Job Description P05804 Confidence 99.23% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 138 Aligned Residues 262 % Identity 24% Template c3ahyD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of beta-glucosidase 2 from fungus trichoderma reesei2 in complex with tris Resolution 1.63 Å

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		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330						.	.	.	.															.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	.	.	.	.	.	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P
Query Conservation																						.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	E	D	I	A	L	L	K	S	L	G	A	K	S	Y	R	F	S	I	S	W	S	R	I	I	P	E	G	G	R	G	D	A	V	N	Q	A	G	I	D	H	Y	V	K	F	V	D	D	L	L	D	A	G	I	T	P	F	I	T	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	W	D	L	P	E	G	L
Template Known Secondary structure												T	T														S	S	S		S	T	T	S																				T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			B
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.											.	120	.	.	.	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.
Template Sequence		H	Q	R	Y	G	G	L	L	N	R	T	E	F	P	L	D	F	E	N	Y	A	R	V	M	F	R	A	L	P	K	.	.	.	V	R	N	W	I	T	F	N	E	P	L	C	S	A	I	P	G	Y	G	S	G	T	F	A	P	G	R	Q	S	T	S	E	P	W	T	V	G	H	N	I	L	V	A	H	G	R	A
Template Known Secondary structure							G	G	G		T	T																		T	T	.	.	.																			T	S		S	S	T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.				.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
												435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	K	A	Y	R	D	D	F	K	P	A	S	G	D	G	Q	I	G	I	V	L	N	G	D	F	T	Y	P	W	D	A	A	D	P	A	D	K	E	A	A	E	R	R	L	E	F	F	T	A	W	F	A	D	P	I	Y	L	G	D	Y	P	A	S	M	R	K	Q	L	G	D	R	L	P	T	F	T	P	E	E	R
Template Known Secondary structure									T	S		S	S	S	S															S	S	T	T																T										S	S										G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
								460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	V	H	G	S	N	D	F	Y	G	M	N	H	Y	T	S	N	Y	I	R	H	R	S	S	P	A	S	A	D	D	T	V	G	N	V	D	V	L	F	T	N	K	Q	G	N	C	I	G	P	E	T	Q	S	P	W	L	R	P	C	A	A	G	F	R	D	F	L	V	W	I	S	K	R	Y	G	Y	P	P	I
Template Known Secondary structure					T	T			S	S															S	S				T	T			S	S	S					S	B		T	T			B	S					S	S	T	T																				T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.					.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.			.	.	.	.																																		.
Query SS confidence																																									.			.	.	.	.																																		.
Query Sequence		I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	.	V	S	.	.	.	.	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	.
Query Conservation																																									.			.	.	.	.																																		.
Alig confidence																																									.			.	.	.	.													.	.	.																			.
Template Conservation																																																												.	.	.
Template Sequence		Y	V	T	E	N	G	T	S	I	K	G	E	S	D	L	P	K	E	K	I	L	E	D	D	F	R	V	K	Y	Y	N	E	Y	I	R	A	M	V	T	A	V	E	L	D	G	V	N	V	K	G	Y	F	A	W	S	L	M	D	.	.	.	N	F	E	W	A	D	G	Y	V	T	R	F	G	V	T	Y	V	D	Y
Template Known Secondary structure											T	T	G	G	G	S						T																						T	T												S	S		.	.	.				G	G	G	T	T	S	S				S					T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.				.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
							575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	G	Q	K	R	F	P	K	K	S	A	K	S	L	K	P	L	F
Template Known Secondary structure		T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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