Job Description P05804 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 538 % Identity 17% Template c2vzvB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:exo-beta-d-glucosaminidase; PDBTitle: substrate complex of amycolatopsis orientalis exo-2 chitosanase csxa e541a with chitosan Resolution 2.70 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.		.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.																.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	T	P	T	R	E	I	K	K	L	D	G	L	W	A	F	S	L	D	.	R	E	N	C	G	I	D	Q	R	W	W	E	S	A	L	Q	E	S	R	A	I	A	V	P	G	S	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	F	A	D	A	D	I	R	N	Y	A	G	N	V	W
Query Conservation																						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.							.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.
Template Sequence		V	G	A	A	A	G	N	A	T	P	I	P	G	.	Y	V	I	Q	S	S	A	Q	V	S	D	D	S	A	V	S	K	P	G	F	P	T	S	G	W	Y	P	V	S	S	R	S	T	V	Y	A	G	L	L	Q	N	G	K	Y	A	D	P	F	Y	S	T	N	M	Q	N	V	P	A	A	Q	F	S	V	P	W	W
Template Known Secondary structure						T	T								.						G	G	G		S		G	G	G	T	T	S	T	T				T	T						S	S										T	T		S			T	T	S	T	T	G	G	G	G	S		S	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.				.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.
Query Sequence		Y	Q	R	E	V	F	I	P	K	G	W	A	G	Q	R	I	V	L	R	F	D	A	V	T	H	Y	G	K	V	W	V	N	N	Q	E	V	M	E	.	.	.	H	Q	G	G	Y	T	P	F	E	A	D	V	T	P	Y	V	I	A	G	K	S	V	R	I	T	V	C	V	N	N	E	L	N	W	Q	T	I	P	P
Query Conservation																																								.	.	.
Alig confidence											.	.																												.	.	.																				.
Template Conservation											.	.																																																		.
Template Sequence		Y	R	T	D	L	N	V	D	D	.	.	T	S	S	R	T	Y	L	D	F	S	G	V	L	S	K	A	D	V	W	V	N	G	T	K	V	A	T	K	D	Q	V	N	G	A	Y	T	R	H	D	L	D	I	T	A	Q	V	H	T	G	.	V	N	S	V	A	F	K	V	Y	P	N	D	P	N	R	D	L	S	M
Template Known Secondary structure									S		.	.	T	T	S											S	B						T	T						T	T	T	S	B	S	T	T								T	T	T			S		.													T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.																																																		.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.			.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.					.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.
Query Sequence		G	M	V	I	T	D	E	N	G	K	K	K	Q	S	Y	F	H	D	F	F	N	Y	A	G	I	H	R	S	V	M	L	Y	T	T	P	N	T	W	V	D	D	I	T	V	V	T	H	V	A	Q	D	.	.	.	.	C	N	H	A	S	V	D	W	Q	V	V	A	N	G	D	V	S	V	E	L	R	D	A	D	Q
Query Conservation																																																					.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	W	I	D	W	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	P	D	Q	N	M	G	I	V	R	D	V	L	V	R	R	S	G	A	V	A	L	R	S	A	H	V	I	Q	K	L	N	S	A	L	D	H	A	D	L	T	V	K	A	D	V	R	N	D	S	A	N	A	V	Q	T	T	V	A	G	T	V	A
Template Known Secondary structure				T	T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T					S								S	S														T	T	S	S														S	S	S											T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		200	.	.	.	.	.	.										.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
		222	.	.	.	.	.	.											.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.				.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.						.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.													.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.													.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	V	V	A	T	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	S	G	T	L	Q	V	V	N	P	H	L	W	Q	P	.	.	.	G	E	G	Y	L	Y	E	L	C	V	T	A	.	K	S	Q	T	E	C	D	I	Y	P	L	R	V	G	I	R	S	V	A	V	K	.	.	.	.	.	G	E	Q	F	L
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.													.																						.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.													.																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	K	P	I	S	Q	T	V	S	L	A	A	K	E	R	K	T	V	T	F	P	L	V	G	L	D	R	P	N	V	W	W	P	A	G	M	G	G	Q	H	R	Y	D	L	D	L	T	A	S	V	G	G	T	P	S	D	A	A	K	S	K	F	G	V	R	D	V	K	A	T	L	N	S	S	G	G	R	Q	Y	S
Template Known Secondary structure		T											T	T														S							T	T	S	S														T	T																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.				.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.
Query Sequence		I	N	H	K	P	F	Y	F	T	G	F	G	R	H	E	D	A	D	L	R	G	K	G	F	D	N	V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	.	.	.	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L
Query Conservation																																																																				.	.	.
Alig confidence																					.	.	.																																													.	.	.
Template Conservation																					.	.	.
Template Sequence		V	N	G	K	P	L	L	I	R	G	G	G	Y	T	P	D	L	F	L	.	.	.	R	W	N	E	T	A	A	A	D	K	L	K	Y	V	L	N	L	G	L	N	T	V	R	L	E	G	H	I	E	P	D	E	F	F	D	I	A	D	D	L	G	V	L	T	M	P	G	W	E	C	C	D	K	W	E	G	Q	V
Template Known Secondary structure			T	T														T	T		.	.	.																	T	T								S															T									S	S	S	G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.				370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.
Template Sequence		N	G	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	E	P	W	V	E	S	D	Y	P	I	A	K	A	S	M	F	S	E	A	E	R	L	R	D	H	P	S	V	I	S	F	H	I	G	S	D	F	A	P	D	.	.	.	.	R	R	I	E	Q	G	Y	L	D	A	M	K	A	A	D	F	L	L
Template Known Secondary structure			T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S					T	T																	T	T		T	T	B					S		S	S	S				.	.	.	.														T	T			S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.
Template SS confidence
		428	.	430	.													.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.					.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.					450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.		.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.																																																												.
Query SS confidence												.	.	.	.																																																												.
Query Sequence		P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	.	.	.	.	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	.	T	L	A	G	L	H
Query Conservation												.	.	.	.																																																												.
Alig confidence												.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	I	P	A	A	S	A	R	P	S	P	I	T	G	A	S	G	M	K	M	N	G	P	Y	D	Y	V	P	P	V	Y	W	Y	D	K	S	Q	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	G	A	W	S	F	N	S	A	T	S	A	G	V	D	I	P	T	M	D
Template Known Secondary structure					S		S	S	S			B	T	T	T	B											S				G	G	G	G	G			S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	S									S	B
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
		515	.	.	.	.	520	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Query Sequence		S	M	Y	T	D	M	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	K	R	M	M	S	A	S	E	L	D	T	M	W	K	N	P	S	A	K	Q	Y	H	R	S	S	S	D	T	F	G	N	L	K	L	F	G	D	A	L	T	K	R	Y	G	A	S	A	N	L	N	D	F	V	R	K	A	Q	L	S	Q	Y	E	N	V	R	A	E	F	E	S	H	S	R	N	Y	T	D	S
Template Known Secondary structure							S												T	T	S	B		T	T	S		S	S	G	G	G	S	B																	S																											T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		553	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
			541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G	M	N	F	G	E	K	P	Q	Q	G	G
Query Conservation		.
Alig confidence		.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	N	P	S	T	G	L	I	Y	W	M	L	N	S	P	W	T	S	L	H	W	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	D	A	Y	M	D	Q	N	G	A	Y	Y	G	A	K	K	A	N	E	P	L	H	I	Q	Y	S	H	D	N	R	S
Template Known Secondary structure		S	S								S		S			S	S	S		S	B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	S	B		T	T			B											T		S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		633	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.									.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.