Job Description P05804 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 539 % Identity 24% Template c3fn9B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative beta-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of putative beta-galactosidase from bacteroides2 fragilis Resolution 2.70 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.		.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.
Query SS confidence																																																									.
Query Sequence		P	T	R	E	I	K	K	L	D	G	L	W	A	F	S	L	D	R	E	N	C	G	I	D	Q	R	W	W	E	S	A	L	Q	E	S	R	A	I	A	V	P	G	S	F	N	D	Q	F	A	D	A	D	I	R	N	.	Y	A	G	N	V	W	Y	Q	R	E	V	F	I	P	K	G	W	A	G	Q	R	I	V	L
Query Conservation																																																									.
Alig confidence																						.																																			.
Template Conservation																						.
Template Sequence		L	A	R	Q	V	T	A	F	N	T	G	W	Q	F	K	K	G	P	F	A	.	T	D	P	M	R	A	A	S	Q	W	D	G	K	W	E	T	V	E	I	P	H	T	W	N	A	M	D	M	Q	V	Q	S	G	S	F	Y	E	G	A	G	Y	Y	R	K	T	Q	F	F	P	H	D	L	E	G	K	R	V	F	L
Template Known Secondary structure				S							S	S										.	S	S									T	S							S	S			S		T	T	T	T	T	S	S	S	S					S												G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																						.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.		.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	D	A	V	T	H	Y	G	K	V	W	V	N	N	Q	E	V	M	E	H	Q	G	G	Y	T	P	F	E	A	D	V	T	P	Y	V	I	A	G	K	S	V	R	I	T	V	C	V	N	N	E	L	N	W	Q	T	I	P	P	G	M	V	I	T	D	E	N	G	K	K	K	Q	S	Y	F	H	D	F	F	N
Query Conservation
Alig confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	F	E	G	V	G	A	C	A	E	V	Y	V	N	G	K	L	A	G	T	H	K	G	G	Y	S	A	F	A	C	E	I	G	T	A	L	K	L	G	A	E	N	E	I	I	V	K	A	D	N	K	A	R	P	D	V	I	P	V	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	F	G	V
Template Known Secondary structure				S			B	S							S	S	S								T	T	S							G	G	G			T	T														B	T	T	B	S	S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.															.	.	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.								.	.	.	190	.		.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210							.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	G	I	H	R	S	V	M	L	Y	T	T	P	N	T	W	V	D	D	.	.	.	.	.	.	.	I	T	V	V	T	.	H	V	A	Q	D	C	N	H	A	S	V	D	W	Q	V	V	A	N	G	.	.	.	.	.	.	D	V	S	V	E	L	R	D	A	D	Q	Q	V	V	A	T	G	Q	.	.	.	.
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	G	G	I	Y	R	P	V	W	L	I	V	T	E	Q	N	N	I	T	V	T	D	C	A	S	P	G	V	Y	I	T	Q	K	D	V	S	K	K	S	A	D	I	T	V	K	V	K	L	D	N	A	G	L	Q	P	A	A	V	T	L	E	N	T	I	Y	T	Q	E	G	Q	K	V	G	T	H	S	R	S	F	D
Template Known Secondary structure				B			S									S					S		S	T	T			S							S		S	S	S														S	S	S													T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
									229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.		.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																	.													.																						.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																	.													.																						.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	G	T	S	G	T	L	Q	V	V	N	P	H	L	W	Q	P	.	G	E	G	Y	L	Y	E	L	C	V	T	A	.	K	S	Q	T	E	C	D	I	Y	P	L	R	V	G	I	R	S	V	A	V	K	.	G	E	Q	F	L	I	N	H	K	P	F	Y	F	T	G	F	G	R	H	E	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																	.													.																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																	.													.																						.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	P	Q	G	T	Q	T	Y	L	S	T	F	K	L	K	N	P	H	L	W	Q	G	R	K	D	P	Y	L	Y	K	V	V	C	R	L	M	A	D	G	K	V	I	D	E	V	V	Q	P	L	G	V	R	K	Y	E	I	V	A	G	K	G	F	F	L	N	G	E	K	Y	S	M	Y	G	V	T	R	H	Q	D
Template Known Secondary structure				S	S	S												S						G	G	G														T	T																			T	T	T					T	T												S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	L	R	G	K	G	F	D	N	V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	W	G	L	G	S	A	L	K	N	E	H	H	D	F	D	L	A	A	I	M	D	V	G	A	T	T	V	R	F	A	H	Y	Q	Q	S	D	Y	L	Y	S	R	C	D	T	L	G	L	I	I	W	A	E	I	P	C	V	N	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		B	T	T	T	B	T																		T		S					T	T	S														T										B	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.																																																																					.	.
Template Conservation		.	.																																																																					.	.
Template Sequence		.	.	T	G	Y	E	T	E	N	A	Q	S	Q	L	R	E	L	I	R	Q	S	F	N	H	P	S	I	Y	V	W	G	L	H	N	E	V	Y	Q	P	H	E	Y	T	A	A	L	T	R	S	L	H	D	L	A	K	T	E	D	P	D	R	Y	T	V	S	V	N	G	Y	G	.	.	H	M	D	H	P	V	N	L
Template Known Secondary structure		.	.		S	S																T	T	T		T	T									S			S	S																				T	T	S							S	S	S	.	.		S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																																					.	.
Template SS confidence
				387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.			.	.	.	.	.	460	.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.									.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.																	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.																	.	.	.
Template Sequence		N	A	D	I	Q	G	M	N	R	Y	F	G	W	Y	E	.	.	K	K	I	Q	D	I	K	P	W	V	E	Q	L	E	K	D	.	.	.	Y	P	Y	Q	K	L	M	L	T	E	Y	G	A	D	A	N	L	A	H	Q	T	E	Y	L	G	D	A	L	N	W	G	K	P	F	Y	P	E	T	F	Q	T	K	T	H
Template Known Secondary structure			S	S								B	T	T	T	B	.	.	S		G	G	G												.	.	.		T	T	S												B	T	T				S				S	S			T	T	S	S			B
Template Predicted Secondary structure																	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.			.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.				.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
		531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.			.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.		.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure																														.	.																		.
Query SS confidence																														.	.																		.
Query Sequence		D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	.	.	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	R	.	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G
Query Conservation																														.	.																		.
Alig confidence																														.	.																		.
Template Conservation
Template Sequence		E	Y	Q	W	S	I	I	K	D	H	P	Y	I	I	A	S	Y	L	W	N	M	F	D	F	A	V	P	M	W	T	R	G	G	V	P	A	R	N	M	K	G	L	I	T	F	D	R	K	T	K	K	D	S	Y	F	W	Y	K	A	N	W	S	E
Template Known Secondary structure										T		T	T	S						S		S	B										T	T									S	B		T	T	S			B													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600