Job Description P05804 Confidence 99.44% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 109 Aligned Residues 263 % Identity 20% Template c3pn8A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative phospho-beta-glucosidase; PDBTitle: the crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase from streptococcus2 mutans ua159 Resolution 1.69 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		H	H	Y	K	E	D	V	K	L	F	A	E	X	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	E	P	N	E	A	G	L	Q	F	Y	D	D	L	F	D	E	C	L	K	Y	G	I	E	P	V	V	T	L	S	H	F	E	L	P	Y	H	L	V	T	E	Y	G	G	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		S													S	S	S			S	S																			T	T									S	S			B									G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	N	R	K	V	I	D	F	F	V	H	F	A	E	V	C	F	R	R	Y	K	D	K	.	.	V	K	Y	W	X	T	F	N	E	I	N	N	Q	A	N	Y	Q	E	D	F	A	P	F	T	N	S	G	I	V	Y	K	E	G	D	D	R	E	A	I	X	Y	Q	A	A	H	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T																		T	T	T	.	.								T	T	G	G	G	G	G			S	S	S													T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
										144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.			.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
						425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	V	A	S	A	R	A	V	K	I	G	H	A	I	N	P	N	L	N	I	G	C	X	V	A	X	C	P	I	Y	P	A	T	C	N	P	K	D	I	L	X	A	Q	K	A	X	Q	K	R	Y	Y	F	A	D	V	H	V	H	G	F	Y	P	E	H	I	F	K	Y	W	E	R	K	A	I	K	V	D	F	T
Template Known Secondary structure																		T	T															S	S	S																									S	S													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
													460	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	D	K	K	D	L	F	E	G	T	V	D	Y	I	G	F	S	Y	Y	X	S	F	V	I	D	A	H	R	E	N	N	P	Y	Y	D	Y	L	E	T	E	D	L	V	K	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	D	W	Q	I	D	P	Q	G	L	R	Y	A	L	N	W	F	T	D	X	Y	H	L	P	L	F	I
Template Known Secondary structure														S							S							S			S	S		T	T					T	T	T	S					T	T	S		B		T	T			B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.			.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.		.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure																								.	.																.																										.								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.																.																										.								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	.	.	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	.	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	.	G	N	K	K	G	I	F	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.																.																										.								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.																.															.	.	.									.								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.
Template Sequence		V	E	N	G	F	G	A	I	D	Q	V	E	A	D	G	X	V	H	D	D	Y	R	I	D	Y	L	G	A	H	I	K	E	X	I	K	A	V	D	E	D	G	V	E	L	X	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	.	.	.	L	V	S	A	G	T	G	E	X	R	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	K	D	D	E
Template Known Secondary structure								B				B		T	T	S	S	B																						T	T										B	T	S	B		.	.	.				S	S	S			S	S	S	B			S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.				.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
					572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	K	G	T	L	K	R	S	P	K	L	S	F	N	W	Y	K	E	V
Template Known Secondary structure		S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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