Job Description P15977 Confidence 98.08% Date Thu Jan 5 11:34:58 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 272 % Identity 22% Template c1zjaB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:trehalulose synthase; PDBTitle: crystal structure of the trehalulose synthase mutb from2 pseudomonas mesoacidophila mx-45 (triclinic form) Resolution 1.60 Å

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	Q	L	Y	T	L	R	S	E	K	N	W	G	I	G	D	F	G	D	L	K	A	M	L	V	D	V	A	K	R	G	G	S	F	I	G	L	N	P	I	H	A	L	Y	P	A	N	P	E	S	A	S	P	Y	S	P	S	S	R	R	W	L	N	V	I	Y	I	D	V	N	A	V	E	D	F	H	L	S	E	E
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	G	D	G	I	G	D	F	K	G	L	T	E	K	L	D	Y	L	K	G	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	A	S	.	.	.	.	P	N	T	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	R	E	V	M	K	E	Y	G	T	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T								T													.	.	.	.			T	T	T	T	S	S		S							G	G	G					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.					.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Q	A	W	W	Q	L	P	T	T	Q	Q	T	L	Q	Q	A	R	D	A	D	W	V	D	Y	S	T	V	T	A	L	K	M	T	A	L	R	M	A	W	K	G	F	A	Q	R	D	D	E	Q	M	A	A	F	R	Q	F	V	A	E	Q	G	D	S	L	F	W	Q	A	A	F	D	A	L	H	A	Q	Q	V	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	E	M	R	W	G	W	P	A	W	P	E	M	Y	Q	N	V	D	S	P	E	V	R	Q	F	C	E	E	H	R	D	D	V	D	F	Y	L	W	L	Q	W	L	A	Y	S	Q	F	A	A	C	W	E	I	S	Q	G	Y	E	M	P	I	G	L	Y	R	D	L	A	V	G	V	A	E	G	G	A	E	T	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.					.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	D	R	L	M	A	E	L	K	K	R	G	M	R	L	.	.	M	V	D	V	.	V	I	N	H	S	S	D	Q	H	E	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T				.	.					.			S	B			T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.					.
Template SS confidence
																																																81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.			.	.	.	100		.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
		388	.	390	.												.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	D	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Y	C	L	K	A	S	V	G	A	P	P	D	I	L	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	Q	N	W	G	L	P	P	M	D	P	H	I	I	T	A	R	A	Y	E	P	F	I	E	L	L
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		F	K	S	S	R	A	S	K	D	N	P	Y	R	D	Y	Y	F	W	R	D	G	K	D	G	H	E	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	W	E	K	D	P	V	T	G	Q	Y	Y	L	H	Y	F	G	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	T	P	K	L	.	.	.	.	.	R	E	E	L	Y	A	M	L
Template Known Secondary structure							T		S	S	S	T	T	G	G	G	B						B	T	T	B		S	S			B		T	T	S	S	B	S					T	T	T	T						S	S		T	T			B	B		T	T					.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.						.	180	.	.	.	.	.	.
		436	.	.	.	440	.		.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.							.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.															.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.															.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	N	M	Q	N	.	C	G	A	L	R	I	D	H	V	M	S	M	L	R	.	.	.	.	.	.	L	W	W	I	P	Y	G	E	T	A	D	Q	G	A	Y	V	H	Y	P	V	D	D	L	L	S	I	L	A	L	E	S	K	R	H	R	C	M	V	I	G	E	D	L	G	T	V	P	V	E	I	V	G	K
Query Conservation								.															.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.															.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	F	W	L	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V	A	T	Y	S	K	T	P	G	F	P	D	L	T	P	E	Q	M	K	N	F	A	E	A	Y	T	Q	G	P	N	L	H	R	Y	L	Q	E	M	H	E	K	V	F	D	H	Y	D	A	V	T	A	G	E	I	F	G	A	P	L	N	Q	V	P	L	F
Template Known Secondary structure						T	T	T							T	T	G	G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T												T	G	G	G	S										S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	S	S	G	V	Y	S	Y	K	V	L	Y	F	E	N	D	H	E	K	T	F	R	A	P	K	A	Y	P	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	M	A	V	A	A	T	H	D	L	P	T	L	R	G	Y	W	E	C	G	D	L	T	L	G	K	T	L
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	D	S	R	R	K	E	L	D	M	A	F	T	F	D	L	I	R	Y	D	R	A	L	D	R	W	H	T	I	P	R	T	L	A	D	F	R	Q	T	I	D	K	V	D	A	I	A	G	E	Y	G	W	N	T	F	F	L	G	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	D	R	P	Q	W	R	E	A	S
Template Known Secondary structure				G	G	G		S		S					S	T	T	T	T	T	T	B		T	T	S	S		B																				T	T	T			B				S			T	T	S								S			S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.