Job Description P05804 Confidence 99.28% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 131 Aligned Residues 266 % Identity 24% Template c3u57A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:raucaffricine-o-beta-d-glucosidase; PDBTitle: structures of alkaloid biosynthetic glucosidases decode substrate2 specificity Resolution 2.43 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.						330	.	.	.	.															.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	.	.	.	.	.	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N
Query Conservation																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		H	L	Y	K	E	D	V	N	I	L	K	N	L	G	L	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	S	R	V	L	P	G	G	R	L	S	G	G	V	N	K	E	G	I	N	Y	Y	N	N	L	I	D	G	L	L	A	N	G	I	K	P	F	V	T	L	F	H	W	D	V	P	Q	A	L	E	D	E	Y	G	G	.	.
Template Known Secondary structure															T		S												S	T	T	S	S	G	G	G																				T	T									S	S			B									G	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	R	P	Q	G	A
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	S	P	R	I	V	D	D	F	C	E	Y	A	E	L	C	F	W	E	F	G	D	R	.	.	V	K	H	W	M	T	L	N	Q	P	W	T	F	S	V	H	G	Y	A	T	G	L	Y	A	P	G	R	G	R	S	T	G	N	P	G	T	E	P	Y	W	V	T	H	H	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T																		T	T	T	.	.																			T	S			S	T	T									T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
											154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.			.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.				.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	.	.	.	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	A	H	A	A	A	V	E	L	Y	K	N	K	F	Q	R	G	Q	E	G	Q	I	G	I	S	H	A	T	Q	W	M	E	P	W	D	E	N	S	A	S	D	V	E	A	A	A	R	A	L	D	F	M	L	G	W	F	M	E	P	I	T	S	G	D	Y	P	K	S	M	K	K	F	V	G	S	R	L	P	K
Template Known Secondary structure																T																				S	S	S	S																T										S	S										G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
												458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	470	.	.	.	.	.	.	.	.		.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	.	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	P	E	Q	S	K	M	L	K	G	S	Y	D	F	V	G	L	N	Y	Y	T	A	S	Y	V	T	N	A	S	N	F	S	Y	N	T	D	I	H	V	T	Y	E	T	D	R	N	G	V	P	I	G	P	Q	S	G	S	D	W	L	L	I	Y	P	E	G	I	R	K	I	L	V	Y	T	K	K	T	Y	N	V
Template Known Secondary structure											T	T			S																								T							B	S	S	S		B	S	S		B		S	S	T	T		B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		499		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540					.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure			.																																										.	.	.	.																																.	.
Query SS confidence			.																																										.	.	.	.																																.	.
Query Sequence		P	.	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	.	.	.	.	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	.	.
Query Conservation			.																																										.	.	.	.																																.	.
Alig confidence			.																																										.	.	.	.														.	.	.																.	.
Template Conservation																																																														.	.	.
Template Sequence		P	L	I	Y	V	T	E	N	G	V	D	D	V	K	N	T	N	L	T	L	S	E	A	R	K	D	S	M	R	L	K	Y	L	Q	D	H	I	F	N	V	R	Q	A	M	N	D	G	V	N	V	K	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	.	.	.	N	F	E	W	G	E	G	Y	G	V	R	F	G	I	I	H	I
Template Known Secondary structure		S															T	T							T																						T	T									S		S	B		.	.	.				G	G	G	T	T	S					S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.				.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
						572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	N	D	N	F	A	R	Y	P	K	D	S	A	V	W	L	M	N	S	F	H	K
Template Known Secondary structure			T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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