F	V	A	G	V	P	P	D	F	F	S	K	T	G	Q	L	W	G	N	P	V	Y	N	W	E	E	H	E	K	E	G	F	R	W	W	I	R	R	V	L	H	N	L	K	L	F	D	F	L	R	L	D	H	F	R	G	F	E
Template Known Secondary structure		S	S	S							G	G	G	B		B		T	T	S		B	S									S	S	S	S	S									B								T	T	T												T	T		S					T	T	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
		455	.	.	.	.	460	.	.		.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		R	L	W	W	I	P	Y	G	.	E	T	A	D	Q	G	A	Y	V	H	Y	P	V	D	D	L	L	S	I	L	A	L	E	S	K	R	H	R	C	M	V	I	G	E	D	L	G	T	V	P	V	E	I	V	G	K	L	R	S	S	G	V	Y	S	Y	K	V	L	Y	F	E	N	D	H	E	K	T	F	R	A	P
Query Conservation										.
Alig confidence										.																			.	.
Template Conservation																													.	.
Template Sequence		A	Y	W	E	V	P	Y	G	E	E	T	A	V	N	G	R	W	V	K	A	P	G	K	T	L	F	K	.	.	K	L	L	S	Y	F	P	K	N	P	F	I	A	E	D	L	G	F	I	T	D	E	V	R	Y	L	R	E	T	F	K	I	P	G	S	R	V	I	E	F	A	F	Y	D	K	E	S	E	H	L	P
Template Known Secondary structure								T	T		S	S	S	T	T														.	.						S	T	T									S	S												T	T							G	G	G	T	T	S	S	T	T		T	T	S	G
Template Predicted Secondary structure																													.	.
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.			320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	Y	P	E	Q	S	M	A	V	A	A	T	H	D	L	P	T	L	R	G	Y	W	E	C	G	D	L	T	L	G	K	T	L	G	L	Y	P	D	E	V	V	L	R	G	L	Y	Q	D	R	E	L	A	K	Q	G	L	L	D	A	L	H	K	Y	G	C	L	P	K	R	A	G	H	K	A	S	L	M	S	M
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	N	V	E	E	N	N	V	Y	Y	T	S	T	H	D	L	P	P	I	R	G	W	F	E	N	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	S	R	K	R	L	F	E	Y	L	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	K
Template Known Secondary structure		G	G			S	S					S			T	T	S									T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410															.	.	.
		614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.			.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.
Query SS confidence																																.	.
Query Sequence		T	P	T	L	N	R	G	L	Q	R	Y	I	A	D	S	N	S	A	L	L	G	L	Q	P	E	D	W	L	D	M	.	.	A	E	P	V	N	I	P	G	T	S	Y	Q	Y	K	N	W	R	R	K	L	S	A	T	L	E	S	M	F	A	D	D	G	V	N	K	L	L	K	D
Query Conservation																																.	.
Alig confidence																																.	.													.	.															.	.
Template Conservation																																														.	.															.	.
Template Sequence		E	E	K	V	N	E	E	L	I	R	L	V	L	I	S	R	A	K	F	A	I	I	Q	M	Q	D	L	L	N	L	G	N	E	A	R	M	N	Y	P	G	R	P	F	G	.	.	N	W	R	W	R	I	K	E	D	Y	T	Q	K	K	.	.	E	F	I	K	K	L	L	G	I
Template Known Secondary structure		G	G	G												S			S										T	T			G	G	G					T	T			S	S	.	.		S						S		G	G	G	G		.	.
Template Predicted Secondary structure																																														.	.															.	.
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.			.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.			.	.	.	.	.	.	.	.	480