Job Description P05804 Confidence 99.41% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 113 Aligned Residues 278 % Identity 22% Template d1qvba_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.40

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.						330	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	.	.	.	.	.	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D
Query Conservation																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	L	N	Q	N	D	H	D	L	A	E	K	L	G	V	N	T	I	R	V	G	V	E	W	S	R	I	F	P	K	P	T	F	N	V	K	V	P	V	E	R	D	E	N	G	S	I	V	H	V	D	V	D	D	K	A	V	E	R	L	D	E	L	A	N	K	E	A	V	N	H	Y	V	E	M	Y	K	D	W	V
Template Known Secondary structure														T	T															S	S			T	T	S								T	T	S																			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																																																												.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.
Template Sequence		E	R	G	R	K	L	I	L	N	L	Y	H	W	P	L	P	L	W	L	H	N	P	I	M	V	R	R	M	G	P	D	R	A	P	S	G	W	L	N	E	E	S	V	V	E	F	A	K	Y	A	A	Y	I	A	W	K	M	G	.	.	E	L	P	V	M	W	S	T	M	N	E	P	N	V	V	Y	E	Q	G	Y
Template Known Secondary structure		T	T	T							S			S			B	T	T	T	B										G	G	G	S		B	G	G	G	S	T																		T	.	.	T	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.			.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
																						418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.																																		.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	F	V	K	G	G	F	P	P	G	Y	L	S	L	E	A	A	D	K	A	R	R	N	M	I	Q	A	H	A	R	A	Y	D	N	I	K	R	F	S	K	K	P	V	G	L	I	Y	A	F	Q	W	F	E	L	L	E	G	P	A	E	V	F	D	K	F	K	S	S	K	L	Y	Y	F	T	D	I	V	S	K	G
Template Known Secondary structure		T		G	G	G			T	T																																S														S	S	S			S										T	S	T	T	T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	S	I	I	N	V	E	Y	R	R	D	L	A	N	R	L	D	W	L	G	V	N	Y	Y	S	R	L	V	Y	K	I	V	D	D	K	P	I	I	L	H	G	Y	G	F	L	C	T	P	G	G	I	S	P	A	E	N	P	C	S	D	F	G	W	E	V	Y	P	E	G	L	Y	L	L	L	K	E	L	Y	N	R
Template Known Secondary structure				S	S						T	T	T	S	S			S																T	T						T	T	S	G	G	G	S		T	T		B		T	T	S		B	B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template Sequence		Y	G	V	D	L	I	V	T	E	N	G	V	.	.	.	.	.	.	.	S	D	S	R	D	A	L	R	P	A	Y	L	V	S	H	V	Y	S	V	W	K	A	A	N	E	G	I	P	V	K	G	Y	L	H	W	S	L	T	D	N	Y	E	.	.	.	W	A	Q	G	F	R	Q	K	F	G	L	V	M	V	D	F
Template Known Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.			T	T		S	S																		T	T											S	B					.	.	.	G	G	G	T	T	S	S				S					T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.								390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.				.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
			572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G	M	N	F	G	E	K	P	Q
Query Conservation		.
Alig confidence		.
Template Conservation
Template Sequence		K	T	K	K	R	Y	L	R	P	S	A	L	V	F	R	E	I	A	T	H	N	G	I	P	D	E	L	Q
Template Known Secondary structure		T	T	T																		T	B			G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions