Job Description P05804 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 274 % Identity 18% Template d2je8a5 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases beta-glycanases Resolution 1.7

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		272	.	.	.	.	.	.	.	280									.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.			.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query Sequence		R	S	V	A	V	K	G	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	I	N	H	K	P	F	Y	F	T	G	F	G	R	H	E	D	A	D	L	R	G	K	G	F	D	N	V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	.	.	S	H	Y	P	Y	A	E	E	M	L	D	W	A
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.																								.																									.	.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		R	T	I	R	V	V	N	E	K	D	K	D	G	E	S	F	Y	F	E	V	N	G	I	P	M	F	A	K	G	A	N	Y	I	P	Q	D	A	L	L	P	.	N	V	T	T	E	R	Y	Q	T	L	F	R	D	M	K	E	A	N	M	N	M	V	R	I	W	G	G	G	T	Y	E	N	N	L	F	Y	D	L	A
Template Known Secondary structure												T	T									T	T													S		S	S	G	G	.	G																T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	N	G	I	L	V	W	Q	D	F	M	F	A	C	T	P	Y	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	T	F	L	K	R	V	E	A	E	A	V	Y	N	I	R	R	L	R	N	H	A	S	L	A	M	W	C	G	N	N	E	I	L	E	A	L	K	Y	W
Template Known Secondary structure					T								S		B	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				T	T		T	T						S		B	S								S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
																			420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	E	K	K	F	T	P	E	V	Y	Q	G	L	M	H	G	Y	D	K	L	F	R	E	L	L	P	S	T	V	K	E	F	D	S	D	R	F	Y	V	H	S	S	P	Y	L	A	N	W	G	R	P	E	S	W	G	T	G	D	S	H	N	W	G	V	W	Y	G	K	K	P	F	E	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	T	T	S																	T	T											T	T	S				S	S	B	S	S	S			T	T		G	G	G	T	T	B	S						T	T	T	T	T				G	G	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	D	T	D	L	P	R	F	M	S	E	F	G	F	Q	S	F	P	E	M	K	T	I	A	A	F	A	A	P	E	D	Y	Q	I	E	S	E	V	M	N	A	H	Q	K	S	S	I	G	N	S	L	I	R	T	Y	M	E	R	D	Y	I	I	P	E	S	F	E	D	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T	S			S	S								B													G	G	G		S	T	T	S						T	B		S	S	S		T											S				S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
					522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure		.	.	.																			.
Query SS confidence		.	.	.																			.
Query Sequence		.	.	.	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	.	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G
Query Conservation		.	.	.																			.
Alig confidence		.	.	.																			.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	V	G	L	V	L	Q	G	Q	G	M	R	H	G	L	E	A	H	R	R	N	R	P	Y	C	M	G	T	L	Y	W	Q	L	N	D	S	W	P	V	V	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	I	D	Y	Y	G	N	W	K	A	L	H	Y	Q	A	K	R	A	F	A	P
Template Known Secondary structure																							T	T	T	T							S		S			S	S	S		B	B	S	.	.	.	.	.	.	.	.		S	B		T	T	S		B											T
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.									.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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