Job Description P05804 Confidence 99.28% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 133 Aligned Residues 263 % Identity 21% Template d1wcga1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.10

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		H	K	Y	K	E	D	V	A	I	I	K	D	L	N	L	K	F	Y	R	F	S	I	S	W	A	R	I	A	P	S	G	V	M	N	S	L	E	P	K	G	I	A	Y	Y	N	N	L	I	N	E	L	I	K	N	D	I	I	P	L	V	T	M	Y	H	W	D	L	P	Q	Y	L	Q	D	L	G	G	W	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		S												S	T	T	S		T	T	S																			T	T									S	S			B						T	T	G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	P	I	M	S	D	Y	F	K	E	Y	A	R	V	L	F	T	Y	F	G	D	R	.	.	V	K	W	W	I	T	F	N	E	P	I	A	V	C	K	G	Y	S	I	K	A	Y	A	P	N	L	N	L	K	T	T	G	H	Y	L	A	G	H	T	Q	L	I	A	H	G	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	T	T																	T	T	T	.	.																			S	S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
											136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.			.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.				440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	.	.	.	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	Y	R	L	Y	E	E	M	F	K	P	T	Q	N	G	K	I	S	I	S	I	S	G	V	F	F	M	P	K	N	A	E	S	D	D	D	I	E	T	A	E	R	A	N	Q	F	E	R	G	W	F	G	H	P	V	Y	K	G	D	Y	P	P	I	M	K	K	W	V	D	Q	K	S	K	E	E	G	L	P	W	S
Template Known Secondary structure										T																				S	S	T	T																T									T	S	S	S															T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
																	459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	P	K	F	T	K	D	E	I	K	L	L	K	G	T	A	D	F	Y	A	L	N	H	Y	S	S	R	L	V	T	F	G	S	D	P	N	P	N	F	N	P	D	A	S	Y	V	T	S	V	D	E	A	W	L	K	P	N	E	T	P	Y	I	I	P	V	P	E	G	L	R	K	L	L	I	W	L	K	N	E
Template Known Secondary structure		S	S												T	T			S	S														S			S	S	T	T	S		G	G	G								G	G	G			S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		496	.	.	.		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.		.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure						.																																							.
Query SS confidence						.																																							.
Query Sequence		L	H	Q	P	.	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	.	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R
Query Conservation						.																																							.
Alig confidence						.										.	.	.	.																										.																	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.																																											.	.	.
Template Sequence		Y	G	N	P	Q	L	L	I	T	E	N	G	Y	G	.	.	.	.	D	D	G	Q	L	D	D	F	E	K	I	S	Y	L	K	N	Y	L	N	A	T	L	Q	A	M	Y	E	D	K	C	N	V	I	G	Y	T	V	W	S	L	L	D	.	.	.	N	F	E	W	F	Y	G	Y	S	I	H	F	G	L	V	K	I
Template Known Secondary structure			T	S												.	.	.	.	B	S			S	S																																		S	B		.	.	.				G	G	G	G	G	G	S	B			S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.																																											.	.	.
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.					.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420				.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		574								.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	.	.	.	.	.	.	.	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G	M	N
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	F	N	D	P	Q	R	T	R	T	K	R	E	S	Y	T	Y	F	K	N	V	V	S	T	G	K
Template Known Secondary structure			T	T	S	T	T																			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions