Job Description P05804 Confidence 99.30% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 127 Aligned Residues 262 % Identity 23% Template c3ai0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of beta-glucosidase from termite neotermes2 koshunensis in complex with para-nitrophenyl-beta-d-glucopyranoside Resolution 1.40 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.						330	.	.	.	.	.														.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350						.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	.	.	.	.	.	H	Y	P	Y	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	.	.	.	.	.	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F
Query Conservation																							.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		H	L	Y	K	E	D	V	K	I	L	K	E	L	G	A	Q	V	Y	R	F	S	I	S	W	A	R	V	L	P	E	G	H	D	N	I	V	N	Q	D	G	I	D	Y	Y	N	N	L	I	N	E	L	L	A	N	G	I	E	P	M	V	T	M	Y	H	W	D	L	P	Q	A	L	Q	D	L	G	G	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		S												S	T	T	S	S	T	T																				T	T									S	S			B					T	T	T	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	N	L	V	L	A	K	Y	S	E	N	Y	A	R	V	L	F	K	N	F	G	D	R	.	.	V	K	L	W	L	T	F	N	D	P	L	T	F	M	D	G	Y	A	S	E	I	G	M	A	P	S	I	N	T	P	G	I	G	D	Y	L	A	A	H	T	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	T																		T	T	T	.	.														G	G	G	G	B		T	T	S	S	T	T			B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
															161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.			.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.										.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	E	A	T	R	K	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	H	A	H	A	R	I	Y	H	L	Y	D	Q	E	F	R	A	E	Q	G	G	K	V	G	I	S	L	N	I	N	W	C	E	P	A	T	N	S	A	E	D	R	A	S	C	E	N	Y	Q	Q	F	N	L	G	L	Y	A	H	P	I	F	T	E	E	G	D	Y	P	A	V	L	K	D	R	V	S	R	N	S	A
Template Known Secondary structure																T																				S	S	S	S															T									S	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
														449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	G	Y	T	D	S	R	L	P	Q	F	T	A	E	E	V	E	Y	I	R	G	T	H	D	F	L	G	I	N	F	Y	T	A	L	L	G	K	S	G	V	E	G	Y	E	P	S	R	Y	R	D	S	G	V	I	L	T	Q	D	A	A	W	P	I	S	A	S	S	W	L	K	V	V	P	W	G	F	R	K	E
Template Known Secondary structure			T	T		S	S		S	S												T	T			S														S	S			S		S	S							T							T	T	S				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.
Query SS confidence																																																									.
Query Sequence		L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	.	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V
Query Conservation																																																									.
Alig confidence											.	.	.													.	.	.	.																												.															.	.	.
Template Conservation											.	.	.													.	.	.	.																																											.	.	.
Template Sequence		L	N	W	I	K	N	E	Y	N	.	.	.	N	P	P	V	F	I	T	E	N	G	F	S	.	.	.	.	D	Y	G	G	L	N	D	T	G	R	V	H	Y	Y	T	E	H	L	K	E	M	L	K	A	I	H	E	D	G	V	N	V	I	G	Y	T	A	W	S	L	M	D	.	.	.	N	F	E	W	L	R	G
Template Known Secondary structure										T	.	.	.	S												.	.	.	.	B	S	S		S																						T	T												S	B		.	.	.				G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.													.	.	.	.																																											.	.	.
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.				.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.					.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.				.	450	.	.	.	.	.
		564	.	.	.	.	.	570	.								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	N	K	K	G	I	F	.	.	.	.	.	.	.	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G	M	N	F	G	E	K	P	Q	Q
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	E	K	F	G	I	Y	A	V	D	F	E	D	P	A	R	P	R	I	P	K	E	S	A	K	V	L	A	E	I	M	N	T	R	K	I	P	E	R	F	R	D
Template Known Secondary structure		T	S	S	B			S					T	T	S	T	T																			T	B			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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