Job Description P05804 Confidence 99.29% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 129 Aligned Residues 266 % Identity 22% Template d1v08a_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.9

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	M	Y	K	T	D	V	R	L	L	K	E	M	G	M	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	I	L	P	K	G	T	K	E	G	G	I	N	P	D	G	I	K	Y	Y	R	N	L	I	N	L	L	L	E	N	G	I	E	P	Y	V	T	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	H	W	D	V	P	Q	A	L
Template Known Secondary structure														T	T		S												S	T	T	S	S	T	T	T																				T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			B
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.									.	.	.	.	.	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.
Template Sequence		E	E	K	Y	G	G	F	L	D	K	S	H	K	S	I	V	E	D	Y	T	Y	F	A	K	V	C	F	D	N	F	G	D	K	.	.	V	K	N	W	L	T	F	N	D	P	Q	T	F	T	S	F	S	Y	G	T	G	V	F	A	P	G	R	C	S	P	G	L	D	C	A	Y	P	T	G	N	S	L	V	E	P
Template Known Secondary structure							G	G	G		T	T	S	S																		T	T	T	.	.																			T	S			S	T	T		B			T	T	S	S	S	S	B	T	T	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.			.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.			.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	.	.	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	A	G	H	N	I	L	L	A	H	A	E	A	V	D	L	Y	N	K	H	Y	K	R	D	D	T	R	I	G	L	A	F	D	V	M	G	R	V	P	Y	G	T	S	F	L	D	K	Q	A	E	E	R	S	W	D	I	N	L	G	W	F	L	E	P	V	V	R	G	D	Y	P	F	S	M	R	S	L	A	R
Template Known Secondary structure																							T			T	T															S	S	S	S															T										S	S										G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
																	458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	L	P	F	F	K	D	E	Q	K	E	K	L	A	G	S	Y	N	M	L	G	L	N	Y	Y	T	S	R	F	S	K	N	I	D	I	S	P	N	Y	S	P	V	L	N	T	D	D	A	Y	A	S	Q	E	V	N	G	P	D	G	K	P	I	G	P	P	M	G	N	P	W	I	Y	M	Y	P	E	G	L	K
Template Known Secondary structure		G	G	S												T	T			S																			T	T				S	S	G	G	G	G	G						S	B		T	T	S		B	S	S		B		S	S	S	S		B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.							.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	.	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	.	.	.	.	.	.	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G
Query Conservation												.																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.																							.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.
Template Sequence		D	L	L	M	I	M	K	N	K	Y	G	N	P	P	I	Y	I	T	E	N	G	I	G	D	V	D	T	K	E	T	P	L	P	M	E	A	A	L	N	D	Y	K	R	L	D	Y	I	Q	R	H	I	A	T	L	K	E	S	I	D	L	G	S	N	V	Q	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	.	.	.	N	F	E
Template Known Secondary structure										T	S																		S	S	S																														T	T											S	B		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.				.	.	.
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.							.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	.	.	.	.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R
Query Conservation														.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	F	A	G	F	T	E	R	Y	G	I	V	Y	V	D	R	N	N	N	C	T	R	Y	M	K	E	S	A	K	W	L	K	E	F
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	S					S					T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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