Job Description P05804 Confidence 99.25% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 137 Aligned Residues 263 % Identity 20% Template c3gnoA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:os03g0212800 protein; PDBTitle: crystal structure of a rice os3bglu6 beta-glucosidase Resolution 1.83 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		H	R	F	E	E	D	I	Q	L	M	A	D	M	G	M	D	A	Y	R	F	S	I	A	W	S	R	I	Y	P	N	G	V	G	Q	V	N	Q	A	G	I	D	H	Y	N	K	L	I	D	A	L	L	A	K	G	I	Q	P	Y	V	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	A	L	E	D	K	Y	K	G	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T	T		S													T	T	S	S	S	S																			T	T									S	S			B									G	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.																																				.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	W	L	D	R	Q	I	V	D	D	F	A	A	Y	A	E	T	C	F	R	E	F	G	D	R	.	.	V	K	H	W	I	T	L	N	E	P	H	T	V	A	I	Q	G	Y	D	A	G	L	Q	A	P	G	R	C	S	V	L	L	H	L	Y	C	K	A	G	N	S	G	T	E	P	Y	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T																		T	T	T	.	.																			T	S			S	T	T					T	T	T		T	T		S	S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
									146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.			170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.				.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	.	.	.	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	H	H	F	I	L	A	H	A	A	A	A	S	I	Y	R	T	K	Y	K	A	T	Q	N	G	Q	L	G	I	A	F	D	V	M	W	F	E	P	M	S	N	T	T	I	D	I	E	A	A	K	R	A	Q	E	F	Q	L	G	W	F	A	D	P	F	F	F	G	D	Y	P	A	T	M	R	A	R	V	G	E
Template Known Secondary structure																					T																				S	S	S	S															T										S	S										G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
																		460	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	P	R	F	T	A	D	E	A	A	V	V	K	G	A	L	D	F	V	G	I	N	H	Y	T	T	Y	Y	T	R	H	N	N	T	N	I	I	G	T	L	L	N	N	T	L	A	D	T	G	T	V	S	L	P	F	K	N	G	K	P	I	G	D	R	A	N	S	I	W	L	Y	I	V	P	R	G	M	R	S
Template Known Secondary structure		G	S												T	T			S																			S	S	S											T					S			T	T			S	S		B		S	S	T	T		B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.		.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510					.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure													.													.	.	.	.																														.
Query SS confidence													.													.	.	.	.																														.
Query Sequence		E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	.	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	.	.	.	.	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	.	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L
Query Conservation													.													.	.	.	.																														.
Alig confidence													.													.	.	.	.																														.															.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.
Template Sequence		L	M	N	Y	V	K	E	R	Y	N	S	P	P	V	Y	I	T	E	N	G	M	D	D	S	N	N	P	F	I	S	I	K	D	A	L	K	D	S	K	R	I	K	Y	H	N	D	Y	L	T	N	L	A	A	S	I	K	E	D	G	C	D	V	R	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	.	.	.	N	W	E	W	A
Template Known Secondary structure											T	S																T	T	S						T																						T	T												S	B		.	.	.				G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.				.	450	.	.	.
		562	.	.	.	.	.	.	.	570	.							.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	.	.	.	.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R
Query Conservation												.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	Y	S	S	R	F	G	L	Y	F	V	D	Y	K	D	N	L	K	R	Y	P	K	N	S	V	Q	W	F	K	A	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	G					S					T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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