Job Description P05804 Confidence 99.27% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 136 Aligned Residues 263 % Identity 23% Template c2rgmA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase Resolution 1.55 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		H	R	Y	K	E	D	V	N	L	M	K	S	L	N	F	D	A	Y	R	F	S	I	S	W	S	R	I	F	P	D	G	E	G	R	V	N	Q	E	G	V	A	Y	Y	N	N	L	I	N	Y	L	L	Q	K	G	I	T	P	Y	V	N	L	Y	H	Y	D	L	P	L	A	L	E	K	K	Y	G	G	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T														S	T	T	S	S	S																				T	T									S	S			B									G	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																									.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	W	L	N	A	K	M	A	D	L	F	T	E	Y	A	D	F	C	F	K	T	F	G	N	R	.	.	V	K	H	W	F	T	F	N	E	P	R	I	V	A	L	L	G	Y	D	Q	G	T	N	P	P	K	R	C	T	K	C	A	A	G	G	N	S	A	T	E	P	Y	I	V	A	H	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T	T																	T	T	T	.	.																			T	S			S	T	T				T	T		T	T				T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
									144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.			.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		427	.	.	430	.	.	.	.										.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	A	E	A	T	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	L	L	S	H	A	A	A	V	A	R	Y	R	T	K	Y	Q	A	A	Q	Q	G	K	V	G	I	V	L	D	F	N	W	Y	E	A	L	S	N	S	T	E	D	Q	A	A	A	Q	R	A	R	D	F	H	I	G	W	Y	L	D	P	L	I	N	G	H	Y	P	Q	I	M	Q	D	L	V	K	D	R	L	P	K
Template Known Secondary structure																	T																				S	S	S	S															T										S	S										G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	T	P	E	Q	A	R	L	V	K	G	S	A	D	Y	I	G	I	N	Q	Y	T	A	S	Y	M	K	G	Q	Q	L	M	Q	Q	T	P	T	S	Y	S	A	D	W	Q	V	T	Y	V	F	A	K	N	G	K	P	I	G	P	Q	A	N	S	N	W	L	Y	I	V	P	W	G	M	Y	G	C	V	N	Y	I	K
Template Known Secondary structure											T	T			S	S																												T									T	T			S	S		B		S	S	T	T		B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		494	.	.	.	.	.		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.			.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure								.																				.	.
Query SS confidence								.																				.	.
Query Sequence		E	K	L	H	Q	P	.	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	.	.	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I
Query Conservation								.																				.	.
Alig confidence								.																				.	.																																				.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.
Template Sequence		Q	K	Y	G	N	P	T	V	V	I	T	E	N	G	M	D	Q	P	A	N	L	S	R	D	Q	Y	L	R	D	T	T	R	V	H	F	Y	R	S	Y	L	T	Q	L	K	K	A	I	D	E	G	A	N	V	A	G	Y	F	A	W	S	L	L	D	.	.	.	N	F	E	W	L	S	G	Y	T	S	K	F	G	I
Template Known Secondary structure				T	T															S	S																													T	T											S	B		.	.	.				G	G	G	G	G	G					S
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.				.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
		571	.	.	.						.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.
Query Sequence		F	T	R	D	.	.	.	.	.	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R
Query Conservation						.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	V	D	F	N	T	L	E	R	H	P	K	A	S	A	Y	W	F	R	D	M
Template Known Secondary structure						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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