Job Description P05804 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 532 % Identity 28% Template c3cmgA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative beta-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of putative beta-galactosidase from bacteroides2 fragilis Resolution 1.90 Å

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		R	E	I	K	K	L	D	G	L	W	A	F	S	L	D	R	E	N	C	G	I	D	Q	R	W	W	E	S	A	L	Q	E	S	R	A	I	A	V	P	G	S	F	N	D	Q	F	A	D	A	.	D	I	R	N	Y	A	G	N	V	W	Y	Q	R	E	V	F	I	P	K	G	W	A	G	Q	R	I	V	L	R	F
Query Conservation																																																			.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Q	D	I	L	L	N	N	N	W	N	F	R	F	S	H	Q	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	T	R	R	V	D	L	P	H	T	W	N	A	Q	D	A	L	A	G	K	I	D	Y	K	R	G	I	G	N	Y	E	K	A	L	Y	I	R	P	E	W	K	G	K	R	L	F	L	R	F
Template Known Secondary structure									S							T	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S			T	T	T	T	T	G	G	G	T		T	T				S												G	G	G	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.												.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	V	T	H	Y	G	K	V	W	V	N	N	Q	E	V	M	E	H	Q	G	G	Y	T	P	F	E	A	D	V	T	P	Y	V	I	A	G	K	S	V	R	I	T	V	C	V	N	N	E	L	N	W	Q	T	I	P	P	G	M	V	I	T	D	E	N	G	K	K	K	Q	S	Y	F	H	D	F	F	N	Y	A
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	V	N	S	I	A	D	V	F	I	N	R	K	H	I	G	E	H	R	G	G	Y	G	A	F	I	F	E	I	T	D	L	V	K	Y	G	E	K	N	S	V	L	V	R	A	N	N	G	E	Q	L	D	I	M	P	L	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	N	F	Y	G
Template Known Secondary structure		S			B	S							T	T									S	S	S							T	T	T	S		T	T	S														S	S	S	S		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.																.	.	.	.	170	.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.								.	.	.	190	.		.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210				.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	H	R	S	V	M	L	Y	T	T	P	N	T	W	V	D	D	.	.	.	.	.	.	.	I	T	V	V	T	.	H	V	A	Q	D	C	N	H	A	S	V	D	W	Q	V	V	A	N	G	.	.	.	D	V	S	V	E	L	R	D	A	D	Q	Q	V	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.						.																				.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	Y	R	D	V	H	L	L	I	T	D	E	T	C	I	S	P	L	D	Y	A	S	P	G	V	Y	L	V	Q	E	V	V	S	P	Q	E	A	K	V	C	A	K	V	N	L	S	N	R	A	A	D	G	T	A	E	L	Q	V	L	V	T	D	G	T	K	V	I	C	K	E	S	R	N	V	S	L	K	Q	G
Template Known Secondary structure		B			S									S					S		S	T	T	S		S										S	S														S	S	S												T	T														T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																					.													.																								.
Query SS confidence																					.													.																								.
Query Sequence		T	G	Q	G	T	S	G	T	L	Q	V	V	N	P	H	L	W	Q	P	.	G	E	G	Y	L	Y	E	L	C	V	T	A	.	K	S	Q	T	E	C	D	I	Y	P	L	R	V	G	I	R	S	V	A	V	K	G	E	.	Q	F	L	I	N	H	K	P	F	Y	F	T	G	F	G	R	H	E	D	A	D	L	R
Query Conservation																					.													.																								.
Alig confidence																					.													.																								.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	I	L	E	Q	L	P	L	L	I	Q	K	P	R	L	W	N	G	C	E	D	P	F	M	Y	Q	V	S	I	S	L	H	K	D	G	K	Q	I	D	S	V	T	Q	P	L	G	L	R	Y	Y	H	T	D	P	D	K	G	F	F	L	N	G	K	H	L	P	L	H	G	V	C	R	H	Q	D	R	A	E	V
Template Known Secondary structure														S				B		G	G	G		B												T	T																			T	T	T					T	T												S		B	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	G	F	D	N	V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G
Query Conservation
Alig confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	A	L	R	P	Q	H	H	E	E	D	V	A	L	M	R	E	M	G	V	N	A	I	R	L	A	H	Y	P	Q	A	T	Y	M	Y	D	L	M	D	K	H	G	I	V	T	W	A	E	I	P	F	V	G	P	G	G	Y	A	D	K	G	F	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A
Template Known Secondary structure		B	T																	T	T							T	T	S														T										B			T	T	S	S	S		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.														.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V
Query Conservation
Alig confidence																																																																				.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		S	F	R	E	N	G	K	Q	Q	L	I	E	L	I	R	Q	H	Y	N	H	P	S	I	C	F	W	G	L	F	N	E	L	K	E	V	G	D	N	P	V	E	Y	V	K	E	L	N	A	L	A	K	Q	E	D	P	T	R	P	T	T	S	A	S	N	Q	D	.	.	.	.	.	G	N	L	N	F	I	T	E	N
Template Known Secondary structure																			T	T		T	T									S			S	S	S	S																		T	T	S										.	.	.	.	.	S	G	G	G	G	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.						.	.	.	.	.	470	.	.	.
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520								.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	.	.	.	.	.	.	.	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.																	.	.	.
Template Sequence		I	A	W	N	R	Y	D	G	W	Y	G	.	.	S	T	P	K	T	L	A	T	F	L	D	R	T	H	K	K	.	.	.	H	P	E	L	R	I	G	I	S	E	Y	G	A	G	A	S	I	Y	H	Q	Q	D	S	L	K	Q	P	S	A	S	G	W	W	H	P	E	N	W	Q	T	Y	Y	H	M	E	N	W	K
Template Known Secondary structure								T	T	T	S	S	.	.	S		T														.	.	.		T	T													B	T	T				S	S						T	T	S	S			B
Template Predicted Secondary structure													.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.			.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500				.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560			.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.		.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure																											.	.																	.
Query SS confidence																											.	.																	.
Query Sequence		V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	.	.	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	R	K	.	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G
Query Conservation																											.	.																	.
Alig confidence																											.	.																	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	A	E	R	P	F	V	W	G	T	F	V	W	N	M	F	D	F	G	A	A	H	R	T	E	G	D	R	P	G	I	N	D	K	G	L	V	T	F	D	R	K	V	R	K	D	A	F	Y	F	Y	K	A	N	W	N	K
Template Known Secondary structure					T		T	T							S		S	B					T	T				T	T	S	T	T						S	B		T	T	S			B													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.