Job Description P05804 Confidence 99.37% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 120 Aligned Residues 268 % Identity 21% Template d1uwsa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 1.95

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.						330	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	.	.	.	.	.	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I
Query Conservation																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	N	Y	K	T	F	H	D	N	A	Q	K	M	G	L	K	I	A	R	L	N	V	E	W	S	R	I	F	P	N	P	L	P	R	P	F	D	E	S	K	Q	D	V	T	E	V	E	I	N	E	N	E	L	K	R	L	D	E	Y	A	N	K	D	A	L	N	H	Y	R	E	I	F	K	D	L	K	S	R	G	L
Template Known Secondary structure														T	T																S								T	T		S																	T	T	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.														.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		Y	F	I	L	N	M	Y	H	W	P	L	P	L	W	L	H	D	P	I	R	V	R	R	G	D	F	T	G	P	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	S	T	R	T	V	Y	E	F	A	R	F	S	A	Y	I	A	W	K	F	D	.	.	D	L	V	D	E	Y	S	T	M	N	E
Template Known Secondary structure							S		S	S			B	T	T	T	B							T	T			S	S		B	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S																			T	.	.	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.															.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.			.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		414	.	.	.																										.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	D	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	N	V	V	G	G	L	G	Y	V	G	V	K	S	G	F	P	P	G	Y	L	S	F	E	L	S	R	R	A	M	Y	N	I	I	Q	A	H	A	R	A	Y	D	G	I	K	S	V	S	K	K	P	V	G	I	I	Y	A	N	S	S	F	Q	P	L	T	D	K	D	M	E	A	V	E	M	A	E	N	D	N	R
Template Known Secondary structure											T		G	G	G			T	T																												T	T			S														S	S	T	T													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
																						457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	W	F	F	D	A	I	I	R	G	E	I	T	K	I	V	R	D	D	L	K	G	R	L	D	W	I	G	V	N	Y	Y	T	R	T	V	V	K	R	T	E	K	G	Y	V	S	L	G	G	Y	G	H	G	C	E	R	N	S	V	S	L	A	G	L	P	T	S	D	F	G	W	E	F	F	P	E	G	L	Y	D
Template Known Secondary structure																			T	T	T	T	T			S																S	S	S					T	T	S	T	T	S	S		S	S	S	B		T	T	S		B	B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.
Template Sequence		V	L	T	K	Y	W	N	R	Y	H	L	Y	M	Y	V	T	E	N	G	I	.	.	.	.	.	.	.	A	D	D	A	D	Y	Q	R	P	Y	Y	L	V	S	H	V	Y	Q	V	H	R	A	I	N	S	G	A	D	V	R	G	Y	L	H	W	S	L	A	D	.	.	.	N	Y	E	W	A	S	G	F	S	M	R
Template Known Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.			T	T		S	S																		T	T									S		S	B		.	.	.				G	G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390								.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.				430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		568	.	570	.						.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	I	F	.	.	.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G	M	N	F	G	E	K	P	Q	Q	G	G	K
Query Conservation						.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	L	L	K	V	D	Y	N	T	K	R	L	Y	W	R	P	S	A	L	V	Y	R	E	I	A	T	N	G	A	I	T	D	E	I	E	H	L	N	S
Template Known Secondary structure				S					T	T	T																			T				G	G	G	G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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