Job Description P15977 Confidence 97.65% Date Thu Jan 5 11:34:58 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 231 % Identity 19% Template c3bmwA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:cyclomaltodextrin glucanotransferase; PDBTitle: cyclodextrin glycosyl transferase from thermoanerobacterium2 thermosulfurigenes em1 mutant s77p complexed with a maltoheptaose3 inhibitor Resolution 1.60 Å

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		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.			.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.									.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure													.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	F	G	D	L	K	A	M	L	V	.	.	D	V	A	K	R	G	G	S	F	I	G	L	N	P	I	H	A	L	Y	P	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	S	A	S	P	Y	S	P	S	S	R	R	W	L	N	V	I	Y	I	D	V	N	A	V	E	D	F	H	L	S	E	E	A	Q	A	W
Query Conservation													.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	W	Q	G	I	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	G	M	G	V	T	A	I	W	I	P	Q	P	V	E	N	I	Y	A	V	L	P	D	S	T	F	G	G	S	T	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	R	T	N	P	Y	F	G	S	F	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	S	T	T	G	G	G	T																				T	T	T					S	T	T	S		S									T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Q	L	P	T	T	Q	Q	T	L	Q	Q	A	R	D	A	D	W	V	D	Y	S	T	V	T	A	L	K	M	T	A	L	R	M	A	W	K	G	F	A	Q	R	D	D	E	Q	M	A	A	F	R	Q	F	V	A	E	Q	G	D	S	L	F	W	Q	A	A	F	D	A	L	H	A	Q	Q	V	K	E	D	E	M
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.		.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																																																																				.
Query SS confidence																																																																				.
Query Sequence		R	W	G	W	P	A	W	P	E	M	Y	Q	N	V	D	S	P	E	V	R	Q	F	C	E	E	H	R	D	D	V	D	F	Y	L	W	L	Q	W	L	A	Y	S	Q	F	A	A	C	W	E	I	S	Q	G	Y	E	M	P	I	G	L	Y	R	D	L	A	V	.	G	V	A	E	G	G	A	E	T	W	C	D	R
Query Conservation																																																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.							.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Q	N	L	I	N	T	A	H	A	H	N	I	K	V	.	.	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	E	T	D	P	T	Y	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T				.	.						T	T							S	S		T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template SS confidence
																																													119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.			.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		391	.				.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.																.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.		.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure				.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Query SS confidence				.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Query Sequence		E	L	.	.	.	Y	C	L	K	A	S	V	G	A	P	P	D	I	L	G	P	L	G	Q	N	W	G	L	P	P	M	D	P	H	I	I	T	A	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	P	F	I	E	L	L	R	A	N	M	Q	N	.	C	G	A	L	R	I	D	H	V	M
Query Conservation				.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Alig confidence				.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	G	R	L	Y	D	N	G	T	L	L	G	G	Y	T	N	D	T	N	G	Y	F	H	H	Y	G	G	T	D	F	S	S	Y	E	D	G	I	Y	R	N	L	F	D	L	A	D	L	N	Q	Q	N	S	T	I	D	S	Y	L	K	S	A	I	K	V	W	L	D	M	G	I	D	G	I	R	L	D	A	V	K
Template Known Secondary structure		T	T	T					T	T						S	T	T		T	T			B			S		B			S	S	S							S	B	S	T	T				B		T	T	S																T	T	T							T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	M	L	R	L	W	W	I	P	Y	G	E	T	A	D	Q	G	A	Y	V	H	Y	P	V	D	D	L	L	S	I	L	A	L	E	S	K	R	H	R	C	M	V	I	G	E	D	L	G	T	V	P	V	E	I	V	G	K	L	R	S	S	G	V	Y	S	Y	K	V	L	Y	F	E	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	G	W	Q	K	N	F	M	D	S	I	L	S	Y	R	P	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	T	N	E	I	D	V	N	N	T	Y	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	S	Q	K	V	R	Q	V
Template Known Secondary structure		G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																S												T	T													S	S	S			B
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		234	.																					.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
			524	.	.	.	.	.	530	.	.											.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	N	D	H	E	K	T	F	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	A	Y	P	E	Q	S	M	A	V	A	A	T	H	D	L	P
Query Conservation		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	D	N	T	D	T	M	Y	G	L	D	S	M	I	Q	S	T	A	S	D	Y	N	F	I	N	D	M	V	T	F	I	D	N	H	D	M	D
Template Known Secondary structure			T	S			S																	T	T	G	G	G					S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions