Job Description P05804 Confidence 99.28% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 134 Aligned Residues 266 % Identity 22% Template c2jf7B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:strictosidine-o-beta-d-glucosidase; PDBTitle: structure of strictosidine glucosidase Resolution 2.48 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		H	M	Y	K	E	D	I	K	I	M	K	Q	T	G	L	E	S	Y	R	F	S	I	S	W	S	R	V	L	P	G	G	R	L	A	A	G	V	N	K	D	G	V	K	F	Y	H	D	F	I	D	E	L	L	A	N	G	I	K	P	S	V	T	L	F	H	W	D	L	P	Q	A	L	E	D	E	Y	G	G	.	.
Template Known Secondary structure															T		S												S	T	T	S	S	S	T	T																				T	T									S	S			B									G	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	S	H	R	I	V	D	D	F	C	E	Y	A	E	F	C	F	W	E	F	G	D	K	.	.	I	K	Y	W	T	T	F	N	E	P	H	T	F	A	V	N	G	Y	A	L	G	E	F	A	P	G	R	G	G	K	G	D	E	G	D	P	A	I	E	P	Y	V	V	T	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T	T																	G	G	G	.	.		S																	T	T			S	T	T			S	S	T	T		S	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
											175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.			.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
							422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	I	S	D	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	I	L	L	A	H	K	A	A	V	E	E	Y	R	N	K	F	Q	K	C	Q	E	G	E	I	G	I	V	L	N	S	M	W	M	E	P	L	S	D	V	Q	A	D	I	D	A	Q	K	R	A	L	D	F	M	L	G	W	F	L	E	P	L	T	T	G	D	Y	P	K	S	M	R	E	L	V	K	G	R	L	P
Template Known Secondary structure																		T																				S	S	S	S															T					T					S	S										G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
																461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	F	S	A	D	D	S	E	K	L	K	G	C	Y	D	F	I	G	M	N	Y	Y	T	A	T	Y	V	T	N	A	V	L	S	Y	E	T	D	D	Q	V	T	K	T	F	E	R	N	Q	K	P	I	G	H	A	L	Y	G	G	W	Q	H	V	V	P	W	G	L	Y	K	L	L	V	Y	T	K	E	T	Y	H	V
Template Known Secondary structure												T	T			S																							S						S	B	S	S	S		B	S	S				T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		499		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.					540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure			.																																									.	.	.	.
Query SS confidence			.																																									.	.	.	.
Query Sequence		P	.	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	.	.	.	.	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R
Query Conservation			.																																									.	.	.	.
Alig confidence			.																																									.	.	.	.															.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.
Template Sequence		P	V	L	Y	V	T	E	S	G	M	V	E	E	N	K	T	K	I	L	L	S	E	A	R	R	D	A	E	R	T	D	Y	H	Q	K	H	L	A	S	V	R	D	A	I	D	D	G	V	N	V	K	G	Y	F	V	W	S	F	F	D	.	.	.	N	F	E	W	N	L	G	Y	I	C	R	Y	G	I	I	H	V
Template Known Secondary structure		S															T	T	S						T																						T	T											S	B		.	.	.				G	G	G	T	T	S					S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.				470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
		574						.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.
Query Sequence		D	.	.	.	.	.	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G
Query Conservation			.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	K	S	F	E	R	Y	P	K	E	S	A	I	W	Y	K	N	F	I	A	G
Template Known Secondary structure			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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