Job Description P05804 Confidence 99.54% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 102 Aligned Residues 260 % Identity 21% Template d1qoxa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.7

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		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	E	E	D	V	Q	L	L	K	D	L	G	V	K	V	Y	R	F	S	I	S	W	P	R	V	L	P	Q	G	T	G	E	V	N	R	A	G	L	D	Y	Y	H	R	L	V	D	E	L	L	A	N	G	I	E	P	F	C	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	A	L	Q	D	Q	G	G	W	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T		S												S	T	T	S	S	S	S																			T	T									S	S			B					T	T	T	G	G	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.														.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.											.	430
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																								.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	S	R	I	T	I	D	A	F	A	E	Y	A	E	L	M	F	K	E	L	G	G	K	.	.	I	K	Q	W	I	T	F	N	E	P	W	C	M	A	F	L	S	N	Y	L	G	V	H	A	P	G	N	K	D	L	Q	L	A	I	D	V	S	H	H	L	L	V	A	H	G	R	A	V	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	G	S	T																		T	T	T	.	.																			T	S		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
								135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	F	R	E	L	G	I	S	G	E	I	G	I	A	P	N	T	S	W	A	V	P	Y	R	R	T	K	E	D	M	E	A	C	L	R	V	N	G	W	S	G	D	W	Y	L	D	P	I	Y	F	G	E	Y	P	K	F	M	L	D	W	Y	E	N	L	G	Y	K	P	P	I	V	D	G	D	M	E	L	I	H	Q
Template Known Secondary structure						T	T			S														S	S	S														T	T	T									T	S	S													T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query Sequence		L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	.	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Conservation
Template Sequence		P	I	D	F	I	G	I	N	Y	Y	T	S	S	M	N	R	Y	N	P	G	E	A	G	G	M	L	S	S	E	A	I	S	M	G	A	P	K	T	D	I	G	W	E	I	Y	A	E	G	L	Y	D	L	L	R	Y	T	A	D	K	Y	G	N	P	T	L	Y	I	T	E	N	G	A	C	Y	N	D	G	L	S	L
Template Known Secondary structure				S							S									S	S	G	G	G	T	T	T	T										B		T	T	S		B			T														T	T	S																		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		516	.	.	.	520	.	.	.			.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.						.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.																																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.																																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	Y	T	D	M	W	S	E	.	.	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	.	.	.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R
Query Conservation										.	.																																																	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.																															.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.
Template Sequence		D	G	R	I	H	D	Q	R	R	I	D	Y	L	A	M	H	L	I	Q	A	S	R	A	I	E	D	G	I	N	L	K	G	Y	M	E	W	S	L	M	D	.	.	.	N	F	E	W	A	E	G	Y	G	M	R	F	G	L	V	H	V	D	Y	D	T	L	V	R	T	P	K	D	S	F	Y	W	Y	K	G	V
Template Known Secondary structure		T	S	S																							T	T											S	B		.	.	.				G	G	G	T	T	S	S				S					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.				.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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