Job Description P05804 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 516 % Identity 23% Template c3gm8A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycoside hydrolase family 2, candidate beta-glycosidase; PDBTitle: crystal structure of a beta-glycosidase from bacteroides vulgatus Resolution 2.40 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.										.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	I	K	K	L	D	G	L	W	A	F	S	L	D	R	E	N	C	G	I	D	Q	R	W	W	E	S	A	L	Q	E	S	R	A	I	A	V	P	G	S	F	N	D	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	A	D	I	R	N	Y	A	G	N	V	W	Y	Q	R	E	V	F	I	P	K	G	W	A	G
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.
Template Sequence		E	T	I	N	F	C	K	G	W	K	F	H	L	G	D	A	G	K	G	A	S	S	S	S	Y	.	.	N	D	S	Q	W	R	I	L	N	I	P	H	D	W	S	I	E	G	T	Y	K	Q	F	E	N	G	T	D	W	Q	S	G	F	L	P	A	G	I	S	W	Y	R	K	T	F	T	I	P	S	K	W	K	N
Template Known Secondary structure								S	S						S				G	G	G	G	S	S	S		.	.			T	T	S					S	S			G	G	G	G	S				S	S	T	T	S			T	T	T	T	S																S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.			.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	R	I	V	L	R	F	D	A	V	T	H	Y	G	K	V	W	V	N	N	Q	E	V	M	E	H	Q	G	G	Y	T	P	F	E	A	D	V	T	P	Y	V	I	A	G	K	S	V	R	I	T	V	C	V	N	N	E	L	N	W	Q	T	I	P	P	G	M	V	I	T	D	E	N	G	K	K	K	Q	S	Y	F
Query Conservation
Alig confidence																																														.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	V	Q	I	L	F	E	G	V	Y	L	N	S	E	V	W	I	N	G	H	W	L	G	K	R	P	N	G	Y	I	S	F	V	Y	D	L	T	P	Y	L	Q	E	G	.	K	N	Q	I	A	V	K	V	D	H	S	K	A	L	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S			B	S							T	T									S	S								G	G	G			S	S	.												S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																														.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.		.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.			.	.	.	190	.		.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210					.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.					.	230
Predicted Secondary structure																											.	.						.																				.	.	.	.																			.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.						.																				.	.	.	.																			.	.	.	.
Query Sequence		H	D	F	F	N	Y	A	G	I	H	R	S	V	M	L	Y	T	T	P	N	T	W	V	D	D	.	.	I	T	V	V	T	.	H	V	A	Q	D	C	N	H	A	S	V	D	W	Q	V	V	A	N	G	.	.	.	.	D	V	S	V	E	L	R	D	A	D	Q	Q	V	V	A	T	G	Q	.	.	.	.	G	T
Query Conservation																											.	.						.																				.	.	.	.																			.	.	.	.
Alig confidence		.																									.	.						.																				.	.	.	.																			.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	R	W	Y	T	G	S	G	I	Y	R	P	V	Y	L	L	V	S	N	P	T	H	I	P	Y	S	G	I	H	F	R	S	K	L	Q	N	K	Q	S	A	T	Y	T	L	S	I	E	I	E	T	Q	E	K	K	P	I	K	V	K	T	Y	L	Q	A	P	N	G	S	I	A	D	T	S	E	K	I	F	V	L	C
Template Known Secondary structure		.	S	S					B			S									S	S	B			T	T										T	T	T											B		S			S											T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.																									.
Query SS confidence																												.																									.
Query Sequence		S	G	T	L	Q	V	V	N	P	H	L	W	Q	P	G	E	G	Y	L	Y	E	L	C	V	T	A	.	K	S	Q	T	E	C	D	I	Y	P	L	R	V	G	I	R	S	V	A	V	K	G	E	Q	.	F	L	I	N	H	K	P	F	Y	F	T	G	F	G	R	H	E	D	A	D	L	R	G	K	G	F	D	N
Query Conservation																												.																									.
Alig confidence																												.																									.
Template Conservation
Template Sequence		F	L	S	G	S	I	R	K	P	L	L	W	S	P	D	S	P	N	V	Y	T	L	I	C	Q	L	T	R	D	N	K	I	L	D	E	C	R	L	P	V	G	F	R	Q	L	E	F	N	P	V	S	G	F	L	L	N	G	K	S	L	K	I	K	G	V	C	D	H	H	T	V	G	A	V	G	A	A	V	P	D
Template Known Secondary structure									S			B	B		S	S	S	B												T	T												B							T	T	T					T	T												S			G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H
Query Conservation
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	L	H	Y	R	L	K	L	L	K	D	M	G	C	N	A	I	R	T	S	H	N	P	F	S	P	A	F	Y	N	L	C	D	T	M	G	I	M	V	L	N	E	G	L	D	G	W	N	Q	P	K	A	A	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	N	Y	F	D	E	W	W
Template Known Secondary structure														T	T							T	T	S														T									S	S	S	S	S		S	S	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.																.	380	.	.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	D	M	T	D	F	I	K	R	D	R	N	H	P	S	I	I	M	W	S	I	G	N	E	V	T	G	A	T	P	.	.	.	E	I	Q	H	N	L	V	S	L	F	H	Q	L	D	P	D	R	P	V	T	Q	G	G	T	D	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	D	I	I	G	F	N	G	N
Template Known Secondary structure													T	T		T	T									S		S	S				.	.	.															T	T	S						T					.	.	.	.	.	.	.	.	.			S						G	G
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.				.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.										.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	E	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	E	H	F	H	K	N	Y	P	T	L	C	A	I	A	T	E	V	P	H	T	Y	Q	T	R	G	V	Y	R	S	Q	T	Q	W	R	R	R	D	F	P	A	P	W	E	F	K	H	R	V	F	P	I	P	D	L	T	E	K	E	C	F
Template Known Secondary structure		G	G	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T	S					S	S			B	B				T	T				S	S								S			T	T			G	G	G	S						S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		468	.	470	.	.														.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.
						513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																																			.
Template Conservation																																																								.
Template Sequence		P	E	E	S	D	Y	P	Y	Y	Q	S	S	Y	D	N	A	S	V	R	I	S	A	R	K	S	W	Q	R	T	C	S	F	P	W	L	M	G	E	F	R	W	G	S	F	D	Y	L	G	E	A	E	W	P	Q	.	R	C	G	N	F	G	I	I	D	I	A	A	I	P	K	D	A	Y	F	L	Y	Q	S	L	W
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G		T	T				S	S	S				S	S														T	T							B		S	B			B	B	S	S		T	T		.	S	B		S			S	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																																																								.
Template SS confidence
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.		.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
		589	590
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	D
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		622	.