Job Description P15977 Confidence 98.02% Date Thu Jan 5 11:34:58 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 276 % Identity 17% Template d1m53a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.20

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	Q	L	Y	T	L	R	S	E	K	N	W	G	I	G	D	F	G	D	L	K	A	M	L	V	D	V	A	K	R	G	G	S	F	I	G	L	N	P	I	H	A	L	Y	P	A	N	P	E	S	A	S	P	Y	S	P	S	S	R	R	W	L	N	V	I	Y	I	D	V	N	A	V	E	D	F	H	L	S	E	E
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	D	D	G	I	G	D	I	R	G	I	I	E	K	L	D	Y	L	K	S	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	D	.	.	.	.	S	P	N	T	D	N	G	Y	D	I	S	N	Y	R	Q	I	M	K	E	Y	G	T	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T								T												.	.	.	.				T	T	T	T	S	S		S							G	G	G					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.					.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Q	A	W	W	Q	L	P	T	T	Q	Q	T	L	Q	Q	A	R	D	A	D	W	V	D	Y	S	T	V	T	A	L	K	M	T	A	L	R	M	A	W	K	G	F	A	Q	R	D	D	E	Q	M	A	A	F	R	Q	F	V	A	E	Q	G	D	S	L	F	W	Q	A	A	F	D	A	L	H	A	Q	Q	V	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	D	E	M	R	W	G	W	P	A	W	P	E	M	Y	Q	N	V	D	S	P	E	V	R	Q	F	C	E	E	H	R	D	D	V	D	F	Y	L	W	L	Q	W	L	A	Y	S	Q	F	A	A	C	W	E	I	S	Q	G	Y	E	M	P	I	G	L	Y	R	D	L	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	D	S	L	V	A	E	M	K	K	R	N	.	.	M	R	L	M	I	D	V	V	I	N	H	T	S	D	Q	H	P	W	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	.	.										S	B			T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
																																																122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.			.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
																			378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	A	E	G	G	A	E	T	W	C	D	R	E	L	Y	C	L	K	A	S	V	G	A	P	P	D	I	L	G	P	L	G	Q	N	W	.	G	L	P	P	M	D	P	H	I	I	T	A	R	A	Y	E	P	F	I	E	L	L	R	A	N	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																.	.
Template Conservation																																																																							.	.
Template Sequence		I	Q	S	K	S	D	K	N	N	P	Y	R	D	Y	Y	F	W	R	D	G	K	D	N	Q	P	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	W	Q	K	D	A	K	S	G	Q	Y	Y	L	H	Y	F	A	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	N	P	K	V	R	E	D	.	.	L	Y	A	M	L	R	F	W	L
Template Known Secondary structure								T	T		T	T	G	G	G	B						S	S	S	S		S	S			B		T	T	S	S	B	S					T	T	T							S	S		T	T			B	B		T	T	S							.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.			.	.	.	.	.	.	.	230	.
		440	.		.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.							.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Predicted Secondary structure				.																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	N	.	C	G	A	L	R	I	D	H	V	M	S	M	L	R	L	W	W	I	P	Y	G	E	T	.	.	.	.	.	.	A	D	Q	G	A	Y	V	H	Y	P	V	D	D	L	L	S	I	L	A	L	E	S	K	R	H	R	C	M	V	I	G	E	D	L	G	T	V	P	V	E	I	V	G	K	L	R	S	S
Query Conservation				.																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V	A	T	Y	S	K	I	P	G	F	P	N	L	T	P	E	Q	Q	K	N	F	A	E	Q	Y	T	M	G	P	N	I	H	R	Y	I	Q	E	M	N	R	K	V	L	S	R	Y	D	V	A	T	A	G	E	I	F	G	V	P	L	D	R	S	S	Q	F	F	D	R	R
Template Known Secondary structure		T	T	T							T	T	G	G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T												T	G	G	G	S									T	T			G	G	G	T						G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	V	Y	S	Y	K	V	L	Y	F	E	N	D	H	E	K	T	F	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	A	Y	P	E	Q	S	M	A	V	A	A	T	H	D	L	P	T	L	R	G	Y	W	E	C	G	D	L	T	L	G	K	T	L
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	H	E	L	N	M	A	F	M	F	D	L	I	R	L	D	R	D	S	N	E	R	W	R	H	K	S	W	S	L	S	Q	F	R	Q	I	I	S	K	M	D	V	T	V	G	K	Y	G	W	N	T	F	F	L	D	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	D	R	P	Q	W	R	E	A	S
Template Known Secondary structure		G		S		S						T	T	T	T	T	T	B		S	S		T	T		B																				T	T	T			B				S			T	T	S								S			S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.