Job Description P05804 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 528 % Identity 26% Template c3mv14_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: 4: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: e.coli (lacz) beta-galactosidase (r599a) in complex with guanidinium Resolution 2.20 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.																.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	P	T	R	E	I	K	K	L	D	G	L	W	A	F	S	L	D	R	E	N	C	G	I	D	Q	R	W	W	E	S	A	L	Q	E	S	R	A	I	A	V	P	G	S	F	N	D	Q	F	A	D	A	D	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	A	G	N	V	W	Y	Q	R
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	P	S	Q	Q	L	R	S	L	N	G	E	W	R	F	A	W	F	P	A	P	E	A	V	P	E	S	W	L	E	C	D	L	P	E	A	D	T	V	V	V	P	S	N	W	Q	M	H	G	Y	D	A	P	I	Y	T	N	V	T	Y	P	I	T	V	N	P	P	F	V	P	T	E	N	P	T	G	C	Y	S	L
Template Known Secondary structure					T	T														S	S	G	G	G	S		T					S			T	T							S			T	T	T	T	T	S	S						S	S	S		S	S		S		T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		72	.	.	.	.	.	.	.		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		E	V	F	I	P	K	G	W	.	A	G	Q	R	I	V	L	R	F	D	A	V	T	H	Y	G	K	V	W	V	N	N	Q	E	V	M	E	H	Q	G	G	Y	T	P	F	E	A	D	V	T	P	Y	V	I	A	G	K	S	V	R	I	T	V	C	V	N	N	E	L	N	W	Q	T	I	P	P	G	M	V	I	T
Query Conservation										.
Alig confidence										.																																															.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	F	N	V	D	E	S	W	L	Q	E	G	Q	T	R	I	I	F	D	G	V	N	S	A	F	H	L	W	C	N	G	R	W	V	G	Y	G	Q	D	S	R	L	P	S	E	F	D	L	S	A	F	L	R	A	G	.	E	N	R	L	A	V	M	V	L	R	W	S	D	G	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S					S	S							S			B	S							T	T									T	T	S							T	T	T			S	S	.										S			G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210							.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	N	G	K	K	K	Q	S	Y	F	H	D	F	F	N	Y	A	G	I	H	R	S	V	M	L	Y	T	T	P	N	T	W	V	D	D	I	T	V	V	T	H	V	A	Q	D	C	N	H	A	S	V	D	W	Q	V	V	A	N	G	.	.	.	.	.	.	D	V	S	V	E	L	R	D	A	D	Q	Q	V	V
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	D	Q	D	M	W	R	M	S	G	I	F	R	D	V	S	L	L	H	K	P	T	T	Q	I	S	D	F	H	V	A	T	R	F	N	D	D	F	S	R	A	V	L	E	A	E	V	Q	M	C	G	E	L	R	D	Y	L	R	V	T	V	S	L	W	Q	G	E	T	Q	V	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	G	B			S						B			S									S	S													T	T	S	S												S				T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
																	225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.			.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	G	Q	G	T	S	G	T	L	Q	V	V	N	P	H	L	W	Q	P	G	E	G	Y	L	Y	E	L	C	V	T	A	K	.	.	S	Q	T	E	C	D	I	Y	P	L	R	V	G	I	R	S	V	A	V	K	G	E	Q	F	L	I	N	H	K	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	T	A	P	F	G	G	E	I	I	D	E	R	G	G	Y	A	D	R	V	T	L	R	L	N	V	E	N	P	K	L	W	S	A	E	I	P	N	L	Y	R	A	V	V	E	L	H	T	A	D	G	T	L	I	E	A	E	A	C	D	V	G	F	R	E	V	R	I	E	N	G	L	L	L	L	N	G	K	P
Template Known Secondary structure							S							T	T				T	T										S			B	B		S	S	S	B												T	T													B							T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	F	T	G	F	G	R	H	E	D	A	D	L	R	G	K	G	F	D	N	V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A
Query Conservation
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	I	R	G	V	N	R	H	E	H	H	P	L	H	G	Q	V	M	D	E	Q	T	M	V	Q	D	I	L	L	M	K	Q	N	N	F	N	A	V	R	C	S	H	Y	P	N	H	P	L	W	Y	T	L	C	D	R	Y	G	L	Y	V	V	D	E	A	N	I	E	T	H	G	M	V	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													B	T	T	T	B	T																	T	T							T	T	S														T								S		B		T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	P	M	N	R	L	T	D	D	P	R	W	L	P	A	M	S	E	R	V	T	R	M	V	Q	R	D	R	N	H	P	S	V	I	I	W	S	L	G	N	E	S	G	H	.	.	.	.	.	G	A	N	H	D	A	L	Y	R	W	I	K	S	V	D	P	S	R	P	V	Q	Y	E	G	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	T	T	T		G	G	G																T	T		T	T								S	S				.	.	.	.	.																T	T	S						T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
								422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.						.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.													.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.													.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	T	T	A	T	D	I	I	C	P	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Y	A	R	V	D	E	D	Q	P	F	P	A	V	P	K	W	S	I	K	K	W	L	S	L	P	.	.	G	E	T	R	P	L	I	L	C	E	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	H	A	M	G	N	S	L	G	G	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	S	T	T		S	S	B			.	.	.	.	.	.	.	.	B	S			S	S			B			S	S	S		B								T	S	T	.	.	T											S	.	.	.	.	.	.	.				S	S			T	T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.													.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.									.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.			.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.								540	.	.	.	.	.	.	.	.
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	F	A	K	Y	W	Q	A	F	R	Q	Y	P	R	L	Q	G	G	F	V	W	D	W	V	D	Q	S	L	I	K	Y	D	E	N	G	N	P	W	S	A	Y	G	G	D	F	G	D	T	P	N	D	A	Q	F	C	M	N	G	L	V	F	A	D	R	T	P	H	P	A	L	T	E	A	K	H	Q	Q	Q	F
Template Known Secondary structure		.	.												T	T							S		S	B									T	T								T	T	T	T	S			S			G	G	G	G				S	B		T	T	S		B		T									T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
		591	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	N	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	Q	F
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		627	.	.