Job Description P05804 Confidence 99.50% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 105 Aligned Residues 262 % Identity 20% Template c3fiyA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of bglb Resolution 1.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		H	R	Y	E	Q	D	L	D	L	M	R	Q	L	G	L	K	T	Y	R	F	S	I	A	W	A	R	I	Q	P	D	S	S	R	Q	I	N	Q	R	G	L	D	F	Y	R	R	L	V	E	G	L	H	K	R	D	I	L	P	M	A	T	L	Y	H	W	D	L	P	Q	W	V	E	D	E	G	G	W	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		S														S	T	T																					T	T									S	S			B						T	T	G	G	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	R	E	S	A	S	R	F	A	E	Y	T	H	A	L	V	A	A	L	G	D	Q	.	.	I	P	L	W	V	T	H	N	E	P	M	V	T	V	W	A	G	Y	H	M	G	L	F	A	P	G	L	K	D	P	T	L	G	G	R	V	A	H	H	L	L	L	S	H	G	Q	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	T																		G	G	G	.	.		S																	T	S		S	S	T	T					G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
										172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.			.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Q	A	F	R	A	L	S	P	A	G	S	Q	M	G	I	T	L	N	F	N	T	I	Y	P	V	S	A	E	P	A	D	V	E	A	A	R	R	M	H	S	F	Q	N	E	L	F	L	E	P	L	I	R	G	Q	Y	N	Q	A	T	L	M	A	Y	P	N	L	P	E	F	I	A	P	E	D	M	Q	T	I	S
Template Known Secondary structure											T	T															S	S	S																		T	T							S	S									S	T	T	G	G	G	G			T	T						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
				460	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		.	.	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	.	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T
Query Conservation		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation
Template Sequence		A	P	I	D	F	L	G	V	N	Y	Y	N	P	M	R	V	K	S	S	P	Q	P	P	G	I	E	V	V	Q	V	E	S	P	V	T	A	M	G	W	E	I	A	P	E	G	L	Y	D	L	L	M	G	I	T	R	T	Y	G	K	L	P	I	Y	I	T	E	N	G	A	A	F	D	D	Q	P	D	Q	S	G	Q
Template Known Secondary structure		S			S																S	S	T	T	S								S	S	B		T	T			B			T																S																		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		519	520	.	.	.	.	.	.			.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.						.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		D	M	W	S	E	E	Y	Q	.	.	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	.	.	.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R
Query Conservation										.	.																																														.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.																												.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.
Template Sequence		V	N	D	P	Q	R	V	G	Y	F	Q	G	H	I	G	A	A	R	R	A	L	A	D	G	V	D	L	R	G	Y	Y	A	W	S	L	L	D	.	.	.	N	F	E	W	A	E	G	Y	S	K	R	F	G	I	I	Y	V	D	F	E	T	Q	Q	R	T	L	K	Q	S	A	Q	W	Y	R	D	V
Template Known Secondary structure		B																						T	T											S	B		.	.	.				G	G	G	G	G	G					S					T	T	T						B
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.				.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions