Job Description P05804 Confidence 99.22% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 140 Aligned Residues 258 % Identity 16% Template c2zoxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cytosolic beta-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic2 beta-glucosidase Resolution 1.90 Å

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		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		W	E	E	D	L	K	C	I	K	Q	L	G	L	T	H	Y	R	F	S	L	S	W	S	R	L	L	P	D	G	T	T	G	F	I	N	Q	K	G	I	D	Y	Y	N	K	I	I	D	D	L	L	K	N	G	V	T	P	I	V	T	L	Y	H	F	D	L	P	Q	T	L	E	D	Q	G	G	W	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T		S												S	T	T	S	S	T	T	S																			T	T									S	S			B						T	T	G	G	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																								.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	L	S	E	A	I	I	E	S	F	D	K	Y	A	Q	F	C	F	S	T	F	G	D	R	.	.	V	K	Q	W	I	T	I	N	Q	A	N	V	L	S	V	M	S	Y	D	L	G	M	F	P	P	G	I	P	H	F	G	T	G	G	Y	Q	A	A	H	N	L	I	K	A	H	A	R	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	G	S	T																		T	T	T	.	.								T	T										T	S			S	T	T					T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
									134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.			.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	H	S	Y	D	S	L	F	R	K	K	Q	K	G	M	V	S	L	S	L	F	A	V	W	L	E	P	A	D	P	N	S	V	S	D	Q	E	A	A	K	R	A	I	T	F	H	L	D	L	F	A	K	P	I	F	I	D	G	D	Y	P	E	V	V	K	S	Q	I	A	S	M	S	Q	K	Q	G	Y	P	S	S
Template Known Secondary structure									T																				S	S	T	T																T									T	T	S	S																T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
																		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	P	E	F	T	E	E	E	K	K	M	I	K	G	T	A	D	F	F	A	V	Q	Y	Y	T	T	R	L	I	K	Y	Q	E	N	K	K	G	E	L	G	I	L	Q	D	A	E	I	E	F	F	P	D	P	S	W	K	N	V	D	W	I	Y	V	V	P	W	G	V	C	K	L	L	K	Y	I	K	D	T	Y
Template Known Secondary structure		S	S												T	T			S	S																	T	T				S						T							T	T	S				T	T					T														T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		497	.	.		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.		.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																																								.
Query SS confidence					.																																								.
Query Sequence		H	Q	P	.	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	.	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D
Query Conservation					.																																								.
Alig confidence					.														.	.																									.																.	.	.
Template Conservation																			.	.																																									.	.	.
Template Sequence		N	N	P	V	I	Y	I	T	E	N	G	F	P	Q	S	D	P	.	.	A	P	L	D	D	T	Q	R	W	E	Y	F	R	Q	T	F	Q	E	L	F	K	A	I	Q	L	D	K	V	N	L	Q	V	Y	C	A	W	S	L	L	D	.	.	.	N	F	E	W	N	Q	G	Y	S	S	R	F	G	L	F	H	V	D
Template Known Secondary structure		T	S														S	S	.	.			S	S																					T	S												S	B		.	.	.				G	G	G	G	G	G					S
Template Predicted Secondary structure																			.	.																																									.	.	.
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.			.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.				.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
									575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	E	D	P	A	R	P	R	V	P	Y	T	S	A	K	E	Y	A	K	I
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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