Job Description P15977 Confidence 98.20% Date Thu Jan 5 11:34:58 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 298 % Identity 16% Template d1j0ha3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.90

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		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	F	G	D	L	K	A	M	L	V	D	V	A	K	R	G	G	S	F	I	G	L	N	P	I	H	A	L	Y	P	A	N	P	E	S	A	S	P	Y	S	P	S	S	R	R	W	L	N	V	I	Y	I	D	V	N	A	V	E	D	F	H	L	S	E	E	A	Q	A	W	W	Q	L	P	T	T	Q	Q	T	L
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	L	Q	G	I	I	D	H	L	D	Y	L	V	D	L	G	I	T	G	I	Y	L	T	P	I	F	R	S	.	.	.	.	.	P	S	N	H	K	Y	D	T	A	D	Y	F	E	V	D	P	H	F	G	D	K	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T								T													.	.	.	.	.	S	S	S	S			S		S							T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.						.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Q	A	R	D	A	D	W	V	D	Y	S	T	V	T	A	L	K	M	T	A	L	R	M	A	W	K	G	F	A	Q	R	D	D	E	Q	M	A	A	F	R	Q	F	V	A	E	Q	G	D	S	L	F	W	Q	A	A	F	D	A	L	H	A	Q	Q	V	K	E	D	E	M	R	W	G	W	P	A	W	P	E	M
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.												.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	Q	N	V	D	S	P	E	V	R	Q	F	C	E	E	H	R	D	D	V	D	F	Y	L	W	L	Q	W	L	A	Y	S	Q	F	A	A	C	W	E	I	S	Q	G	Y	E	M	P	I	G	L	Y	R	D	L	A	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	E	G	G	A	E	T	W	C	D	R
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	T	L	I	D	R	C	H	E	K	G	.	.	I	R	V	M	L	D	A	V	F	N	H	C	G	Y	E	F	A	P	F	Q	D	V	W	K	N	G	E	S	S	K	Y	K	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	.	.										S	B			T	T											G	G	G		T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template SS confidence
																																			225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.			.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.			.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.																													.	.
Query SS confidence																									.																													.	.
Query Sequence		E	L	Y	C	L	K	A	S	V	G	A	P	P	D	I	L	G	P	L	G	Q	N	W	.	G	L	P	P	M	D	P	H	I	I	T	A	R	A	Y	E	P	F	I	E	L	L	R	A	N	M	Q	N	.	.	C	G	A	L	R	I	D	H	V	M	S	M	L	R	L	W	W	I	P	Y	G	E	T	A	D	Q
Query Conservation																									.																													.	.
Alig confidence																									.																.	.												.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	F	H	I	H	E	F	P	L	Q	T	E	P	R	P	N	Y	D	T	F	A	F	V	P	Q	M	P	K	L	N	T	A	N	P	E	V	K	R	Y	.	.	L	L	D	V	A	T	Y	W	I	R	E	F	D	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	I	D	H	E	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	B		B	S	S	S	S				S	S	S		S	B		B	S	T	T		T	T	S	B	B	B		T	T	S							.	.																				T	T	G	G	G	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.			.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.															.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.		.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		G	A	Y	V	H	Y	P	V	D	D	L	L	S	I	L	A	L	E	S	K	R	H	R	C	M	V	I	G	E	D	L	G	T	V	P	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	G	K	L	R	S	S	G	V	Y	S	Y	K	V	L	Y	F	E	N	D	.	H	E	K	T	F	R	A
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	F	R	Q	.	.	E	V	K	A	L	K	P	D	V	Y	I	L	G	E	I	W	H	D	A	M	P	W	L	R	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	F	T	D	G	V	L	R	F	F	A	K	E	E	I	S	A	R	Q	F	A	N	Q	M	M	H	V	L	H	S	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.							T	T								S	S			G	G	G		S	S	S	S		S			B													T	S			S															T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template SS confidence
										339	340	.	.	.			.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	K	A	Y	P	E	Q	S	M	A	V	A	A	T	H	D	L	P	T	L	R	G	Y	W	E	C	G	D	L	T	L	G	K	T	L	G	L	Y	P	D	E	V	V	L	R	G	L	Y	Q	D	R	E	L	A	K	Q	G	L	L	D	A	L	H	K	Y	G	C	L	P	K	R	A	G	H	K	A	S	L	M	S
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	N	N	V	N	E	A	A	F	N	L	L	G	S	H	D	T	S	R	I	L	T	V	C	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T		B		B	S			T	T	S							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	T	P	T	L	N	R	G	L	Q	R	Y	I	A	D	S	N	S	A	L	L	G	L	Q	P	E	D	W	L	D	M	A	E	P	V	N	I	P	G	T	S	Y	Q	Y	K	N	W	R	R	K	L	S	A	T	L	E	S	M	F	A	D	D	G	V	N	K	L	L	K	D	L	D	R	R	R	R	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	I	R	K	V	K	L	L	F	L	F	Q	L	T	F	T	G	S	P	C	I	Y	Y	G	D	E	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	T	G	G	N	D	P	E	C	R	K	C	M	V	W	D	P	M	Q	Q	N	K	E	L	H	Q	H	V	K	Q	L	I	A	L	R	K	Q
Template Known Secondary structure		.	.														S	S	S						T	T	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	T	T	G	G	G							T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.												.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.