Job Description P05804 Confidence 99.28% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 132 Aligned Residues 266 % Identity 21% Template c3ptkB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:beta-glucosidase os4bglu12; PDBTitle: the crystal structure of rice (oryza sativa l.) os4bglu12 Resolution 2.49 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.						330	.	.	.	.															.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	.	.	.	.	.	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N
Query Conservation																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		H	L	Y	K	E	D	V	R	L	M	K	D	M	G	M	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	T	R	I	L	P	N	G	S	L	R	G	G	V	N	K	E	G	I	K	Y	Y	N	N	L	I	N	E	L	L	S	K	G	V	Q	P	F	I	T	L	F	H	W	D	S	P	Q	A	L	E	D	K	Y	N	G	.	.
Template Known Secondary structure															T		S												S	T	T	S	S	S	T	T																			T	T	T									S	S			B									G	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	S	P	N	I	I	N	D	F	K	D	Y	A	E	I	C	F	K	E	F	G	D	R	V	K	N	.	.	W	I	T	F	N	E	P	W	T	F	C	S	N	G	Y	A	T	G	L	F	A	P	G	R	C	S	P	W	E	K	G	N	C	S	V	G	D	S	G	R	E	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T																		T	T	T				.	.																T	B			S	T	T			B		T	T	S	T	T			S	S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template SS confidence
											147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.			.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
			416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.				.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	.	.	.	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																					.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	A	C	H	H	Q	L	L	A	H	A	E	T	V	R	L	Y	K	A	K	Y	Q	A	L	Q	K	G	K	I	G	I	T	L	V	S	H	W	F	V	P	F	S	R	S	K	S	N	N	D	A	A	K	R	A	I	D	F	M	F	G	W	F	M	D	P	L	I	R	G	D	Y	P	L	S	M	R	G	L	V
Template Known Secondary structure																							T																				S	S	S	S															T										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
																456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	N	R	L	P	Q	F	T	K	E	Q	S	K	L	V	K	G	A	F	D	F	I	G	L	N	Y	Y	T	A	N	Y	A	D	N	L	P	P	S	N	G	L	N	N	S	Y	T	T	D	S	R	A	N	L	T	G	V	R	N	G	I	P	I	G	P	Q	A	A	S	P	W	L	Y	V	Y	P	Q	G	F	R	D
Template Known Secondary structure		G	G	G	S												T	T			S																				S	S	S							T						S			T	T			S	S		B		S	S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540					.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure														.																																										.	.	.	.
Query SS confidence														.																																										.	.	.	.
Query Sequence		E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	.	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	.	.	.	.	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R
Query Conservation														.																																										.	.	.	.
Alig confidence														.																																										.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.
Template Sequence		L	L	L	Y	V	K	E	N	Y	G	N	P	T	V	Y	I	T	E	N	G	V	D	E	F	N	N	K	T	L	P	L	Q	E	A	L	K	D	D	A	R	I	E	Y	Y	H	K	H	L	L	S	L	L	S	A	I	R	D	G	A	N	V	K	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	.	.	.	N	F	E	W	S	N
Template Known Secondary structure																												T	T	S						T																						T	T											S	B		.	.	.				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.				.	.	.	450	.	.
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.							.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	.	.	.	.	.	.	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G
Query Conservation														.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Y	T	V	R	F	G	I	N	F	V	D	Y	N	D	G	R	K	R	Y	P	K	N	S	A	H	W	F	K	K	F	L	L	K
Template Known Secondary structure		T	T	S					S					T	T	T	T	T															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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